建立视网膜IR损伤模型
模拟青光眼急性期视网膜缺血再灌注损伤,为后续干预和检测提供实验基础。
C57BL/6小鼠麻醉后,将连有生理盐水储液器的微玻璃针插入前房,维持眼压120 mmHg达60分钟,诱导视网膜IR损伤;对照组进行假手术(不升高眼压)。
Targeting Bcl3/NF-κB p50 Pathway for Neuroinflammation Attenuation and RGCs Protection in Retinal Ischemia/Reperfusion Injury
包含体内动物模型、RNA测序、功能学检测、Western blot、电镜等多层级证据,并利用特异性抑制剂JS-6进行功能验证和机制验证。
C57BL/6小鼠视网膜缺血/再灌注模型(IR模型) RBPMS标记的视网膜神经节细胞(RGC) 小鼠视网膜组织(用于RNA测序和蛋白检测)
RSV给药浓度:1 mM,2 µL/眼,玻璃体腔注射 JS-6给药浓度:1、2.5、5 mM,最终选用5 mM IR模型建立参数:前房插针,眼压120 mmHg,维持60分钟 检测时间点:IR后24小时 RNA测序每组样本量:n=3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟青光眼急性期视网膜缺血再灌注损伤,为后续干预和检测提供实验基础。
C57BL/6小鼠麻醉后,将连有生理盐水储液器的微玻璃针插入前房,维持眼压120 mmHg达60分钟,诱导视网膜IR损伤;对照组进行假手术(不升高眼压)。
验证RSV是否能减轻IR损伤导致的RGC死亡和功能损害。
IR前1天玻璃体腔注射RSV(1 mM,2 µL),IR后24小时取材,通过RBPMS免疫荧光染色和H&E染色计数RGC,并通过F-VEP和F-ERG评估视网膜功能。
筛选RSV作用的关键分子通路。
提取IR后24小时视网膜总RNA进行bulk RNA测序,利用DESeq2鉴定DEGs,并进行KEGG和GSEA富集分析,发现Bcl3/NF-κB p50通路可能参与RSV的保护作用。
验证RNA测序结果,确认RSV对Bcl3/NF-κB p50通路和炎症因子的影响。
通过qRT-PCR检测Bcl3、Ccl24、Lrg1、Ltb4r1及炎症因子TNF-α、IL-6、IL-1β的mRNA表达;通过Western blot检测Bcl3、NF-κB p105/p50、TNF-α、IL-6等蛋白水平。
评估RSV是否抑制IR诱导的视网膜神经炎症。
通过Iba1免疫荧光染色观察小胶质细胞形态、数量和分布;通过Western blot检测炎症因子蛋白水平。
明确RSV是否通过抑制焦亡和凋亡保护RGC。
通过Western blot检测焦亡标志物(NLRP3、CASP1/C-CASP1、N-GSDMD、IL-1β)和凋亡标志物(Bax/Bcl2);通过TUNEL染色检测凋亡细胞;通过SEM和TEM观察细胞超微结构。
通过特异性抑制剂JS-6阻断Bcl3/NF-κB p50相互作用,验证该通路在IR损伤中的必要性。
IR前24小时玻璃体腔注射不同浓度JS-6(1、2.5、5 mM),IR后24小时进行RGC计数、视网膜功能检测、炎症因子检测及焦亡/凋亡标志物检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 白藜芦醇 | MedChemExpress | HY-16561 |
| JS-6 | ProbeChem | PC-38199 | |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲液 | -- | -- |
| 角膜麻醉 | 盐酸奥布卡因滴眼液 | Santen Pharmaceutical Co., Ltd. | -- |
| 术后护理 | 妥布霉素地塞米松眼膏 | s.a. Alcon-Couvreur n.v. | -- |
| 免疫荧光 | RBPMS抗体 | Abcam | ab152101 |
| Alexa Fluor 488标记二抗 | Cell Signaling Technology | 4412 | |
| 组织学 | FAS眼球固定液 | Servicebio | G1109 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Scientific | 15596018 |
| RT-PCR | 第一链cDNA合成试剂盒 | Yeasenbio | 11141 |
| SYBR Green qPCR预混液 | Yeasenbio | 11202 | |
| RT-PCR引物 | 引物 | Sangon Biotech | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | New Cell & Molecular Biotech | WB3100 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | New Cell & Molecular Biotech | P002 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | New Cell & Molecular Biotech | P002 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23225 | |
| NF-κB p105/p50抗体 | Abcam | ab32360 | |
| Bcl3抗体 | Santa Cruz | sc-32741 | |
| NLRP3抗体 | Cell Signaling Technology | 15101 | |
| IL-1β抗体 | Abcam | ab254360 | |
| CASP1抗体 | Proteintech | 22915 | |
| N-GSDMD抗体 | Affinity | DF13758 | |
| Bax抗体 | Abclonal | A19684 | |
| Bcl2抗体 | HUABIO | ET1702-53 | |
| TNF-α抗体 | Proteintech | 60291 | |
| IL-6抗体 | Proteintech | 21865 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 811115 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Proteintech | SA00001-1; SA00001-2 | |
| ECL化学发光检测试剂 | NCM Biotech | -- | |
| 免疫组织化学 | Iba1抗体 | WAKO | 019-19741 |
| 免疫荧光 | TSA信号放大试剂盒 | Servicebio | -- |
| TSA-iF555 | -- | -- | |
| TSA-iF488 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 555标记二抗 | Cell Signaling Technology | 4409 | |
| 凋亡检测 | TUNEL试剂盒 | UElandy | T6014 |
| 核染色 | DAPI | Ecotop | EK-5103 |
| 图像分析 | Image J软件 | -- | -- |
| 电子显微镜 | 扫描电子显微镜 | -- | -- |
| 透射电子显微镜 | -- | -- | |
| 组织染色 | 醋酸铀 | -- | -- |
| 组织包埋 | Eponate 12包埋剂 | -- | -- |
| 设备 | 汉密尔顿微量进样器 | -- | -- |
| 32G针头 | -- | -- | |
| 手术显微镜 | BELONA | -- | |
| 加热垫 | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | Nikon | N2-DM4B | |
| 光学显微镜 | -- | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss | AirScan | |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| Bioanalyzer 2100系统 | Agilent | -- | |
| NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- | |
| 溅射镀膜仪 | Oxford Quorum | SC7620 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、周龄、性别;眼压值(120 mmHg)、缺血时间(60分钟);麻醉剂量;对照组处理 阅读提示:Methods: Animals;Animal Model of Retinal IR Injury and Drug Administration |
| 药物处理 | RSV浓度(1 mM)、注射体积(2 µL)、注射时间(IR前24小时);JS-6浓度(1, 2.5, 5 mM)、注射体积(2 µL)、注射时间(IR前24小时);溶剂对照(PBS) 阅读提示:Methods: Animal Model of Retinal IR Injury and Drug Administration |
| RGC计数 | RBPMS抗体稀释度(1:200)、孵育条件(4℃过夜);计数区域(每象限3个非重叠区域,共12个)、起始位置(视盘)、间隔(400 µm) 阅读提示:Methods: Quantification of RGC Soma Density on Flat-Mounted Retinas |
| 视网膜功能检测 | F-VEP和F-ERG记录时间(IR后24小时);电极位置;黑暗适应时间(F-ERG需>12小时);刺激参数 阅读提示:Methods: Flash Visual Evoked Potentials and Flash Electroretinogram |
| mRNA表达检测 | 取材时间(IR后24小时);RNA提取方法(TRIzol);反转录试剂盒(Yeasenbio 11141);qPCR试剂(SYBR Green);内参基因(GAPDH);引物序列 阅读提示:Methods: RNA Extraction and Quantitative Real-Time PCR;Table |
| 蛋白表达检测 | 取材时间(IR后24小时);RIPA裂解液成分(含蛋白酶和磷酸酶抑制剂);蛋白上样量(20 µg);SDS-PAGE条件(120V, 60分钟);抗体稀释度及货号;内参(GAPDH或β-actin) 阅读提示:Methods: Western Blotting |
| 电镜观察 | 取材时间(IR后24小时);戊二醛固定(2.5%, 24小时, 4℃);锇酸后固定(1%, 2小时);切片观察GCL 阅读提示:Methods: Scanning Electron Microscopy and Transmission Electron Microscopy |