德国不同联邦州奶牛场LA-MRSA ST398的基因组特征及其导致严重人类感染的低风险

Genomic Distinctions of LA-MRSA ST398 on Dairy Farms From Different German Federal States With a Low Risk of Severe Human Infections

作者信息Tobias Lienen, Arne Schnitt, Jens Andre Hammerl, Sven Maurischat, Bernd-Alois Tenhagen
PMID33488532
发布时间2021-01-08
DOI10.3389/fmicb.2020.575321

摘要

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)已在德国奶牛场发现,并可能导致难以治疗的奶牛乳腺炎。考虑到“一体化健康”理念,MRSA可能从动物传播给人类,增加严重感染的风险。在17个有MRSA检测史的德国奶牛场,从四分乳、混合罐乳、犊牛、后备牛、猪以及环境拭子中分离了MRSA菌株。选取33株分离株进行全基因组测序和抗菌素耐药性测试。所有检测到的MRSA菌株均属于与牲畜相关的序列类型398。甲氧西林耐药性与葡萄球菌染色体盒(SCC)mec IVa型(7/33)或V型(26/33)中的mecA基因相关。德国各联邦州的MRSA菌株显示出较大的等位基因差异,表明其独立发展和分布。在一个农场中,克隆MRSA分离株在不同动物和挤奶设备中广泛传播。此外,同一联邦州内两个奶牛场之间的MRSA传播似乎很可能。深入研究表明,耐药基因预测与表型耐药性具有良好的一致性。28株菌株被确定对多达七种抗菌物质表现出非野生型(耐药)表型,总体上对β-内酰胺类和四环素耐药。在MRSA菌株中发现了十种不同的表型抗菌素耐药模式。这些菌株携带广泛的毒力基因库,其中一些与奶牛乳腺炎有关。然而,这些分离株缺乏典型的人类感染相关因子,如免疫逃避簇基因、葡萄球菌肠毒素基因或Panton-Valentine杀白细胞素基因,因此推测其导致严重人类感染和食源性疾病的风险较低。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
Mueller Hinton肉汤Thermo Fisher Scientific Oxoid Ltd.--
胰蛋白酶大豆肉汤Merck--
头孢西丁Sigma-Aldrich--
氨曲南Sigma-Aldrich--
甘露醇盐琼脂平板Thermo Fisher Scientific Oxoid Ltd.--
头孢西丁Sigma-Aldrich--
绵羊血琼脂Oxoid GmbH46483
Qiagen DNeasy血液和组织试剂盒Qiagen--
Illumina Nextera DNA Flex试剂盒Illumina Inc.--
Illumina NextSeq 500仪器Illumina Inc.--