构建与鉴定Bnc1突变小鼠模型
评估Bnc1突变对小鼠生精功能和生育力的影响。
利用Bnc1+/tr小鼠交配产生Bnc1+/+、Bnc1+/tr和Bnc1tr/tr后代,通过H&E染色、免疫荧光等方法分析睾丸组织学、精原细胞数量及凋亡情况。
BNC1 deficiency induces mitochondrial dysfunction-triggered spermatogonia apoptosis through the CREB/SIRT1/FOXO3 pathway: the therapeutic potential of nicotinamide riboside and metformin†
包含体外细胞模型(GC-1、HEK293)、体内动物模型(Bnc1tr/tr小鼠)及患者样本分析;进行了功能验证(凋亡、线粒体功能)和机制验证(ChIP-qPCR、荧光素酶报告基因、Western blot)。
GC-1小鼠精原细胞系 Bnc1tr/tr小鼠模型 HEK293细胞系
Bnc1tr/tr小鼠的构建:4号外显子5 bp (CCGGG) 缺失导致移码突变 NR给药剂量:400 mg/kg/day,灌胃,持续8周 二甲双胍给药剂量:300 mg/kg/day,灌胃,持续8周 GC-1细胞处理浓度:NAD+ 200 μM,NR 500 μM,二甲双胍 200 μM 体内实验分组:Bnc1+/+ + N.S.,Bnc1tr/tr + N.S.,Bnc1tr/tr + NR,Bnc1tr/tr + Metformin
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Bnc1突变对小鼠生精功能和生育力的影响。
利用Bnc1+/tr小鼠交配产生Bnc1+/+、Bnc1+/tr和Bnc1tr/tr后代,通过H&E染色、免疫荧光等方法分析睾丸组织学、精原细胞数量及凋亡情况。
确定Bnc1缺失是否直接导致精原细胞凋亡。
在GC-1细胞中通过siRNA敲低Bnc1,利用流式细胞术和Western blot检测凋亡率及凋亡相关蛋白表达。
探究Bnc1突变是否导致精原细胞线粒体功能障碍。
通过透射电镜观察线粒体形态,JC-1染色检测线粒体膜电位,ROS检测试剂盒评估ROS水平,并分析RNA-seq数据中富集的线粒体相关通路。
验证BNC1是否通过调控CREB/SIRT1/FOXO3通路引发线粒体功能障碍。
通过ChIP-qPCR和荧光素酶报告基因验证BNC1直接结合Creb启动子;通过Western blot、免疫沉淀和qRT-PCR检测通路蛋白表达及下游靶基因。
评估NAD+、NR和二甲双胍在体外对Bnc1敲低精原细胞凋亡和线粒体功能的影响。
在Bnc1敲低GC-1细胞中加入NAD+、NR或二甲双胍,通过流式细胞术、Western blot、JC-1等检测凋亡和线粒体功能变化。
评估口服NR或二甲双胍对Bnc1tr/tr小鼠生精功能和生育力的影响。
4周龄Bnc1tr/tr小鼠随机分组,灌胃NR或二甲双胍8周,检测睾丸形态、精子参数、凋亡、SIRT1表达及生育力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 动物实验 | 烟酰胺核苷 | MCE | HY-123033A |
| 细胞培养 | NAD+ | -- | -- |
| GC-1细胞系 | Procell | CL-0600 | |
| HEK293细胞系 | ATCC | CRL-1573 | |
| FACS | Hoechst-33342染料 | Solarbio | CA1120 |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染料 | Beyotime | P0131 |
| SYCP3抗体 | Abcam | Ab97672 | |
| γH2AX抗体 | Sigma-Aldrich | 05-636-I | |
| Alexa Fluor 594偶联驴抗兔IgG二抗 | Jackson | 711-585-152 | |
| Alexa Fluor 488偶联山羊抗鼠IgG二抗 | ThermoFisher | A-11001 | |
| Cleaved caspase3抗体 | CST | 9664 | |
| GFRα1抗体 | R&D | AF560 | |
| PLZF抗体 | Santa Cruz | sc28319 | |
| cKit抗体 | R&D | AF1356 | |
| SOX9抗体 | AB clonal | A19710 | |
| Alexa Fluor 488偶联驴抗山羊IgG二抗 | Abcam | ab150129 | |
| 免疫组织化学 | 细胞色素c抗体 | CST | 4272S |
| SIRT1抗体 | Proteintech | 13161-1-AP | |
| Caspase 3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| 即用型山羊抗兔/鼠通用二抗 | Haoke | HKI0029 | |
| CASA | M199培养基 | KeyGEN BioTECH | KGM31100N |
| TOX IVOS精子分析仪 | -- | -- | |
| 免疫沉淀 | NP-40裂解液 | Beyotime | P0013F |
| PMSF | Biosharp | P0100 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物I | MCE | HY-K0021 | |
| FOXO3抗体 | Proteintech | 66428-1-Ig | |
| 兔IgG | CST | 2729 | |
| Protein A/G PLUS-琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 | |
| 乙酰化赖氨酸抗体 | Proteintech | 66289-1-Ig | |
| NAD+检测 | NAD+/NADH检测试剂盒 | Beyotime | S0175 |
| 转染 | jet-PRIME转染试剂 | Polyplus transfection | 101000046 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000015 | |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | -- | -- | |
| Hoechst染料 | Beyotime | C1028 | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染料 | Beyotime | C2003S |
| ChIP-qPCR | ChIP检测试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| Flag抗体 | Proteintech | 20543-1-AP | |
| SYBR Green染料 | Vazyme | Q711-02 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| HiScript II Q Select RT SuperMix Kit | Vazyme | R233 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂 | Thermo Fisher | 23225 | |
| FuturePAGE 4-20%预制胶 | ACE Biotechnology | ET15412Gel | |
| 硝酸纤维素膜 | Millipore | HATF00010 | |
| BNC1抗体 | Aviva | ARP33283_P050 | |
| Caspase 9抗体 | HuaBio | ER600008 | |
| BAX抗体 | HuaBio | ET1603-34 | |
| BCL2抗体 | HuaBio | ER1802-97 | |
| CREB抗体 | Proteintech | 12208-1-AP | |
| p-CREB抗体 | Abcam | ab32096 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| HRP标记山羊抗小鼠IgG二抗 | BIOKER | BK-M050 | |
| HRP标记山羊抗兔IgG二抗 | BIOKER | BK-R050 | |
| BIO-RAD ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BD Pharmingen | 556547 |
| CytoFLEX LX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 透射电子显微镜 | Leica UC7切片机 | Leica | -- |
| Tecnai G2 Spirit 120 kV透射电镜 | FEI | -- | |
| RNA-seq | Illumina Novaseq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | Bnc1tr/tr小鼠的基因型鉴定;突变位点确认(4号外显子5 bp缺失) 阅读提示:Methods and materials - Experimental animal care and ethics |
| 药物处理 | NR给药剂量400 mg/kg/day,二甲双胍给药剂量300 mg/kg/day,灌胃频率每日一次,持续8周 阅读提示:Methods and materials - Experimental animal care and ethics |
| 细胞处理 | GC-1细胞中Bnc1敲低;NAD+、NR和二甲双胍的处理浓度(200、500、200 μM),处理时间24小时 阅读提示:Methods and materials - Cell lines and cell culture; Results - Figure 4 legend |
| 凋亡检测 | TUNEL染色(PD6、8周),凋亡相关蛋白Western blot(BAX, BCL2, cytochrome c, cleaved caspase 3, cleaved caspase 9) 阅读提示:Methods and materials - Deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling assay; Results - Figure 1 legend |
| 线粒体功能检测 | JC-1染色评估线粒体膜电位,ROS检测(DCFH-DA) 阅读提示:Methods and materials - Measurement of reactive oxygen species; Measurement of mitochondrial membrane potential |
| 机制验证 | ChIP-qPCR和荧光素酶报告基因验证BNC1与Creb启动子结合;Western blot检测CREB/SIRT1/FOXO3通路蛋白 阅读提示:Methods and materials - Chromatin immunoprecipitation–quantitative polymerase chain reaction; Luciferase reporter assay; Results - Figure 3 legend |
| 生育力评估 | 生育力测试(雌鼠与8周龄C57BL/6雌鼠交配,持续4天,观察阴道栓,监测21天产仔数) 阅读提示:Methods and materials - Fertility test |