量化中国快速城市化地区结核分枝杆菌的社区传播：一项为期九年的人口基因组与空间分析

结核病（TB）在中国城市化地区仍然是一个重大的公共卫生威胁，人口动态变化和迁移可能加剧TB传播。我们在2014年1月1日至2022年12月31日期间，对深圳诊断出的培养阳性TB患者进行了一项为期九年的前瞻性流行病学研究，并采用全基因组测序分析来描述结核分枝杆菌（Mtb）的本地传播情况。使用基于非参数距离的映射方法识别了Mtb传播热点。我们应用了空间结构化逻辑回归和分层贝叶斯成对回归分析，以识别与本地传播相关的人口统计学、病原体和空间因素。使用贝叶斯系统发育分析来推断可能的传播事件。在4560名培养阳性TB个体中，93.4%（4261人）是中国国内移民。21.8%（996/4560）的个体其Mtb分离株属于基因组簇，在中央商务区和郊区工业区检测到多个传播灶。传播更可能发生在年龄相近、地理位置接近以及具有相同省份来源的移民患者之间。来自移民比例较高社区的Mtb分离株具有更高的成簇风险。在这个快速发展的城市环境中，相当一部分病例被记录为本地传播的结果，这似乎是由特定的社会和地理因素驱动的，尤其是在移民人口中。因此，控制策略应从静态模型转向动态干预，专门针对动态城市环境中的社交网络、高风险社区和城市热点区域。