病例收集与病理复核
收集少突胶质细胞瘤及低级别胶质神经元肿瘤/低级别胶质瘤病例,并依据2021年WHO分类标准进行复核。
回顾性收集357例患者样本,包括300例少突胶质细胞瘤、52例低级别胶质神经元肿瘤/低级别胶质瘤等,所有病例均进行IDH1/2测序,由两位病理学家独立复核。
SOX10 distinguishes oligodendrogliomas from low-grade glioneuronal tumors/low-grade gliomas with oligodendrocyte-like features
包含357例患者样本的回顾性队列,涵盖多种肿瘤类型;运用免疫组化、DNA测序和FISH进行分子分型;统计分析SOX10表达与诊断及分级的关系。
少突胶质细胞瘤组织样本 低级别胶质神经元肿瘤/低级别胶质瘤组织样本
SOX10免疫组化阳性阈值:≥10%肿瘤细胞染色 SOX10免疫组化抗体:ZSGB-BIO,克隆OTIR50A11,稀释度1:200 H3K27me3免疫组化抗体:RevMAB Biosciences,克隆RM175,稀释度1:100 少突胶质细胞瘤纳入标准:IDH突变且1p/19q共缺失
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集少突胶质细胞瘤及低级别胶质神经元肿瘤/低级别胶质瘤病例,并依据2021年WHO分类标准进行复核。
回顾性收集357例患者样本,包括300例少突胶质细胞瘤、52例低级别胶质神经元肿瘤/低级别胶质瘤等,所有病例均进行IDH1/2测序,由两位病理学家独立复核。
评估SOX10、H3K27me3、Olig2和IDH1在不同肿瘤中的表达。
对4μm厚FFPE组织切片进行免疫组化染色,使用Leica BOND-MAX系统,采用EnVision两步法,使用特异性抗体。
确认IDH突变状态、TERT启动子突变、BRAF V600E突变及1p/19q共缺失。
使用PCR-荧光探针法检测IDH1/2、TERT、BRAF突变;使用FISH检测1p/19q共缺失。
比较SOX10在少突胶质细胞瘤和低级别胶质神经元肿瘤/低级别胶质瘤中的表达差异。
对SOX10染色结果进行二分法判读(阳性≥10%,阴性<10%),并计算免疫反应评分(IRS)。
评估H3K27me3在少突胶质细胞瘤中的表达模式,并探索其与SOX10联合的诊断价值。
对300例少突胶质细胞瘤进行H3K27me3免疫组化染色,记录五种染色模式,并分类为保留、下调或缺失。
评估SOX10单独或联合H3K27me3在鉴别诊断中的灵敏度、特异性和预测值。
计算SOX10阴性、H3K27me3缺失及两者联合对少突胶质细胞瘤的诊断灵敏度、特异性及阳性预测值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | SOX10抗体 | ZSGB-BIO | ZA-0624 |
| H3K27me3抗体 | RevMAB Biosciences | 31-1062-00 | |
| Olig2抗体 | ZSGB-BIO | ZA-0561 | |
| IDH1 R132H抗体 | ZSGB-BIO | ZM-0447 | |
| DNA提取 | QIAamp DNA迷你试剂盒 | Qiagen | -- |
| DNA测序 | 生物光度计 | Eppendorf | -- |
| 突变检测 | IDH1突变检测试剂盒 | Genetron Health | -- |
| IDH2突变检测试剂盒 | Genetron Health | -- | |
| TERT启动子突变检测试剂盒 | Genetron Health | -- | |
| BRAF V600E突变检测试剂盒 | Amoydx | -- | |
| 实时PCR | 实时荧光定量PCR系统7500 | -- | -- |
| FISH | 双色探针组(1p36/1q25和19q13/19p13) | Wuhan HealthCare Biotechnology | -- |
| BRAF(7q34)断裂双色探针 | Wuhan HealthCare Biotechnology | -- | |
| 免疫组化 | 徕卡BOND-MAX系统 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病例收集 | 样本来源:复旦大学附属华山医院病理科;时间范围:2021年1月至2024年12月;少突胶质细胞瘤的诊断标准(IDH突变和1p/19q共缺失) 阅读提示:Materials and methods 中的 Patients and specimens |
| 免疫组化 | 抗体克隆号、稀释度、染色平台、判读阈值(SOX10阳性≥10%)、IRS计算方法 阅读提示:Materials and methods 中的 Immunohistochemistry |
| 分子检测 | DNA提取试剂盒、突变检测试剂盒、FISH探针及判读标准 阅读提示:Materials and methods 中的 DNA sequencing 和 Fluorescence in situ hybridization |
| SOX10表达分析 | SOX10阳性/阴性判读阈值;IRS计算;SOX10表达面积分级(<50% 和 ≥50%) 阅读提示:Results 中的 Negative SOX10 expression... 和表1、表2 |
| H3K27me3表达分析 | H3K27me3染色模式的分类标准(核保留、下调、缺失) 阅读提示:Results 中的 Diagnostic utility of combined H3K27me3... 和 Figure 4 |