建立基因敲除小鼠模型
生成Myd88缺陷的rd10小鼠以研究Myd88在视网膜变性中的作用
将rd10小鼠与Myd88−/−小鼠杂交产生rd10;Myd88−/−小鼠,并通过PCR和DNA测序确认基因型。
Myd88 Deficiency Accelerates Retinal Degeneration and Alters Microglial Dynamics in a Mouse Model of Retinitis Pigmentosa
包括组织学(TUNEL、H&E)、功能学(ERG)体外/体内模型、mRNA表达谱分析及蛋白水平的免疫荧光验证,并包含功能验证和机制探索。
rd10小鼠模型 rd10;Myd88−/−小鼠模型 Myd88−/−小鼠模型 野生型(C57BL/6J)小鼠
小鼠品系:rd10、Myd88−/−、rd10;Myd88−/−,雄性 时间点:P14、P18、P21、P28、P42 检测指标:TUNEL阳性细胞密度、ONL厚度、ERG振幅、Iba-1阳性细胞数、PNA阳性细胞数 mRNA谱:NanoString神经炎症panel,每组n=4 统计:Wilcoxon秩和检验、t检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成Myd88缺陷的rd10小鼠以研究Myd88在视网膜变性中的作用
将rd10小鼠与Myd88−/−小鼠杂交产生rd10;Myd88−/−小鼠,并通过PCR和DNA测序确认基因型。
评估Myd88缺陷对rd10小鼠感光细胞凋亡和视网膜组织结构的影响
在P14、P18、P21和P28进行TUNEL染色和H&E染色,测量ONL厚度和TUNEL阳性细胞密度;P42通过PNA染色评估视锥细胞退化。
检测Myd88缺陷对rd10小鼠视功能(杆细胞和视锥细胞)的影响
使用视网膜电图(ERG)记录暗适应0.01和3.0以及光适应3.0反应,分析a波和b波振幅。
研究Myd88缺陷对rd10小鼠视网膜小胶质细胞浸润模式的影响
在P14、P18和P21对视网膜切片进行Iba-1免疫染色,计数外视网膜(ONL和视网膜下腔)中的Iba-1阳性细胞。
鉴定Myd88缺陷引起的视网膜神经炎症相关基因表达变化
使用NanoString nCounter神经炎症panel(757个基因)检测P14和P21视网膜mRNA表达,通过nSolver分析DEGs,并验证关键基因蛋白表达。
验证mRNA谱中发现的Ifitm3和Serpina3n在蛋白水平的表达和细胞定位
在P21视网膜切片上进行IFITM3和SERPINA3N免疫染色,并定量荧光强度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | Jackson实验室 | Jackson Laboratory | -- |
| 组织学 | Triton X-100 | Wako | 9002-93-1 |
| 免疫染色 | 抗Iba-1抗体 | Wako | 019-19741 |
| Alexa Fluor 647偶联二抗 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 488偶联二抗 | Invitrogen | -- | |
| 抗Serpina3n抗体 | R&D Systems | AF4709 | |
| 抗Ifitm3抗体 | Proteintech | 11714-1-AP | |
| 组织学 | DAPI | -- | -- |
| 荧光成像 | BZ-X700荧光显微镜 | Keyence | -- |
| TUNEL染色 | ApopTag荧光原位凋亡检测试剂盒 | Merck Millipore | -- |
| 视网膜铺片 | FITC标记的花生凝集素(PNA) | Sigma-Aldrich | L7381 |
| ERG | PuREC系统 | Meiyo | -- |
| 托吡卡胺0.5% | -- | -- | |
| mRNA分析 | Nanostring nCounter小鼠神经炎症panel | Nanostring Technologies | 115000237 |
| RNA提取 | RNeasy试剂盒 | Qiagen | -- |
| mRNA分析 | nCounter数字分析仪 | Nanostring | -- |
| 数据分析 | nSolver 4.0和Advanced Analysis 2.0软件 | Nanostring | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件1.52a版 | NIH | -- |
| 统计分析 | JMP pro 17.0 | SAS | -- |
| 基因型鉴定 | Hitachi 3500xl基因分析仪 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型和基因型 | 小鼠品系:rd10(B6.CXB1-Pde6βrd10/J)和Myd88−/−,雄性;具体基因型鉴定条件(引物序列和PCR条件)需核对。 阅读提示:参见Materials and Methods (Animals) |
| 组织学检测 | 固定:4% PFA;切片厚度:5 µm(Iba-1和H&E)和3 µm(IFITM3/SERPINA3N);封闭:10%脱脂牛奶和0.3% Triton X-100;一抗浓度:Iba-1 1:300, Serpina3n 1:100, Ifitm3 1:100;定量参数:ONL厚度和TUNEL阳性细胞密度(10,000-µm2区域);荧光强度归一化。 阅读提示:参见Materials and Methods (Histological Examinations, TUNEL, Immunohistochemistry, H&E) |
| ERG | 麻醉:氯胺酮100 mg/kg和甲苯噻嗪10 mg/kg;瞳孔扩张:0.5%托吡卡胺和0.5%去氧肾上腺素;暗适应过夜;记录暗适应0.01和3.0及光适应3.0反应;波形振幅量化。 阅读提示:参见Materials and Methods (Electroretinograms) |
| mRNA分析 | 时间点:P21;每组4个生物重复;RNA量:100 ng;杂交:65°C 16小时;DEG标准:fold-change>2, P<0.05;数据归一化:管家基因几何平均值。 阅读提示:参见Materials and Methods (mRNA Profiling using NanoString) |
| 小胶质细胞定量 | 时间点:P14, P18, P21;计数区域:0.01 mm²,距离视神经250, 500, 1000 µm(四个方向);Iba-1阳性细胞数。 阅读提示:参见Materials and Methods (Immunohistochemistry for Iba-1) 和Figure 3 |