妊娠早期基因表达谱分析
确定E2受体和妊娠相关基因在猪胚胎/滋养层不同发育阶段的表达模式
收集妊娠第10-25天的猪胚胎/滋养层组织,分为四个阶段(第10-12天、14-16天、17-19天、20-25天),提取RNA,通过RT-qPCR检测ESR1、ESR2、GPER1、FOXO3、GDF15、SERPINE1、ESRRA、ESRRB、ESRRG的表达。
Estradiol-17β, a key embryonic signal, regulates gene expression and cellular functions in the porcine trophoblast
包含体内表达谱分析(不同妊娠天数概念/滋养层)及体外细胞实验(基因表达、增殖、粘附、蛋白磷酸化),并利用受体拮抗剂和信号通路抑制剂进行功能与机制验证。
猪原代滋养层细胞(妊娠第12天和第15天) 猪胚胎/滋养层组织(妊娠第10-25天)
E2处理浓度:10、100、1000 nM 雌激素受体拮抗剂ICI 182,780浓度:1 μM 信号通路抑制剂浓度:MAPK抑制剂PD 098059 25 μM,PI3K/AKT抑制剂LY 294002 25 μM,AKT抑制剂2.5 μM,mTOR抑制剂雷帕霉素50 nM 细胞增殖检测使用CellTiter 96 AQueous One Solution,每个处理三个技术重复,生物学重复数n=6(第12天)或n=12(第15天) 细胞粘附检测使用Millicoat Cell Adhesion Strips,每个处理两个技术重复,生物学重复数n=14
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定E2受体和妊娠相关基因在猪胚胎/滋养层不同发育阶段的表达模式
收集妊娠第10-25天的猪胚胎/滋养层组织,分为四个阶段(第10-12天、14-16天、17-19天、20-25天),提取RNA,通过RT-qPCR检测ESR1、ESR2、GPER1、FOXO3、GDF15、SERPINE1、ESRRA、ESRRB、ESRRG的表达。
检测E2是否剂量依赖性地影响猪滋养层细胞中受体和妊娠相关基因的表达
从妊娠第12天和第15天的猪取得原代滋养层细胞,培养至80%融合后,用不同浓度E2(0、10、100、1000 nM)处理24小时,收获RNA,RT-qPCR检测基因表达。
确认E2对基因表达的作用是否由核雌激素受体介导
滋养层细胞在E2(100 nM)存在或不存在下,加入或未加入雌激素受体拮抗剂ICI 182,780(1 μM)处理24小时,检测基因表达变化。
评估E2对滋养层细胞增殖和粘附的影响,并确定涉及的信号通路
滋养层细胞用E2(10、100、1000 nM)处理,并结合各种抑制剂(ICI、MAPK、PI3K/AKT、AKT、mTOR抑制剂)进行增殖实验(96孔板,CellTiter 96)和粘附实验(Millicoat strips),分别测定24小时后的增殖和粘附能力。
检测E2是否激活MAPK1/3和PTK2蛋白的磷酸化,并验证受体依赖性
滋养层细胞用E2(10、100、1000 nM)处理10分钟,有或无ICI,裂解后通过Western blot检测MAPK1/3和PTK2的磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | M199培养基 | Merck | -- |
| 牛血清白蛋白 | SERVA Electrophoresis GmbH | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Merck | -- | |
| 新生牛血清 | Merck | -- | |
| 胰蛋白酶 | Biomed | -- | |
| 胶原包被6孔板 | Corning | -- | |
| 药物处理 | 雌二醇-17β | Merck | -- |
| ICI 182,780(氟维司群) | Merck | -- | |
| PD 098059(MAPK抑制剂) | Merck | -- | |
| LY 294002(PI3K抑制剂) | Merck | -- | |
| AKT抑制剂 | Merck | -- | |
| 雷帕霉素 | Merck | -- | |
| RNA提取 | Fenozol缓冲液 | A&A Biotechnology | -- |
| RT-qPCR | Power SYBR Green荧光染料 | Life Technologies | -- |
| TaqMan探针 | Life Technologies | -- | |
| 增殖检测 | CellTiter 96 AQueous One Solution细胞增殖检测试剂盒 | Promega | -- |
| 粘附检测 | Millicoat细胞粘附条 | Millipore | ECM101 |
| Western blot | Clarity Western ECL底物 | Bio-Rad | -- |
| FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| 磷酸化FAK(Tyr397)抗体 | Cell Signaling Technology | 3283 | |
| P44/42 MAPK (Erk1/2)抗体 | Cell Signaling | 9102S | |
| 磷酸化p44/42 MAPK (Erk1/2) Thr202/Tyr204抗体 | Cell Signaling | 9101 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 免疫星抗兔IgG-HRP偶联物 | Bio-Rad Laboratories | 1705046 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞分离条件:0.25%胰蛋白酶消化时间(第12天15分钟,第15天30分钟);培养基:无酚红M199,10%去除内源性类固醇的NCS;培养温度37℃,5% CO2 阅读提示:Methods: Isolation and culture of porcine primary trophoblast cells |
| 基因表达实验 | E2处理浓度(10、100、1000 nM)和处理时间(24小时);对照条件(0.01%乙醇) 阅读提示:Methods: E2 treatment and gene expression analysis; Figure 2 and 3 legends |
| 增殖试验 | 细胞接种密度(0.3×10^5细胞/孔);E2处理浓度(10-1000 nM);抑制剂浓度(ICI 1 μM,MAPK inhibitors 25 μM,PI3K抑制剂25 μM,AKT抑制剂2.5 μM,mTOR抑制剂50 nM);处理时间24小时;重复数(第12天n=6,第15天n=12) 阅读提示:Methods: Proliferation assay; Figure 6 legend |
| 粘附试验 | 细胞预处理密度(0.5×10^6细胞/孔);E2(10-1000 nM)和抑制剂(ICI 1 μM,MAPK抑制剂25 μM,PI3K抑制剂25 μM)处理24小时;检测时细胞密度0.4×10^5细胞/孔;孵育2小时;重复数n=14 阅读提示:Methods: Adhesion assay; Figure 7 legend |
| 蛋白磷酸化检测 | 细胞密度(0.5×10^6细胞/孔);E2处理时间10分钟;抑制剂ICI 1 μM;蛋白上样量50 μg;抗体稀释度(见Table 2) 阅读提示:Methods: Phosphorylation of MAPK1/3 and PTK2; Western blot; Table 2 |