蜕膜组织收集与区域定义
建立匹配的底蜕膜和壁蜕膜样本队列,并根据EVT侵袭程度定义组织区域。
收集早孕期蜕膜组织(n=38),经HLA-G免疫组化筛选后,最终23例用于分析,按区域分类为:壁蜕膜致密层和海绵层,底蜕膜弱/强侵袭及重塑病灶。
Remodeling lesions locate at sites of strong extravillous trophoblast invasion and are associated with neutrophil presence in the human first-trimester decidua
该研究结合空间转录组学、单细胞数据整合、免疫组化/免疫荧光、定量图像分析和组织学评估等多层级验证,涵盖体外组织分析和体内样本,明确功能验证和机制探讨。
人早孕期蜕膜组织样本(孕周7-9周) 匹配的底蜕膜和壁蜕膜 空间转录组学切片 档案蜕膜标本
蜕膜组织来自孕周7-9周(中位51天)的选择性终止妊娠样本,n=23 区域分类基于HLA-G免疫组化,分为壁蜕膜致密层、海绵层,底蜕膜弱/强侵袭区及重塑病灶 免疫细胞定量:CD56+ dNK细胞、CD66b+中性粒细胞、CD3+CD8−/CD8+ T细胞、CD14+CD163−/CD163+巨噬细胞,n=23 用于距离测量的样本n=5,基于IF三重染色和CD56 IHC 空间转录组学样本:来自两名供体的底蜕膜和壁蜕膜各2个组织块,共4个捕获区域
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立匹配的底蜕膜和壁蜕膜样本队列,并根据EVT侵袭程度定义组织区域。
收集早孕期蜕膜组织(n=38),经HLA-G免疫组化筛选后,最终23例用于分析,按区域分类为:壁蜕膜致密层和海绵层,底蜕膜弱/强侵袭及重塑病灶。
揭示蜕膜组织结构、EVT侵袭区域及分子特征,验证组织学区域定义。
对来自两名供体的底蜕膜和壁蜕膜组织进行Visium空间转录组学,结合单细胞RNA-seq数据反卷积,并进行差异表达分析(重塑病灶 vs 强侵袭)。
定量评估各蜕膜区域中主要免疫细胞群体的丰度和空间分布。
对23例样本进行IHC或IF染色(CD56、CD66b、CD3/CD8、CD14/CD163等),使用Visiopharm软件进行半自动图像分析和细胞计数。
分析T细胞、巨噬细胞和dNK细胞相对于重塑病灶的空间分布。
对5例样本进行IF三重染色(CD66b、CD3、CD14)和CD56 IHC,测量免疫细胞到最近重塑病灶的距离,并使用QuPath软件分析。
评估各蜕膜区域的组织学特征(碎片、纤维蛋白、细胞外红细胞、中性粒细胞等)。
对23例样本的H&E染色切片进行半定量评分(0-3级),并计数血管外红细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织处理 | Microm HM355切片机 | Thermo Fisher | -- |
| Superfrost Plus载玻片 | Thermo Fisher | -- | |
| 免疫组化 | UltraVision LP检测系统HRP聚合物试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Mayer苏木素 | Thermo Fisher | -- | |
| Kaiser甘油明胶 | Merck | -- | |
| 兔和小鼠免疫球蛋白阴性对照 | Dako, Agilent | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | Thermo Fisher | -- |
| ProLong Gold抗淬灭剂 | Invitrogen, Thermo Fisher | -- | |
| Ultravision蛋白封闭液 | Thermo Fisher | -- | |
| 图像采集 | Evident Olympus VS200切片扫描仪 | Evident | -- |
| 荧光成像 | FV4000共聚焦激光扫描显微镜 | Evident | -- |
| 图像分析 | Visiopharm VIS图像分析软件 | Visiopharm | -- |
| QuPath软件 | -- | -- | |
| 空间转录组学 | Visium组织优化载玻片 | 10x Genomics | -- |
| Visium空间基因表达载玻片 | 10x Genomics | -- | |
| Aperio Scan Scope AT2系统 | Leica Biosystems | -- | |
| 高灵敏度DNA生物分析仪试剂盒 | Agilent | 5067-4626 | |
| 双索引板TT套装A | 10x Genomics | 1000215 | |
| SPRIselect试剂 | Beckman Coulter | B23318 | |
| QuantiFluor ONE dsDNA染料 | Promega | E489A | |
| QuantiFluor ONE Lambda DNA | Promega | E490B | |
| Quantus荧光计 | Promega | -- | |
| Illumina NovaSeq SP流动槽 | Illumina | -- | |
| 组织处理 | Cryostar NX50低温恒温器 | Thermo Fisher | -- |
| 试剂 | 吐温20 | Merck | -- |
| 组织处理 | HistoLab-Clear | Sanova | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织收集与区域定义 | 蜕膜组织来源(选择性终止妊娠)、孕周(7-9周)、样本量(n=23)、区域分类标准(HLA-G染色) 阅读提示:Methods: Tissue collection, Definition of areas based on degree of invasion, Table 1 |
| 空间转录组学 | Visium平台、组织块大小、冷冻切片厚度、透化时间(6分钟)、cDNA扩增循环数(13-14)、测序平台(NovaSeq SP)、数据分析参数(过滤阈值、Harmony整合、cluster resolution 0.4) 阅读提示:Methods: Spatial transcriptomics, Spatial transcriptomics data analysis |
| 免疫细胞定量分析 | 抗体克隆和稀释度(见Supplementary Table S2)、图像分析阈值(IHC阳性阈值>238,IF各通道阈值)、细胞核大小排除标准 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry and immunofluorescence, Image analysis and quantification |
| 距离测量 | 样本数(n=5)、测量区域(重塑病灶周围600μm)、细胞分类阈值(如CD3+中位Cy3强度>4000且最大>8000) 阅读提示:Methods: Image analysis and quantification(distance measurements) |
| 组织学评分 | 评分标准(0-3级,各百分比区间)、红细胞计数归一化(每1000μm2) 阅读提示:Methods: Systematic evaluation of histological sections |