构建HiBiT标记的GCase细胞模型
建立能够定量检测GCase蛋白水平的高通量筛选细胞模型。
利用TALEN介导的基因编辑将HiBiT标记的GBA1(WT、N370S、L444P)单拷贝整合到GBA1-KO H4细胞的安全港位点,并通过ddPCR确认拷贝数。
High-throughput screening for small-molecule stabilizers of misfolded glucocerebrosidase in Gaucher disease and Parkinson's disease
包含体外细胞模型(HiBiT-GCase H4细胞系)、二次高内涵成像分析(LysoFix-GBA和免疫荧光)、功能验证(脂质积累)以及机制验证(微尺度热泳和激活实验),多层级证据。
HiBiT-GCase-L444P H4细胞系 HiBiT-GCase-WT H4细胞系 HiBiT-GCase-N370S H4细胞系 患者来源成纤维细胞
HiBiT-GCase-L444P H4细胞系中化合物的稳定化效果(EC50和功效) LysoFix-GBA底物浓度(5 μM)和处理时间(2小时) 免疫荧光分析中hGCase-1/23抗体和LAMP1共染色 GluSph积累的逆转评估(处理时间3天或48小时) NCGC326与trans-ISRIB等组合的协同效应(Loewe评分)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立能够定量检测GCase蛋白水平的高通量筛选细胞模型。
利用TALEN介导的基因编辑将HiBiT标记的GBA1(WT、N370S、L444P)单拷贝整合到GBA1-KO H4细胞的安全港位点,并通过ddPCR确认拷贝数。
确认HiBiT标签不影响GCase的加工、运输和酶活性。
通过免疫荧光、western blot、糖基化分析、AlphaLISA和GCase活性测定,比较HiBiT-GCase与内源性GCase的定位和功能。
开发适用于1536孔板的高通量筛选方法以检测GCase稳定剂。
将HiBiT-GCase-L444P H4细胞用于1536孔板,用已知活性化合物(MG132、NMS-873、氨溴索等)进行验证,确定筛选窗口。
从NCATS生物活性库中鉴定新的GCase-L444P稳定剂。
对10,779个化合物进行7点浓度筛选,命中判定标准为曲线等级和功效≥40%,随后进行剂量反应确认和细胞毒性检测。
验证命中化合物是否能增强GCase的溶酶体活性和转位。
使用LysoFix-GBA底物和hGCase-1/23抗体进行高内涵成像,评估化合物对GCase-L444P溶酶体活性和定位的影响。
评价候选化合物对GluSph积累的影响及协同效应。
用NCGC326、trans-ISRIB等处理HiBiT-GCase-L444P细胞,检测GluSph水平;并通过矩阵组合筛选评估PC与PR的协同作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和稳定转染 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | -- | -- |
| 基因编辑 | TALEN质粒 | -- | -- |
| 蛋白质检测 | hGCase-1/23抗体 | -- | -- |
| hGCase-1/17抗体 | -- | -- | |
| 抗GCase抗体(R386和2E2) | -- | -- | |
| 抗LIMP-2抗体 | -- | -- | |
| LAMP1抗体 | -- | -- | |
| 酶活性检测 | LysoFix-GBA底物 | -- | -- |
| 4-甲基伞形酮-β-D-吡喃葡萄糖苷 | -- | -- | |
| 高通量筛选 | CellTiter-Glo试剂 | Promega | -- |
| 免疫荧光 | Hoechst-33342染料 | -- | -- |
| 蛋白质结合分析 | 重组GCase | -- | -- |
| 药物处理 | 氨溴索 | -- | -- |
| NCGC326 | -- | -- | |
| 帕比司他 | -- | -- | |
| trans-ISRIB | -- | -- | |
| pladienolide B | -- | -- | |
| NCGC607 | -- | -- | |
| NCGC758 | -- | -- | |
| 硼替佐米 | -- | -- | |
| MG132 | -- | -- | |
| NMS-873 | -- | -- | |
| 异法戈明 | -- | -- | |
| LTI-291/BIA 28-6156 | -- | -- | |
| ARV-825 | -- | -- | |
| 伏立诺他 | -- | -- | |
| 环氧霉素 | -- | -- | |
| 伊沙佐米 | -- | -- | |
| 丰加霉素 | -- | -- | |
| AZD2858 | -- | -- | |
| SKL2001 | -- | -- | |
| 抑制实验 | AT3375 | -- | -- |
| 脂质分析 | 氘代内标 | -- | -- |
| 组织处理 | 牛磺胆酸钠 | -- | -- |
| 缓冲液 | 柠檬酸钠缓冲液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和基因编辑 | H4细胞培养条件、TALEN质粒使用、GBA1-KO背景确认 阅读提示:Materials and Methods: 2) H4 cell culture and transfection; 3) stable integration of HiBiT-GBA1 transgene into H4 GBA1-knockout cell line |
| HiBiT-GCase质粒构建和转染 | 质粒序列、转染方法、GBA1-KO H4细胞系的选择 阅读提示:Materials and Methods: 1) plasmid construction; 2) H4 cell culture and transfection |
| HiBiT-GCase-L444P高通量筛选 | 细胞密度、化合物浓度范围、处理时间(24小时)、检测方法(HiBiT发光) 阅读提示:Figure 2 legend; Materials and Methods: 13) miniaturization and high-throughput screening of HiBiT-GCase and CellTiter-Glo assays |
| LysoFix-GBA二次分析 | LysoFix-GBA浓度(5 μM)、处理时间(2小时)、细胞密度(25,000细胞/孔)、培养时间(24小时) 阅读提示:Figure 3 legend; Materials and Methods: 16) miniaturization and high-throughput screening of LysoFix-GBA secondary assay |
| 免疫荧光分析 | 抗体浓度、共染色条件、处理时间(~34小时)、细胞密度 阅读提示:Figure 4 legend; Materials and Methods: 10) immunocytochemistry |
| 脂质分析 | 处理时间(3天或48小时)、细胞融合度、检测方法(SFC-MS/MS) 阅读提示:Figure 6 legend; Materials and Methods: 11) lipidomic analysis |
| 组合筛选 | 化合物浓度矩阵(9点,3倍稀释)、处理时间(24小时)、数据归一化方法 阅读提示:Figure 5 legend; Materials and Methods: 18) drug synergy evaluation |
| 蛋白结合分析 | 重组GCase浓度、缓冲液条件(50 mM柠檬酸钠,pH 5.5) 阅读提示:Figure 2E legend; Materials and Methods: 12) microscale thermophoresis |