白细胞介素-2转录组表达与晚期癌症患者生存期延长及GNAS改变相关
Interleukin-2 transcriptomic expression correlates with prolonged survival and with GNAS alterations in patients with advanced cancers
背景:白细胞介素-2(IL-2)是一种关键的免疫调节分子。本研究分析了晚期/转移性癌症中IL-2 RNA表达及其与免疫标志物、基因改变和预后的相关性。
患者与方法:我们通过 OmniSeq 临床级实验室(加州大学圣地亚哥分校队列)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库研究了 IL-2 转录数据。UCSD 队列的转录组模式相对于参考人群(n = 735)进行相对化,并以百分位数表示。在 CRISPR-Cas9 工程化的 GNAS 突变 Caco-2 细胞系中,通过酶联免疫吸附测定测量 IL-2 水平。
结果:在 514 名患者中,14.6% 的患者 IL-2 RNA 表达高(≥75th 百分位数),35% 的患者 IL-2 表达低于第 1 百分位数。IL-2 表达(大于或等于第 1 百分位数 RNA 排名)与免疫检查点(TIM-3, BTLA)、IL-2Rγ 亚基以及 ERBB2、GNAS 和 NF1 畸变的高表达显著/独立相关。IL-2 RNA 表达增加(多变量线性回归)与 GNAS 改变的可能性增加相关(P = 0.02)。GNASR201C 突变(CRISPR)细胞系显示出比对照组显著更高的 IL-2 水平。IL-2 表达是总生存期(OS)的独立正向预后因素 [n = 489 名具有临床数据的 UCSD 患者,风险比 (HR) 0.74,95% 置信区间 (CI) 0.57-0.96,P = 0.02,多变量],并且在 TCGA 队列中与更长的 OS 显著相关(n = 9869,HR 0.84,95% CI 0.79-0.91,P < 0.001)。
结论:高 IL-2 组织转录水平与晚期癌症患者以及具有 GNAS 改变的患者的更好预后相关;后一发现通过 CRISPR 编辑的 GNASR201C 细胞产生的 IL-2 增加得到证实,表明该突变与 IL-2 之间存在功能性相互作用。