高通量筛选戈谢病和帕金森病中错误折叠的葡萄糖脑苷脂酶的小分子稳定剂

High-throughput screening for small-molecule stabilizers of misfolded glucocerebrosidase in Gaucher disease and Parkinson's disease

作者信息Darian Williams, Logan M Glasstetter, Tiffany T Jong, Tiffany Chen, Abhijeet Kapoor, Sha Zhu, Yanping Zhu, Raul Calvo, Alexandra Gehrlein, Kimberly Wong, Andrew N Hogan, David J Vocadlo, Ravi Jagasia, Juan J Marugan, Ellen Sidransky, Mark J Henderson, Yu Chen
PMID39388267
发布时间2024-10-15
DOI10.1073/pnas.2406009121

实验完整度

高

包含体外细胞模型(HiBiT-GCase H4细胞系)、二次高内涵成像分析(LysoFix-GBA和免疫荧光)、功能验证(脂质积累)以及机制验证(微尺度热泳和激活实验),多层级证据。

主要模型

HiBiT-GCase-L444P H4细胞系 HiBiT-GCase-WT H4细胞系 HiBiT-GCase-N370S H4细胞系 患者来源成纤维细胞

重点核对

HiBiT-GCase-L444P H4细胞系中化合物的稳定化效果(EC50和功效) LysoFix-GBA底物浓度(5 μM)和处理时间(2小时) 免疫荧光分析中hGCase-1/23抗体和LAMP1共染色 GluSph积累的逆转评估(处理时间3天或48小时) NCGC326与trans-ISRIB等组合的协同效应(Loewe评分)

摘要

葡萄糖脑苷脂酶(GCase)与一种罕见的单基因疾病(戈谢病,GD)和一种常见的多因素疾病(帕金森病,PD)有关;因此,它是一个急需治疗靶点。为了鉴定能够纠正致病性L444P变异体GCase所表现的严重蛋白质错误折叠和运输障碍的校正剂,我们开发了一套定量的、高通量的、基于细胞的检测方法。首先,我们用一种小的促发光HiBiT肽报告标签标记GCase,从而能够在细胞中定量蛋白质稳定化,同时忠实地维持靶标生物学。基于TALEN的基因编辑允许将单个HiBiT-GBA1转基因稳定整合到GBA1敲除的H4(神经胶质瘤)细胞中的一个基因内安全港位点。这个GD细胞模型适用于通过基于滴定的定量高通量筛选进行先导化合物发现,以及通过构效关系进行先导化合物优化。对来自NCATS生物活性化合物库的10,779种化合物进行的初步筛选,鉴定出140种HiBiT-GCase-L444P稳定剂,包括药理学伴侣(氨溴索和非抑制性伴侣NCGC326)和蛋白质稳态调节剂(帕比司他、trans-ISRIB和pladienolide B)。我们部署了两个互补的高内涵成像分析来对命中化合物进行分级:荧光猝灭底物LysoFix-GBA捕获功能性溶酶体GCase活性,而采用抗体hGCase-1/23的免疫荧光分析直接可视化GCase的溶酶体转位。NCGC326在两个二次检测中均有活性,并完全逆转了病理性的葡萄糖基鞘氨醇积累。最后,我们通过证明NCGC326与蛋白质稳态调节剂在提高GCase-L444P水平方面的协同作用,测试了联合治疗的概念。展望未来,这些生理相关的检测方法可以促进针对GCase的小分子的鉴定、药理学验证和药物化学优化,最终为GD和PD提供可行的治疗方法。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
如何建立适用于高通量筛选的细胞模型,以发现能够稳定错误折叠的GCase-L444P并改善其溶酶体功能的小分子。
核心机制
小分子通过直接结合(药理学伴侣)或调节蛋白质稳态网络(蛋白质稳态调节剂)来稳定GCase-L444P,促进其正确折叠、溶酶体转位和酶活性,从而逆转葡萄糖基鞘氨醇积累。
主要证据
HiBiT-GCase-L444P H4细胞系筛选出140个命中化合物;二次分析(LysoFix-GBA和免疫荧光)验证了NCGC326和pladienolide B等能增强溶酶体活性;NCGC326和trans-ISRIB联合治疗完全逆转GluSph积累。
研究意义
该筛选体系可促进GCase靶向小分子的发现和优化,为GD和GBA1-PD提供潜在治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

构建HiBiT标记的GCase细胞模型

建立能够定量检测GCase蛋白水平的高通量筛选细胞模型。

利用TALEN介导的基因编辑将HiBiT标记的GBA1(WT、N370S、L444P)单拷贝整合到GBA1-KO H4细胞的安全港位点,并通过ddPCR确认拷贝数。

2

验证HiBiT标记不影响GCase功能

确认HiBiT标签不影响GCase的加工、运输和酶活性。

通过免疫荧光、western blot、糖基化分析、AlphaLISA和GCase活性测定,比较HiBiT-GCase与内源性GCase的定位和功能。

3

建立并优化HiBiT-GCase-L444P高通量筛选

开发适用于1536孔板的高通量筛选方法以检测GCase稳定剂。

将HiBiT-GCase-L444P H4细胞用于1536孔板,用已知活性化合物(MG132、NMS-873、氨溴索等)进行验证,确定筛选窗口。

4

筛选和验证GCase-L444P稳定剂

从NCATS生物活性库中鉴定新的GCase-L444P稳定剂。

对10,779个化合物进行7点浓度筛选,命中判定标准为曲线等级和功效≥40%,随后进行剂量反应确认和细胞毒性检测。

5

二次高内涵筛选验证

验证命中化合物是否能增强GCase的溶酶体活性和转位。

使用LysoFix-GBA底物和hGCase-1/23抗体进行高内涵成像,评估化合物对GCase-L444P溶酶体活性和定位的影响。

6

评估功能恢复和协同作用

评价候选化合物对GluSph积累的影响及协同效应。

用NCGC326、trans-ISRIB等处理HiBiT-GCase-L444P细胞,检测GluSph水平;并通过矩阵组合筛选评估PC与PR的协同作用。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基----
胎牛血清----
TALEN质粒----
hGCase-1/23抗体----
hGCase-1/17抗体----
抗GCase抗体(R386和2E2)----
抗LIMP-2抗体----
LAMP1抗体----
LysoFix-GBA底物----
4-甲基伞形酮-β-D-吡喃葡萄糖苷----
CellTiter-Glo试剂Promega--
Hoechst-33342染料----
重组GCase----
氨溴索----
NCGC326----
帕比司他----
trans-ISRIB----
pladienolide B----
NCGC607----
NCGC758----
硼替佐米----
MG132----
NMS-873----
异法戈明----
LTI-291/BIA 28-6156----
ARV-825----
伏立诺他----
环氧霉素----
伊沙佐米----
丰加霉素----
AZD2858----
SKL2001----
AT3375----
氘代内标----
牛磺胆酸钠----
柠檬酸钠缓冲液----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养和基因编辑
H4细胞培养条件、TALEN质粒使用、GBA1-KO背景确认
阅读提示:Materials and Methods: 2) H4 cell culture and transfection; 3) stable integration of HiBiT-GBA1 transgene into H4 GBA1-knockout cell line
HiBiT-GCase质粒构建和转染
质粒序列、转染方法、GBA1-KO H4细胞系的选择
阅读提示:Materials and Methods: 1) plasmid construction; 2) H4 cell culture and transfection
HiBiT-GCase-L444P高通量筛选
细胞密度、化合物浓度范围、处理时间(24小时)、检测方法(HiBiT发光)
阅读提示:Figure 2 legend; Materials and Methods: 13) miniaturization and high-throughput screening of HiBiT-GCase and CellTiter-Glo assays
LysoFix-GBA二次分析
LysoFix-GBA浓度(5 μM)、处理时间(2小时)、细胞密度(25,000细胞/孔)、培养时间(24小时)
阅读提示:Figure 3 legend; Materials and Methods: 16) miniaturization and high-throughput screening of LysoFix-GBA secondary assay
免疫荧光分析
抗体浓度、共染色条件、处理时间(~34小时)、细胞密度
阅读提示:Figure 4 legend; Materials and Methods: 10) immunocytochemistry
脂质分析
处理时间(3天或48小时)、细胞融合度、检测方法(SFC-MS/MS)
阅读提示:Figure 6 legend; Materials and Methods: 11) lipidomic analysis
组合筛选
化合物浓度矩阵(9点,3倍稀释)、处理时间(24小时)、数据归一化方法
阅读提示:Figure 5 legend; Materials and Methods: 18) drug synergy evaluation
蛋白结合分析
重组GCase浓度、缓冲液条件(50 mM柠檬酸钠,pH 5.5)
阅读提示:Figure 2E legend; Materials and Methods: 12) microscale thermophoresis