药物筛选
从FDA批准的药物中识别能够逆转卵巢癌腹水诱导的T细胞免疫抑制的化合物。
将人类T细胞与患者腹水共培养建立免疫抑制模型,进行高通量筛选,鉴定SIK抑制剂为候选免疫激活剂。
Inhibition of salt-inducible kinases reprograms T cells and antitumor immunity in ovarian cancer
包含全人源药物筛选、同系小鼠模型(BeCon和PPM)体内疗效验证、T细胞特异性基因敲除、单细胞多组学及机制研究,且具有明确的功能和机制验证。
BeCon(ID8-Defb29/Vegf-A)小鼠模型 PPM(Trp53-/- Pten-/- MycOE)小鼠模型 人类原代T细胞与患者腹水共培养模型 Sik2/Sik3条件敲除小鼠模型
SIK抑制剂YKL-05-099的剂量(6 mg/kg)及给药方式(腹腔注射) BeCon和PPM肿瘤细胞的接种量(0.5-1×10^5和1.0×10^6) T细胞耗竭或过继转移的时间点及细胞数量 SIK抑制剂与抗PD-1联合治疗的给药方案 Sik2/Sik3敲除的诱导条件及效率验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从FDA批准的药物中识别能够逆转卵巢癌腹水诱导的T细胞免疫抑制的化合物。
将人类T细胞与患者腹水共培养建立免疫抑制模型,进行高通量筛选,鉴定SIK抑制剂为候选免疫激活剂。
评估SIK抑制剂在两种同系卵巢癌小鼠模型中的治疗效果。
使用BeCon和PPM模型,腹腔注射SIK抑制剂YKL-05-099,评估生存期、腹水、肿瘤重量等指标。
证明SIK抑制剂的治疗效果依赖于宿主免疫系统,特别是T细胞。
在免疫缺陷NSG小鼠和T细胞耗竭的FVB小鼠中重复上述实验,观察疗效消失。
通过条件性敲除SIK2/3验证T细胞内在SIK信号在免疫抑制中的作用。
使用Cre-LoxP系统在CD4或CD8 T细胞中诱导敲除Sik2/3,并评估对卵巢癌进展的影响。
阐明SIK信号如何在T细胞中介导免疫抑制的分子机制。
通过单细胞RNA测序、代谢分析、免疫印迹等方法,鉴定下游效应分子(TXNIP、ZFP36L2、LYST)。
检测SIK抑制剂与PD-1阻断联合治疗的协同效果。
在两种卵巢癌模型中,单独或联合给予SIK抑制剂和抗PD-1抗体,评估生存期和肿瘤负荷。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | YKL-05-099 | MedChemExpress | -- |
| ARN-3236 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| GlutaMAX | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 4-羟基他莫昔芬 | Sigma Aldrich | -- |
| 他莫昔芬 | -- | -- | |
| 细胞刺激 | 抗CD3/CD28磁珠 | Life Technologies | -- |
| PMA/离子霉素 | -- | -- | |
| 细胞因子检测 | IFN-γ ELISA试剂盒 | Life Technologies | -- |
| 流式分析 | 抗IFN-γ抗体 | BioLegend | -- |
| 抗颗粒酶B抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗TNF-α抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗IL-2抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗PD-1抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗PD-L1抗体 | BioLegend | -- | |
| 免疫印迹 | 抗磷酸化SIK1/2/3抗体 | Abcam | ab199474 |
| 抗磷酸化HDAC4/5/7抗体 | Cell Signaling Technology | 3443S | |
| 抗磷酸化CRTC2抗体 | Abcam | ab203187 | |
| 抗TXNIP抗体 | Cell Signaling Technology | 14715S | |
| 抗磷酸化LKB1抗体 | Cell Signaling Technology | 3047S | |
| 抗总LKB1抗体 | Cell Signaling Technology | 3482S | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4967S | |
| 抗SIK2抗体 | Cell Signaling Technology | 6919S | |
| 抗SIK3抗体 | Abcam | ab255701 | |
| 抗SIK1抗体 | Life Technologies | 51045-1-AP | |
| 细胞分离 | Ficoll密度梯度离心 | GE Healthcare | -- |
| Pan-T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- | |
| RNA提取 | RNeasy微型试剂盒 | Qiagen | -- |
| RNA-seq | Illumina TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 单细胞测序 | 10x Genomics Chromium控制器 | 10x Genomics | PN-120270 |
| Chromium Next GEM 单细胞3' GEM、文库和凝胶珠试剂盒v3.1 | 10x Genomics | PN-1000121 | |
| 流式细胞术 | CytoFLEX LX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 细胞分选 | FACSAria II分选仪 | BD Biosciences | -- |
| qPCR | QuantStudio 6 Flex实时PCR仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 成像 | Xenogen IVIS-200 Spectrum活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 酶标仪 | Envision多标记微孔板检测仪 | PerkinElmer | -- |
| 组织成像 | 蔡司Axio Observer 7显微镜 | Carl Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(BeCon、PPM)的培养条件、培养基、血清浓度 阅读提示:Methods: Cell Lines and Culture Conditions |
| 药物处理 | SIK抑制剂(YKL-05-099、ARN-3236)的剂量、给药途径、频率 阅读提示:Methods: Ovarian Cancer Mouse Models |
| 体内肿瘤模型 | 肿瘤细胞接种数量、小鼠品系(C57BL6、FVB、NSG)、肿瘤模型(BeCon、PPM) 阅读提示:Methods: Ovarian Cancer Mouse Models |
| 免疫细胞分析 | 抗体克隆、荧光标记、刺激条件、孵育时间 阅读提示:Methods: Flow cytometry and cell sorting |
| 基因敲除 | Cre品系、诱导剂(他莫昔芬)的剂量和时间 阅读提示:Methods: Ovarian Cancer Mouse Models、Mice |
| 联合治疗 | 抗PD-1抗体的剂量、给药时间 阅读提示:Methods: Ovarian Cancer Mouse Models |