体外药物敏感性检测
评估rMV-Hu191与顺铂联合对胃癌细胞增殖的抑制作用及协同效应。
使用CCK-8实验检测不同浓度组合下细胞活力,并通过ZIP分析计算协同评分。
Synergism of rMV-Hu191 with cisplatin to treat gastric cancer by acid sphingomyelinase-mediated apoptosis requiring integrity of lipid raft microdomains
包含体外细胞实验(增殖、凋亡、蛋白表达)、体内异种移植瘤模型及机制验证(ASMase和脂筏),但缺乏患者样本或组学数据。
人胃癌细胞系BGC-823 人胃癌细胞系SGC-7901 多药耐药胃癌细胞系GCSR1 胃癌异种移植瘤裸鼠模型
细胞系:BGC-823、SGC-7901和GCSR1的细胞培养条件(培养基及FBS浓度) rMV-Hu191感染复数(MOI)和顺铂剂量(如BGC-823: MOI=0.1, DDP=0.6μM;SGC-7901: MOI=1, DDP=2.8μM) 凋亡检测:Annexin V FITC凋亡检测试剂盒(BD)及流式细胞仪;Western blot检测caspase-3和PARP表达 脂筏破坏:MβCD浓度及处理时间(7.5mM预处理2h,2mM处理48h) ASMase抑制:丙咪嗪浓度(BGC-823: 25μM, SGC-7901: 50μM)及处理时间(感染后72h)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估rMV-Hu191与顺铂联合对胃癌细胞增殖的抑制作用及协同效应。
使用CCK-8实验检测不同浓度组合下细胞活力,并通过ZIP分析计算协同评分。
验证联合治疗是否通过caspase依赖性凋亡诱导细胞死亡。
使用流式细胞术检测Annexin V阳性细胞比例,Western blot检测caspase-3和PARP剪切,并用Z-VAD抑制caspase验证。
验证顺铂是否影响rMV-Hu191的复制。
通过TCID50法检测病毒滴度。
验证脂筏完整性在联合治疗诱导凋亡中的作用。
使用MβCD破坏脂筏,检测凋亡比例及凋亡蛋白表达变化。
验证ASMase在联合治疗诱导凋亡中的参与。
使用丙咪嗪抑制ASMase活性,以及shRNA敲低ASMase表达,检测凋亡变化。
探索ASMase是否转位至脂筏微结构域。
通过免疫荧光检测ASMase与脂筏标记物CTB的共定位,并用Western blot检测ASMase表达变化。
评估联合治疗在多药耐药胃癌细胞中的效果。
使用GCSR1细胞系检测细胞活力、凋亡及协同效应。
验证联合治疗在动物模型中的抗肿瘤效果及安全性。
建立BGC-823异种移植瘤模型,分为四组处理,测量肿瘤体积、生存期及副作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Life Technologies | -- |
| DMEM培养基 | Life Technologies | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 药物处理 | 顺铂 | Sigma | P4394 |
| 凋亡抑制 | Z-VAD-FMK | ApexBio | A1902 |
| 脂筏破坏 | 甲基-β-环糊精 | Sigma | 332615 |
| ASMase抑制 | 丙咪嗪 | ApexBio | C4117 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| 细胞培养 | Opti-MEM培养基 | Life Technologies | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V FITC凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 556547 |
| 流式分析 | 流式细胞仪(Navios) | Beckman Coulter | -- |
| Flowjo 10.0软件 | Tree Star Inc | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| PVDF膜 | Bio-Rad Laboratories | 1620177 | |
| EZ-ECL检测试剂盒 | Biological Industries | 20-500-120 | |
| 抗β-actin抗体 | CST | 4970S | |
| 抗caspase-3抗体 | CST | 9665S | |
| 抗PARP抗体 | CST | 9542S | |
| 抗酸性鞘磷脂酶(ASMase)抗体 | abcam | ab74281 | |
| 抗flotillin 1抗体 | abcam | ab133497 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG二抗 | CST | 7074S | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG二抗 | CST | 7076S | |
| 免疫荧光 | TritonX-100 | Solarbio | -- |
| 抗麻疹磷蛋白抗体 | abcam | ab43820 | |
| Alexa Fluor® 594 驴抗小鼠IgG (H+L) | Invitrogen | A-21203 | |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| Zeiss cLSM780显微镜 | Zeiss | -- | |
| Alexa 488偶联的霍乱毒素B亚单位 | Invitrogen | C-34775 | |
| 抗酸性鞘磷脂酶(ASMase)抗体 | abcam | ab83354 | |
| Alexa Fluor® 594 山羊抗兔IgG (H+L) | Invitrogen | A-11012 | |
| 徕卡TCS SP8共聚焦激光扫描显微镜 | Lecia | -- | |
| 动物实验 | 无胸腺裸鼠 | -- | -- |
| 血液生化分析 | 自动化血液生化流水线分析仪 | Beckman Coulter | -- |
| 免疫组化 | 4%福尔马林 | -- | -- |
| TUNEL原位凋亡检测试剂盒 | Takara | MK500 | |
| 光学显微镜 | Leica | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism 9.0 | GraphPad Software | -- |
| R包"SynergyFinder 1.0." | -- | -- | |
| 质粒包装 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668027 |
| 嘌呤霉素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | BGC-823和GCSR1使用RPMI 1640+10%FBS;SGC-7901使用RPMI 1640+20%FBS;Vero使用DMEM+10%FBS;培养条件为37°C,5%CO2,饱和湿度 阅读提示:Materials and methods 中 “Cell culture and reagents” |
| 体外药物处理 | rMV-Hu191感染24h后加入DDP;处理时间72h;具体MOI和DDP剂量:BGC-823: MOI=0.1, DDP=0.6μM;SGC-7901: MOI=1, DDP=2.8μM;GCSR1: MOI=10, DDP=3μM 阅读提示:Materials and methods 中 “Cell viability assays” 和 “Virus construction, titration and replication assays” |
| 协同效应分析 | 使用ZIP模型,通过R包“SynergyFinder 1.0”计算协同评分 阅读提示:Materials and methods 中 “Zero interaction potency (ZIP) analysis” |
| 凋亡检测 | 细胞密度1×10^6,Annexin V FITC凋亡检测试剂盒(BD)染色,流式检测,每组三个重复;Z-VAD浓度100μM 阅读提示:Materials and methods 中 “Flow cytometry analysis” 和 Figure 1d |
| Western blot | 蛋白上样量30μg;抗体:anti-caspase-3 (CST, 9665S),anti-PARP (CST, 9542S),anti-β-actin (CST, 4970S) 阅读提示:Materials and methods 中 “Western blotting” |
| 脂筏破坏 | MβCD浓度:7.5mM预处理2h,2mM处理48h 阅读提示:Materials and methods 中 “Disruption and isolation of cholesterol-rich ‘lipid rafts’” |
| ASMase抑制 | 丙咪嗪浓度:BGC-823 25μM,SGC-7901 50μM,处理72h 阅读提示:Materials and methods 中 “Functional inhibition of ASMase” |
| shRNA敲低 | shASMase和shCtrl质粒从Genechem获得,使用lipofectamine 2000进行慢病毒包装,嘌呤霉素(1:12,000)筛选稳定转染 阅读提示:Materials and methods 中 “Construction of ASMase-knockdown SGC-7901 cell clones” |
| 动物模型 | BGC-823细胞(1×10^6)皮下注射至雄性裸鼠(3-5周龄);肿瘤体积达到30-50mm³时随机分组(n=10);rMV-Hu191瘤内注射(1.4×10^7 TCID50,在第5,6,7,9,11,13天),DDP腹腔注射(10mg/kg,在第7,14,21天) 阅读提示:Materials and methods 中 “In vivo antitumor studies” |
| 副作用评估 | 肝肾功能指标:Alb、Glb、AST、ALT、BUN、Cr;体重变化 阅读提示:Materials and methods 中 “Evaluation of side-effects in vivo” 和 Figure 6i-k |