验证糖酵解-乳酸-乳酸化轴在DR视网膜血管病变中的作用
探究DR中糖酵解激活、乳酸积累和蛋白质乳酸化与视网膜血管病变的关系
检测DR大鼠视网膜中糖酵解酶HK2、PFKFB3、PKM2、LDHA的表达,测量视网膜和血清乳酸水平,检测Pan-Kla水平,并观察H-E染色、Evans blue血管渗漏和PAS染色等病理指标。
HMGA1 Lactylation-Mediated Regulation of the SP1/VEGFA Axis in Pathological Angiogenesis Under Diabetic Retinopathy
包含大鼠模型、细胞模型、乳酸化组学、CUT&Tag、ChIP-qPCR、功能回补等多层级验证。
Sprague-Dawley大鼠糖尿病视网膜病变模型 人视网膜微血管内皮细胞(HRMECs)
糖尿病大鼠模型用STZ诱导,剂量60 mg/kg,单次腹腔注射 HRMECs高糖处理浓度为30 mmol/L,处理48小时 DCA和ROT处理浓度分别为20 mmol/L和20 nmol/L,处理48小时 HMGA1 K74R突变体用于验证乳酸化功能
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究DR中糖酵解激活、乳酸积累和蛋白质乳酸化与视网膜血管病变的关系
检测DR大鼠视网膜中糖酵解酶HK2、PFKFB3、PKM2、LDHA的表达,测量视网膜和血清乳酸水平,检测Pan-Kla水平,并观察H-E染色、Evans blue血管渗漏和PAS染色等病理指标。
验证降低或升高乳酸水平能否改善或加重DR的血管功能障碍
使用DCA和ROT分别降低和升高DR大鼠体内乳酸水平,检测乳酸浓度和Pan-Kla水平,并评估H-E染色、Evans blue和PAS染色等病理变化。
探究HG条件下HRMECs中乳酸化水平变化及其对迁移、侵袭、成管和增殖的影响
HG培养HRMECs,检测糖酵解酶、乳酸和Pan-Kla水平,并通过DCA和ROT调节乳酸水平,进行划痕、Transwell、成管和EdU实验评估功能变化。
鉴定DR大鼠视网膜中发生差异乳酸化的蛋白质,并筛选关键候选蛋白
对DR和对照大鼠视网膜进行乳酸化组学分析,鉴定差异乳酸化位点和蛋白质,GO分析,并通过质谱确认HMGA1 K55和K74位点的乳酸化。
确定HMGA1 K74乳酸化是否特异性促进HRMECs的迁移、侵袭、成管和增殖
利用shRNA敲低HMGA1,并过表达野生型(WT)或K74R突变体,检测HMGA1乳酸化水平及细胞功能变化。
验证HMGA1 K74乳酸化在DR模型和高糖处理细胞中的特异性上调
使用特异性抗体HMGA1-K74la检测DR大鼠视网膜和HG处理的HRMECs中的水平,并观察DCA和ROT对其的影响。
阐明HMGA1乳酸化如何通过调控SP1转录影响VEGFA表达和血管生成
通过CUT&Tag和ChIP-qPCR检测HMGA1在SP1启动子的结合,RT-qPCR和Western blot检测SP1和VEGFA表达,双荧光素酶报告基因检测启动子活性,并通过SP1敲低和回补实验验证其下游作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体 | 泛赖氨酸乳酸化抗体 | PTM Biolabs | PTM-1401 |
| CD31抗体 | Servicebio | GB12063 | |
| 己糖激酶2抗体 | Zenbio | R24552 | |
| 6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶3抗体 | Zenbio | R382181 | |
| 乳酸脱氢酶A抗体 | Zenbio | R380954 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Servicebio | ZB15001 | |
| HMGA1抗体 | Abcam | ab252930 | |
| Flag抗体 | Proteintech | 20543-1-AP | |
| HMGA1-K74乳酸化抗体 | Tsingke Biotechnology | -- | |
| SP1抗体 | Proteintech | 21962-1-AP | |
| VEGFA抗体 | Zenbio | R26073 | |
| IgG抗体 | Proteintech | 30000-0-AP | |
| 细胞培养 | 人视网膜微血管内皮细胞 | Procel | CP-H130 |
| 内皮细胞培养基 | Sciencell | 1001 | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010 |
| 细胞培养 | sh-HMGA1慢病毒 | Shanghai GeneChem | -- |
| 基因敲低 | SP1靶向siRNA | Shanghai Sangon Biotech | -- |
| 糖尿病模型诱导 | 链脲佐菌素 | Sigma | S0130 |
| 药物处理 | 鱼藤酮 | Rhawn | R006873 |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | l3000015 |
| 免疫荧光 | 抗淬灭封片剂 | Servicebio | G1401 |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 |
| 血管生成实验 | 基质胶 | Corning | 356234 |
| 乳酸化富集 | 泛赖氨酸乳酸化抗体树脂 | PTM Biolabs | PTM-1404 |
| 乳酸检测 | L-乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A019-2-1 |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Genstar | P130-01 |
| 逆转录 | 逆转录混合试剂 | Genstar | A240-10 |
| qPCR | SYBR Green I qPCR混合试剂 | Genstar | A308-05 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | BersinBio | Bes5001 |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Yeasen | 11402ES |
| 增殖检测 | BeyoClick EdU-488试剂盒 | Beyotime | C0071S |
| 显微镜 | 荧光/光学显微镜 | Carl Zeiss AG | Axio Vert.A1 |
| 共聚焦显微镜 | 共聚焦显微镜 | Carl Zeiss AG | LSM880 |
| 质谱 | 质谱仪 | Bruker Daltonics | timsTOF HT |
| Western blot成像 | 蛋白质印迹成像系统 | Tanon | TanonFine Dox6 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 糖尿病大鼠模型 | STZ剂量(60 mg/kg)、给药方式(单次腹腔注射)、大鼠品系、性别、年龄和体重 阅读提示:Methods: Diabetic Rat Modeling and Treatment |
| 药物处理 | DCA剂量(200 mg/kg)、ROT剂量(1.5 mg/kg)、给药频率(每3天一次)、持续时间(8周)和对照(DMSO) 阅读提示:Methods: Diabetic Rat Modeling and Treatment |
| 细胞培养与处理 | HRMECs培养条件、高糖浓度(30 mmol/L)、处理时间(48小时) 阅读提示:Methods: Cell Culture and Treatment |
| 体外功能实验 | 划痕实验时间(0和48小时)、Transwell侵袭实验细胞数(2×10^4)、Matrigel用量、成管实验细胞数(1×10^5)和培养时间(6-8小时) 阅读提示:Methods: Cell Migration Assay, Cell Invasion Assay, In Vitro Angiogenesis Assay |
| 机制验证 | sh-HMGA1慢病毒MOI(15)、转染试剂(Lipofectamine 3000)、ChIP-qPCR抗体(HMGA1, SP1)和引物序列 阅读提示:Methods: Lentiviral Infection and Plasmid Transfection, Chromatin Immunoprecipitation–qPCR, Supplementary Table 1 |