通过原位测序在小鼠和猕猴中进行基因编辑的空间图谱分析

Spatial profiling of gene editing by in situ sequencing in mice and macaques

作者信息Sharan Janjuha, Tatjana Haenggi, Thomas C Chamberlain, Tanja Rothgangl, Lucas Kissling, Maria Wilhelm, Nicolas Mathis, Desiree Boeck, Kim Marquart, Eleonora Ioannidi, Woohyun J Moon, Hiromi Muramatsu, Máté Vadovics, Norbert Pardi, Sean C Semple, Ying K Tam, Gerald Schwank
PMID40973816
发布时间2026-05
DOI10.1038/s41551-025-01512-7

摘要

碱基编辑和先导编辑技术能够在分裂和非分裂细胞中精确安装特定的核苷酸编辑,为直接在生物体内纠正致病突变提供了潜力。然而,要充分挖掘其治疗潜力,以高空间分辨率准确测量编辑效率至关重要。本研究使用基于成像的原位测序技术,在原生组织中绘制碱基编辑和先导编辑事件的空间分布图。我们首先在使用内含肽分裂腺嘌呤碱基编辑器或通过腺相关病毒载体递送先导编辑器处理的小鼠大脑中建立并验证了该技术。随后,我们将ISS应用于使用脂质纳米颗粒包裹的mRNA和向导RNA编码的腺嘌呤碱基编辑器处理的小鼠和猕猴肝脏中。在所有肝小叶代谢区均观察到了有效的编辑。此外,在重复给药RNA-LNP的实验中,初次剂量不影响后续剂量的编辑效率和分布。我们的结果表明,ISS可以可视化体内基因编辑事件,并提示使用RNA-LNP递送碱基编辑器可用于治疗多种代谢性肝病。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Qubit 3.0荧光计Life Technologies--
Qubit 3.0荧光计Thermo Fisher Scientific--
马尔文ZetasizerMalvern Panalytical--
冷冻切片机LEICA--
ArcturusXT™激光捕获显微切割系统Thermo Scientific--
蔡司Imager M2倒置荧光显微镜Zeiss--
LabSat微流体装置Lunaphore Technologies SA--
汉密尔顿注射器Hamilton®701 RN
汉密尔顿注射器Hamilton ®small RN, ga 31/15 mm needles
Illumina Miseq测序仪Illumina--