细胞培养与药物处理
建立体外血管内皮细胞模型,并施加氟西汀处理以观察其对细胞的影响。
HUVECs和HCAECs在特定培养基中培养,用20 μM氟西汀处理指定时间(12-24小时),对照使用DMSO(vehicle)。
Fluoxetine disrupts cholesterol metabolism in endothelial cells via SREBP2 activation
包含体外细胞模型(HUVEC/HCAEC)功能实验、RNA-seq、脂质组学、蛋白质组学(LiP-MS)、NanoSIMS定位、基因敲低和药理学抑制等多层级验证。
原代人脐静脉内皮细胞(HUVEC) 人冠状动脉内皮细胞(HCAEC)
氟西汀处理浓度和时间:20 μM处理12-24小时 SREBP2敲低使用siRNA(ON-TARGETplus pools) INSIG激动剂25-羟基胆固醇(25-HC)处理浓度 LDLR阻断使用anti-LDLR抗体(AF2255)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立体外血管内皮细胞模型,并施加氟西汀处理以观察其对细胞的影响。
HUVECs和HCAECs在特定培养基中培养,用20 μM氟西汀处理指定时间(12-24小时),对照使用DMSO(vehicle)。
鉴定氟西汀处理对内皮细胞基因表达的影响,尤其是脂质代谢相关通路。
对20 μM氟西汀或DMSO处理12小时的HUVECs进行mRNA测序(RNA-seq),并进行差异表达和通路富集分析。
验证氟西汀对细胞内脂质积累和胆固醇代谢的影响。
通过BODIPY染色、脂质组学(LC-MS和GC-MS)、游离及酯化胆固醇定量等检测脂滴、胆固醇和脂质种类变化。
确定氟西汀是否影响LDL经LDLR介导的摄取和跨内皮转运。
使用Dil标记的LDL检测细胞摄取,并通过Transwell模型检测LDL的跨内皮转运,同时用LDLR抗体阻断验证LDLR依赖性。
确定氟西汀在细胞内的分布及其对内质网结构和功能的影响。
使用NanoSIMS检测氟(19F)信号定位氟西汀;通过有限蛋白水解-质谱(LiP-MS)鉴定相互作用蛋白;免疫染色观察ER形态;嘌呤霉素掺入检测蛋白质翻译速率。
验证氟西汀是否激活SREBP2,并探究其激活依赖INSIG的机制。
通过免疫印迹检测SREBP2裂解形式(cSREBP2),并使用SREBP2靶基因表达和脂质积累作为下游指标;使用25-HC(INSIG激动剂)和siRNA敲低SREBP2验证必要性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞生长培养基 | PromoCell | -- |
| Ham's F12培养基 | Gibco | 21765037 | |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | S0615 | |
| 肝素 | AppliChem PanReac | A3004 | |
| 抗坏血酸 | Sigma-Aldrich | A4403 | |
| GlutaMax | Gibco | 35050038 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 内皮细胞生长添加剂 | Millipore | 02-102 | |
| MesoEndo细胞生长培养基 | PromoCell | 212-500 | |
| 明胶 | Sigma-Aldrich | 48723 | |
| 纤连蛋白 | Gibco | 33010018 | |
| 药物处理 | 氟西汀 | Santa Cruz | sc-201125 |
| 辛伐他汀 | Sigma-Aldrich | S6196 | |
| 舍曲林 | Sigma-Aldrich | S6319 | |
| 西酞普兰 | Sigma-Aldrich | C7861 | |
| U18666A | MedChemExpress | HY-107433 | |
| 25-羟基胆固醇 | Santa Cruz | sc-214091 | |
| 二甲基亚砜 | AppliChem PanReac | A3672 | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | P2864 |
| 脂质检测 | BODIPY 493/503 | Thermo Fisher Scientific | D3922 |
| 胆固醇定量 | Amplex Red胆固醇检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A12216 |
| LDL摄取和转运 | Dil标记低密度脂蛋白 | Thermo Fisher Scientific | L3482 |
| LDLR抗体 | R&D Systems | AF2255 | |
| LDL转运 | FITC-葡聚糖 | Sigma-Aldrich | FD40S |
| RT-qPCR | miRNeasy Mini Kit | Qiagen | 217004 |
| Maxima第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | K1671 | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Thermo Scientific | 4368708 | |
| siRNA敲低 | Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 |
| ON-TARGETplus siRNA池 | Horizon | L-009549-00-0005 | |
| Western blot | PVDF膜 | Thermo Fisher Scientific | 88520 |
| 显微镜观察 | Millicell EZ载玻片 | Sigma-Aldrich | PEZGS0896 |
| 细胞周期 | BD Cytofix/Cytoperm固定/透化试剂盒 | BD Biosciences | 554714 |
| 细胞迁移 | Ibidi 8孔腔室载玻片 | Ibidi | 80806 |
| 出芽实验 | 甲基纤维素 | Sigma-Aldrich | M0512 |
| 大鼠尾I型胶原 | Corning | 354236 | |
| 氧化应激检测 | DCFH-DA | Sigma-Aldrich | 35845 |
| MitoSOX Red | Thermo Fisher Scientific | M36007 | |
| 胆固醇流出 | 22-NBD胆固醇 | Sigma-Aldrich | SML3831 |
| RNA-seq | miRNeasy Mini Kit | Qiagen | 217004 |
| Illumina TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| NovaSeq 6000 | Illumina | -- | |
| 蛋白质组学 | Q Exactive HFX | Thermo Fisher Scientific | -- |
| NanoSIMS | NanoSIMS 50L | CAMECA | -- |
| 细胞成像 | Zeiss LSM 980(Airyscan 2) | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HUVEC和HCAEC的来源(PromoCell),培养基成分(ECGM或MesoEndo),培养氧浓度(3% O2),传代范围(3-10) 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture |
| 药物处理 | 氟西汀浓度(20 μM),处理时间(12-24小时),对照(DMSO) 阅读提示:Materials and Methods, Cell culture |
| RNA-seq和qPCR | RNA提取试剂盒(miRNeasy Mini Kit),测序平台(NovaSeq 6000),差异基因阈值(log2FC>0.5, p<0.05),内参基因(GAPDH) 阅读提示:Materials and Methods, RNA-seq analysis and qPCR |
| 脂质检测 | BODIPY染料浓度(10 μg/ml),染色时间(15分钟),脂质组学平台(LC-MS和GC-MS),胆固醇定量方法(Amplex Red) 阅读提示:Materials and Methods, Neutral lipid assessment and lipidomics |
| LDL摄取和转运 | Dil-LDL浓度(20 μg/ml),处理时间(6小时或过夜),LDLR抗体浓度(0.2 mg/ml),Transwell孔径(0.4 μm),TEER测量 阅读提示:Materials and Methods, LDL uptake and transcytosis assay |
| SREBP2激活验证 | SREBP2裂解检测(cSREBP2/pSREBP2 ratio),siRNA敲低条件(25 nM,24小时),25-HC浓度(1 μM) 阅读提示:Materials and Methods, siRNA knockdown and immunoblotting |