TIR8在肝脏中的表达分析
验证TIR8在NASH进展中的表达变化
利用GEO数据库(GSE164760)分析正常人和NASH患者肝组织TIR8 mRNA表达;在HepaRG细胞中用FFA处理并检测TIR8表达;在WD喂养的小鼠肝脏中检测TIR8 mRNA和蛋白水平。
TIR8 protects against nonalcoholic steatohepatitis by antagonizing lipotoxicity-induced PPARα downregulation and reducing the sensitivity of hepatocytes to LPS
包含体内小鼠模型(TIR8KO和TIR8过表达)和体外细胞实验(HepaRG),并进行功能验证(脂质积累、炎症指标)和机制验证(PPARα、PSMA4相互作用)。
雄性C57BL/6J小鼠 TIR8敲除(TIR8KO)小鼠 HepaRG细胞
Western diet(WD)喂养16周诱导NASH模型 TIR8敲除或过表达对肝脂质积累和炎症的影响 FFA(油酸:棕榈酸=2:1,100 nM)处理HepaRG细胞48或72小时 LPS(100 ng/ml)处理HepaRG细胞 PSMA4阻断肽(PBP)预处理24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TIR8在NASH进展中的表达变化
利用GEO数据库(GSE164760)分析正常人和NASH患者肝组织TIR8 mRNA表达;在HepaRG细胞中用FFA处理并检测TIR8表达;在WD喂养的小鼠肝脏中检测TIR8 mRNA和蛋白水平。
评估TIR8缺失对饮食诱导的肝脂肪变性和炎症的影响
对TIR8KO小鼠和野生型小鼠给予STD或WD饮食16周,检测体重、肝重、血糖、肝脂质、血清ALT/AST,并进行组织学分析(H&E、Oil Red O、Picrosirius red)。
评估TIR8过表达对饮食诱导的肝脂肪变性和炎症的保护作用
通过尾静脉注射AAV-TIR8构建TIR8过表达小鼠(TIR8tg),给予STD或WD饮食16周,并检测与TIR8KO实验相同的指标。
验证TIR8在FFA应激下对PPARα表达和脂质积累的影响
在HepaRG细胞中过表达或敲低TIR8,用FFA处理,检测PPARα蛋白和mRNA水平、脂质积累(Oil Red O染色和TG含量)以及PPARα靶基因表达。
评估TIR8在脂毒性环境下对LPS诱导炎症反应的影响
在HepaRG细胞中过表达或敲低TIR8,先用FFA预处理,再暴露于LPS,检测炎症因子表达和NF-κB p65磷酸化。
阐明脂毒性导致TIR8降解的分子机制
通过免疫共沉淀和质谱鉴定TIR8相互作用蛋白,验证TIR8与PSMA4的相互作用;用PSMA4阻断肽预处理细胞,检测TIR8和PPARα水平及脂质积累。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | Vital River Laboratories | -- |
| TIR8敲除小鼠 | Cyagen Biosciences | -- | |
| AAV-TIR8 | Genechem | -- | |
| AAV8 | Genechem | -- | |
| 细胞培养 | HepaRG细胞 | Procell Life Science & Technology | -- |
| RPMI1640培养基 | Bioind | -- | |
| 胎牛血清 | Bioind | -- | |
| 细胞转染 | 慢病毒 | Genepharma | -- |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 组织学分析 | DAPI | Beyotime Biotechnology | C1005 |
| 油红O染色试剂盒 | Sigma Aldrich | MAK194-1KT | |
| 细胞油红O染色试剂盒 | Solarbio | G1262 | |
| 生化检测 | ALT检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | C009-2-1 |
| AST检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | C010-2-1 | |
| 甘油三酯检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 | |
| 总胆固醇检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 | |
| 蛋白检测 | 抗TIR8抗体 | Abcam | ab228977 |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab115777 | |
| 抗PSMA4抗体 | Abcam | ab191403 | |
| 抗Flag标签抗体 | Abcam | ab18230 | |
| 抗PPARα抗体 | Boster Biotechnology | BA1693-2 | |
| 抗Histone H3抗体 | Boster Biotechnology | M12477-16 | |
| 磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033S | |
| 总p65抗体 | Cell Signaling Technology | #4764 | |
| Alexa Fluor 488标记小鼠IgG | Cell Signaling Technology | #4408 | |
| Alexa Fluor 594标记兔IgG | Cell Signaling Technology | #8889 | |
| 碱性磷酸酶标记二抗 | Proteintech | SA00002-1 | |
| RNA提取 | EasyPure RNA试剂盒 | Transgen Biotech | ER01-01 |
| cDNA合成 | cDNA合成SuperMix试剂盒 | Transgen Biotech | AT341-02 |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Transgen Biotech | AQ142-21 |
| 引物 | Sangon Biotech | -- | |
| 免疫共沉淀 | Protein G免疫沉淀试剂盒 | Roche | IP50-1KT |
| 蛋白提取 | 裂解缓冲液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白检测 | BCIP/NBT碱性磷酸酶显色试剂盒 | -- | -- |
| 糖原染色 | 天狼星红 | Solabio | -- |
| 机制研究 | PSMA4阻断肽 | Gene Tex | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物实验 | 小鼠品系、性别、体重、饲养条件、分组(n=6)、饮食类型(STD vs WD)及持续时间(16周)、AAV-TIR8注射剂量和病毒颗粒数 阅读提示:Methods: Animals and treatments |
| 细胞实验 | HepaRG细胞来源、培养基(RPMI1640+10%FBS)、培养条件(37℃,5%CO2)、FFA浓度(100 nM)及处理时间(48或72小时)、LPS浓度(100 ng/ml) 阅读提示:Methods: Cell culture; Results: Fig. 1B, Fig. 4, Fig. 5, Fig. 6 |
| 分子生物学 | Western blot抗体信息、蛋白上样量、SDS-PAGE凝胶浓度、转膜条件、封闭和抗体孵育时间 阅读提示:Methods: Western blot |
| 组织学分析 | 组织固定、脱水、包埋、切片厚度(3 μm)、染色步骤(H&E, Oil Red O, Picrosirius red)及评分标准 阅读提示:Methods: Histological analysis |
| 生化检测 | 血清ALT/AST检测试剂盒、肝组织TG和T-CHO检测试剂盒及操作步骤 阅读提示:Methods: Reagents, Tissue triglyceride (TG) detection |
| 免疫共沉淀 | 细胞裂解条件、抗体孵育时间、Protein A/G琼脂糖珠用量、洗涤次数 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation |