AI驱动的深度可视化蛋白质组学揭示胰腺癌前驱病变中的关键分子转变

胰腺导管腺癌（PDAC）通过前驱病变演变而来，但调控早期进展的蛋白质程序仍不明确。我们将深度可视化蛋白质组学（DVP）——整合计算病理学、激光显微切割和质谱（MS）——应用于来自器官捐献者和PDAC患者的正常导管、腺泡-导管化生（ADM）、低级别（LG）和高级别（HG）胰腺上皮内瘤变（PanIN）及浸润性癌的谱系分析。对每个区域约100个细胞定量了9,181种蛋白质，我们发现了组织学正常导管中的分子场效应和LG-PanIN在癌症背景下的蛋白质组差异。我们确定了四个阶段相关的分子程序。应激适应和免疫参与在癌症相关的正常导管中早期出现。代谢重编程起始于正常导管，并随PanIN进展而加剧。线粒体重塑在侵袭前的高级别PanIN中变得显著。MS在无癌症个体的偶发性前驱病变中检测到KRAS热点突变肽。这些发现表明分子重编程先于组织学转化，为早期检测致命癌症创造了机会。