建立Wwtr1缺陷小鼠群体
获得WT、Wwtr1+/−和Wwtr1−/−小鼠以研究Wwtr1在眼中的作用。
从Jackson Laboratory购买WT和Wwtr1+/− 129S小鼠,建立繁殖群体,通过PCR基因分型确认后代基因型。
Mice Deficient in TAZ (Wwtr1) Demonstrate Clinical Features of Late-Onset Fuchs' Endothelial Corneal Dystrophy
包含Wwtr1缺陷小鼠模型、细胞形态和功能检测、AFM生物力学分析、两种损伤模型的功能验证,以及人组织表达和遗传关联分析,具有多个独立证据层级。
Wwtr1缺陷小鼠(Wwtr1−/−和Wwtr1+/−) 健康人角膜内皮组织 FECD患者角膜内皮组织 FECD患者队列
小鼠基因型(WT、Wwtr1+/−、Wwtr1−/−)确认 角膜内皮细胞密度(IVCM测量)和CCT(OCT测量) DM弹性模量(AFM测量) 冷冻损伤和PTK模型的伤口愈合评估 人组织中WWTR1/TAZ表达和定位
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得WT、Wwtr1+/−和Wwtr1−/−小鼠以研究Wwtr1在眼中的作用。
从Jackson Laboratory购买WT和Wwtr1+/− 129S小鼠,建立繁殖群体,通过PCR基因分型确认后代基因型。
评估Wwtr1缺陷对眼部结构和功能的影响。
在2、6、12月龄进行眼部检查、眼压测量、泪液分泌测试、角膜感觉测试、裂隙灯检查、OCT测量CCT、IVCM测量ECD。
测定Wwtr1缺陷对DM弹性模量的影响。
使用AFM测量各组小鼠DM的弹性模量。
评估Wwtr1缺陷对CEnC形态和功能蛋白(Na/K-ATP酶和ZO-1)定位的影响。
免疫荧光染色观察CEnC中Na/K-ATP酶和ZO-1的定位。
评估Wwtr1缺陷对CEnC伤口愈合的影响。
使用液氮冷却的钢探针损伤角膜,在损伤后第2天进行Alizarin red和EdU染色评估伤口愈合。
评估Wwtr1缺陷对激光损伤后CEnC伤口愈合的影响。
使用准分子激光造成内皮损伤,在多个时间点进行OCT、IVCM等检查,并在第14天进行Alizarin red染色评估ECD。
检测WWTR1在健康人和FECD患者角膜内皮中的表达水平。
利用已有RNA测序数据比较健康对照、症状前、FECD(伴或不伴TCF4重复扩展)样本中WWTR1 mRNA表达。
筛查FECD患者中WWTR1编码序列变异。
对无TCF4重复扩展的96例FECD患者进行WWTR1 Sanger测序,并在96例对照中比较变异频率。
比较FECD患者与健康对照中TAZ蛋白水平和亚细胞定位。
使用自动Western blot(Jess)定量TAZ蛋白,并使用免疫组化观察TAZ定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| DNA提取和基因分型 | DNeasy血液和组织试剂盒 | QIAGEN Sciences | -- |
| 泪液分泌测试 | 酚红棉线测试 | Zone-Quick | -- |
| 角膜感觉测试 | Cochet-Bonnet触觉测量计 | Luneau Ophthalmologi | -- |
| 眼压测量 | 回弹式眼压计(TonoLab) | Icare | -- |
| 裂隙灯检查 | 手持裂隙灯(Kowa SL15) | Kowa Optimed | -- |
| 眼底检查 | 间接检眼镜(Keeler VANTAGE Plus) | Keeler Inc. | -- |
| 裂隙灯照相 | 裂隙灯(Hagg-Streit BQ 900) | Hagg-Streit | -- |
| OCT成像 | 傅里叶域光学相干断层扫描(RTVue 100) | Optovue, Inc. | -- |
| 体内共聚焦显微镜 | 体内共聚焦显微镜(Heidelberg Retinal Tomography 3 配Rostock角膜模块) | Heidelberg Engineering | -- |
| 原子力显微镜 | 原子力显微镜(MFP-3D-BIO) | Asylum Research | -- |
| AFM悬臂 | PNP-TR-50氮化硅悬臂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| AFM样品制备 | Sylgard 527硅胶 | Dow Corning | -- |
| Thermanox盖玻片 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | 抗ZO-1抗体 | Invitrogen | 61-7300 |
| 抗Na/K-ATP酶抗体 | Invitrogen | MA5-32184 | |
| Alexa Fluor 488/594二抗 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 免疫荧光成像 | Axiovert 200M荧光显微镜 | Carl Zeiss Ag | -- |
| 冷冻损伤 | 氧氟沙星0.3% | -- | -- |
| EdU(5-乙炔基-2'-脱氧尿苷) | Sigma-Aldrich | 900584 | |
| 茜素红 | Electron Microscopy Sciences | 10360 | |
| Click-iT EdU细胞增殖试剂盒 | Invitrogen | C10337 | |
| PTK | 准分子激光(Nidek EC-5000) | Nidek | -- |
| 人组织免疫组化 | OptisolGS保存液 | Bausch & Lomb | -- |
| 抗TAZ抗体 | Novus Biologicals | nb110-58359 | |
| AlexaFluor488二抗 | Invitrogen | A27034 | |
| Aquamount封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Leica SP8 STED显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 自动化Western blot | Jess仪器 | Protein Simple | -- |
| 12-230 kD毛细管卡盒 | Protein Simple | SM-SW002 | |
| 抗兔检测模块 | Protein Simple | DM-001 | |
| 统计分析 | Prism 9 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系(129S)、基因型(WT、Wwtr1+/−、Wwtr1−/−)、年龄(2、6、12个月),基因分型方法(PCR) 阅读提示:Methods - Animals and Genotyping |
| 眼部成像与检查 | 使用设备(OCT、IVCM、裂隙灯等),测量指标(CCT、ECD、IOP),年龄组 阅读提示:Methods - Ophthalmic Examinations and Advanced Ocular Imaging; Figure 1 |
| AFM测量 | 样品制备(EDTA处理、去除内皮和上皮),AFM参数(最大压痕力5 nN,5个位置,每个位置5条曲线),弹性模量拟合模型(Hertz模型) 阅读提示:Methods - Atomic Force Microscopy: Wwtr1 Mice; Figure 2 |
| 免疫荧光染色 | 抗体浓度(ZO-1 1:100,Na/K-ATPase 1:200),固定条件(4% PFA),成像设备 阅读提示:Methods - Wwtr1/TAZ Immunofluorescence; Figure 2 |
| 冷冻损伤实验 | 小鼠年龄(7-8个月),损伤参数(2mm钢探针,液氮,接触10秒),样本量(WT=8,Wwtr1+/−=8,Wwtr1−/−=5),检测时间(损伤后第2天) 阅读提示:Methods - Transcorneal Cryoinjury; Figure 3 |
| PTK实验 | 小鼠年龄(6个月),激光参数(平均通量170 mJ/cm2,消融直径2mm,深度20µm),样本量(WT=6,Wwtr1+/−=6),检测时间点(PID 1,3,5,7,10,14) 阅读提示:Methods - Phototherapeutic Keratectomy Injury; Figure 4 |
| 人组织表达分析 | 样本分组(对照、症状前、FECD、FECD_NR),RNA-seq数据集,WWTR1表达水平 阅读提示:Methods - WWTR1 Expression Levels in Human Endothelial Tissue; Figure 5 |
| 遗传关联分析 | 样本量(96例FECD,96例对照),TCF4重复扩张状态,WWTR1测序方法 阅读提示:Methods - WWTR1 Variants in FECD Patient Cohort |
| 人TAZ蛋白定位 | 样本类型(FECD手术外植体),固定条件,抗体浓度(1:200),成像设备 阅读提示:Methods - Human Surgical Tissue Immunohistochemistry; Figure 6 |
| 自动化Western blot | 抗体稀释(1:30),样品池(N=16,每池4个),总蛋白归一化 阅读提示:Methods - Capillary Electrophoresis and Automated Western Blotting; Figure 6 |