人类牙龈蛋白质组学分析
鉴定抵抗严重牙周炎的保护性因素
对Medalists中无-轻度牙周炎(n=8)和中-重度牙周炎(n=8)的牙龈活检样本进行TMT标记定量蛋白质组学分析,并通过免疫印迹验证。
Protection Against Periodontitis by Improving Mitochondrial Function in Diabetes
包含人类牙龈蛋白质组学分析、STZ诱导糖尿病小鼠模型、结扎诱导牙周炎模型,并通过免疫印迹、Seahorse代谢分析、microCT等验证功能与机制。
Medalists牙龈组织(人类样本) STZ诱导的糖尿病小鼠 结扎诱导的牙周炎小鼠模型
糖尿病小鼠模型:雄性C57BL/6J小鼠,6-7周龄,STZ 50 mg/kg连续5天腹腔注射,血糖≥350 mg/dL后用于实验。 结扎模型:3个月后,7-0丝线结扎上颌第二磨牙,持续4天或14天。 TEPP-46处理:50 mg/kg体重,每日一次口服灌胃,结扎前2周开始。 线粒体功能检测:Seahorse XF24分析仪,使用1 mm牙龈活检样本,进行线粒体压力测试和糖酵解压力测试。 统计分析:多组比较使用单因素或双因素方差分析,Tukey HSD事后检验。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定抵抗严重牙周炎的保护性因素
对Medalists中无-轻度牙周炎(n=8)和中-重度牙周炎(n=8)的牙龈活检样本进行TMT标记定量蛋白质组学分析,并通过免疫印迹验证。
验证糖尿病对牙龈线粒体功能和牙周炎的影响
使用STZ诱导糖尿病小鼠模型,在3个月后行结扎诱导牙周炎,检测骨丢失、炎症因子和线粒体功能。
评估PKM2激活对糖尿病和结扎诱导牙周炎的保护作用
在结扎前2周开始给予TEPP-46,持续至结扎后4或14天,检测骨丢失、炎症因子、破骨细胞和线粒体功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质组学 | Orbitrap Lumos质谱仪 | -- | -- |
| 串联质量标签(TMT)试剂 | -- | -- | |
| 代谢分析 | XF24细胞外流量分析仪 | -- | -- |
| Agilent Seahorse XF DMEM培养基 | Agilent | -- | |
| XF24胰岛捕获微板 | Agilent | 103518-100 | |
| 动物实验 | 链脲佐菌素(STZ) | Sigma-Aldrich | -- |
| 药物处理 | TEPP-46 | MedChemExpress | -- |
| 代谢分析 | 寡霉素 | -- | -- |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | -- | -- | |
| microCT | Scanco MicroCT40扫描仪 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白质组学分析 | 样本分组:无-轻度牙周炎组(n=8)和中-重度牙周炎组(n=8);血糖控制情况:无-轻度组HbA1c中位数7.4%,中-重度组6.7%。 阅读提示:Methods中Proteomic Analysis部分及Results第一部分,图1A-D |
| 糖尿病小鼠模型 | STZ剂量:50 mg/kg体重,连续5天;小鼠品系:雄性C57BL/6J;周龄:6-7周;血糖标准:≥350 mg/dL。 阅读提示:Methods中Animals部分 |
| 结扎诱导牙周炎模型 | 结扎线:7-0丝线;位置:上颌第二磨牙;时间:3个月后;观察时间点:4天和14天。 阅读提示:Methods中Ligature-Induced Periodontitis Model in Mice部分,图2、图4 |
| TEPP-46处理 | 给药方式:口服灌胃;剂量:50 mg/kg体重,每日一次;预处理起始时间:结扎前2周;持续时间:结扎后至处死。 阅读提示:Methods中Ligature-Induced Periodontitis Model in Mice部分,图4、图5 |
| 线粒体功能检测 | 组织准备:1 mm直径活检打孔器取牙龈;培养基:Agilent Seahorse XF DMEM(pH 7.4);线粒体压力测试注射:葡萄糖5 mmol/L、寡霉素1 μmol/L、FCCP 1.5 μmol/L、鱼藤酮1 μmol/L;糖酵解压力测试:无葡萄糖/丙酮酸/谷氨酰胺基底,注射低糖5 mmol/L、高糖20 mmol/L、鱼藤酮1 μmol/L、2-DG 50 mmol/L。 阅读提示:Methods中Glucose Flux in Mitochondria and Glycolysis部分 |