深度学习驱动的1型糖尿病自然病程中内分泌细胞和CD3+ T细胞定量分析
Deep learning-powered quantification of endocrine cells and CD3+ T cells in the natural history of type 1 diabetes
目的/假设:在1型糖尿病中进行组织病理学分析,通过全玻片图像(WSIs)实现细胞定量以进行精确表征存在挑战。为确保全面理解内分泌细胞的变化,本研究利用预训练的深度学习辅助分析工作流程,以增强对来自对照、自身抗体阳性和1型糖尿病器官捐献者的胰腺中1型糖尿病发展的组织病理学特征的理解。方法:对来自32名自身抗体阴性对照捐献者、12名单一自身抗体阳性(sAAb+)捐献者、8名多重自身抗体阳性(mAAb+)捐献者、6名新发1型糖尿病(病程0-1年)捐献者和19名长期1型糖尿病捐献者的胰腺切片(头、体、尾区域)进行了胰岛素(INS)、胰高血糖素(GCG)和CD3免疫组织化学染色分析。内分泌细胞群(即细胞簇[<1000μm2]和胰岛[≥1000μm2])通过预训练的Segment Anything模型进行分割,随后使用QuPath像素分类器对这些结构内的INS+和GCG+细胞区域进行精确分割。对位于每个内分泌细胞群20 µm外周内的CD3+细胞进行定量。应用序数回归评估疾病分期相关模式在量化预测因子中的表现。使用Kruskal-Wallis检验比较五个捐献者组间的差异。对于配对比较,则进行了经Bonferroni校正的Wilcoxon秩和检验。结果:从77名捐献者的总共231张WSIs中,分析了>82,000个胰岛和>26,000个细胞簇。在序数回归中,INS和GCG的分数面积是预测1型糖尿病进展的最显著预测因子。胰岛中的CD3+免疫细胞浸润与1型糖尿病进展高度相关。胰岛和细胞簇中的浸润在疾病发病时达到峰值,随后下降,表明这些结构是自身免疫过程中的同步靶点。甚至在1型糖尿病发病前就存在明显的胰岛炎性细胞簇,强调了这些结构在自身免疫过程中的早期参与。结论/解释:基于深度学习的方法使我们的研究能够纳入散布在WSIs中的内分泌细胞簇,提供了细胞簇水平浸润的精确定量证据。在胰岛和细胞簇中识别自身免疫模式,同时量化各捐献者组和胰腺区域的β细胞和α细胞,为更详细地理解1型糖尿病发病机制提供了依据。我们的研究结果为甚至在1型糖尿病发病前就存在的细胞簇水平浸润提供了有力证据,支持了保护β细胞的早期干预努力。