EV分离与表征
获取并验证胎盘滋养层EVs和THP-1单核细胞EVs的形态、标志物及尺寸。
从胎盘外植体和THP-1细胞条件培养基中通过差速离心分离大小EVs,并用电镜、Western blot和纳米颗粒跟踪分析进行表征。
Placenta-derived trophoblast extracellular vesicles contain unique miRNAs that inhibit ovarian cancer cell growth
包含体外细胞实验(SKOV-3细胞活力、miRNA模拟物转染、EV摄取抑制)和转录组测序分析,但缺乏体内动物模型或第三类证据层级,机制验证主要依赖靶基因表达变化。
SKOV-3卵巢癌细胞系 THP-1单核细胞系(对照EV来源) 第一孕期胎盘滋养层外植体(EV来源)
SKOV-3细胞处理浓度:250 μg蛋白/mL(EVs) miRNA模拟物转染浓度:50 nM EV摄取抑制方法:0.25%胰蛋白酶处理EVs miRNA靶基因验证:PTGES、NR5A2、GFI1 统计设计:三次独立实验,每次三重复,p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取并验证胎盘滋养层EVs和THP-1单核细胞EVs的形态、标志物及尺寸。
从胎盘外植体和THP-1细胞条件培养基中通过差速离心分离大小EVs,并用电镜、Western blot和纳米颗粒跟踪分析进行表征。
鉴定胎盘滋养层EVs中独特存在的miRNAs。
对来自胎盘滋养层和THP-1单核细胞的EVs进行小RNA测序,比较miRNA表达谱,筛选出仅在滋养层EVs中表达的miRNAs。
通过RT-qPCR确认测序结果中独特miRNAs的存在。
选取7个miRNAs(hsa-miR-519a-5p等),提取EV RNA,使用RT-qPCR检测表达。
验证滋养层EVs对卵巢癌细胞活力的抑制作用及其依赖性。
用完整EVs或胰蛋白酶处理的EVs处理SKOV-3细胞,检测细胞活力变化,并用荧光显微镜观察EV摄取。
确认EV递送miRNAs进入卵巢癌细胞。
用完整或胰蛋白酶处理的EVs处理SKOV-3细胞,RT-qPCR检测细胞内7种miRNA的水平。
探究EV处理对SKOV-3细胞mRNA表达谱的影响。
对EV处理的SKOV-3细胞进行mRNA测序,分析差异表达基因及富集通路。
验证独特miRNAs是否下调预测的靶基因。
利用TargetScan和miRDB预测靶基因,并通过RT-qPCR检测EV处理后SKOV-3细胞中靶基因mRNA表达。
阐明单个或组合miRNA对卵巢癌细胞活力的影响。
将miRNA模拟物(单一或组合)转染至SKOV-3细胞,检测细胞活力变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EV分离 | 胎盘滋养层EVs的分离方法:差速离心转速(2000g、20000g、100000g)及时间(5min、60min);培养条件(Advanced DMEM/F12,2% FBS,1% P/S,37°C,5% O2过夜) 阅读提示:Materials and methods: Placental trophoblast EV preparation |
| EV表征 | EV标志物检测:CD63、CD9、细胞角蛋白阳性;钙联蛋白、波形蛋白阴性;粒径范围(大EV 100-1000nm,小EV 30-100nm,模式大小约140nm和100nm) 阅读提示:Results: Characterization of trophoblast and THP-1 monocyte-derived EVs; Supplementary Figure S1 |
| miRNA测序分析 | EV RNA提取方法(Magzol试剂)、测序平台(Illumina HiSeq 2500)、数据分析流程(miRBase、Rfam、miRDeep2)、独特miRNA筛选标准(RPM>0且在THP-1 EVs中不表达) 阅读提示:Materials and methods: miRNA sequencing and analysis |
| 细胞处理 | SKOV-3细胞培养条件(DMEM+10% FBS+1% P/S)、EV处理浓度(250 μg蛋白/mL)、处理时间(24 h) 阅读提示:Materials and methods: mRNA sequencing of SKOV-3 cells treated with placental-derived trophoblast EVs; Viability assay |
| EV摄取阻断 | 胰蛋白酶处理条件(0.25% w/v,37°C,30min)以去除EV表面蛋白 阅读提示:Materials and methods: Placental trophoblast EV preparation |
| miRNA转染 | miRNA模拟物浓度(50 nM)、转染试剂(Lipofectamine 3000)、转染时间(6h后换液,继续培养18h) 阅读提示:Materials and methods: Transfection of SKOV3 cells with miRNA mimics |
| RT-qPCR | 内参(U6、5S rRNA、GAPDH、ACTB)、定量方法(2^-ΔΔCT) 阅读提示:Materials and methods: Measurement of miRNAs in SKOV-3 cells after exposure to placental trophoblast EVs; Measurement of mRNA levels in SKOV3 cells after exposure to placental trophoblast EVs |