临床样本相关性分析
评估CXCL8在肺腺癌中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
利用公共数据库GSE31210和GSE68465分析CXCL8 mRNA水平;用ELISA检测血清CXCL8蛋白水平;用组织微阵列进行免疫组织化学染色,并分析其与临床病理参数和生存的关系。
DACH1 antagonizes CXCL8 to repress tumorigenesis of lung adenocarcinoma and improve prognosis
包含体外细胞实验(稳转/敲低、迁移、报告基因)、体内异种移植模型及临床样本分析等多层级验证。
肺腺癌细胞系A549和SKLU 人支气管上皮细胞HBE 肺腺癌异种移植裸鼠模型 肺腺癌患者组织微阵列和血清样本
DACH1与CXCL8在mRNA和蛋白水平呈负相关(ADC组织和细胞系) DACH1过表达降低CXCL8表达,敲低DACH1升高CXCL8 DACH1抑制CXCL8诱导的细胞迁移(transwell实验) DACH1通过DS结构域依赖方式抑制CXCL8启动子活性(AP-1和NF-κB位点) DACH1抑制异种移植肿瘤生长并降低CXCL8、cyclin D1和Ki-67表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CXCL8在肺腺癌中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
利用公共数据库GSE31210和GSE68465分析CXCL8 mRNA水平;用ELISA检测血清CXCL8蛋白水平;用组织微阵列进行免疫组织化学染色,并分析其与临床病理参数和生存的关系。
验证DACH1是否负向调控CXCL8表达。
建立稳定过表达DACH1的A549和SKLU细胞系,以及敲低DACH1的HBE和H460细胞系;通过ELISA、Western blot、实时PCR和细胞因子阵列检测CXCL8表达。
探究DACH1是否通过抑制CXCL8影响细胞迁移。
使用transwell实验,分别用抗CXCL8抗体、DACH1过表达和重组人CXCL8因子处理细胞,测定迁移细胞数。
验证DACH1在体内对肿瘤生长和CXCL8等蛋白表达的影响。
将A549-vector、A549-DACH1和A549-ΔDS细胞皮下注射到裸鼠,测量肿瘤体积和重量,并进行免疫组织化学染色检测DACH1、cyclin D1、Ki-67和CXCL8。
阐明DACH1调控CXCL8的分子机制。
利用荧光素酶报告基因实验,使用CXCL8启动子片段和突变体,以及不同DACH1表达载体(包括ΔDS突变体),检测启动子活性。
评估DACH1和CXCL8表达水平与患者生存的关系。
使用Kaplan-Meier plotter数据库和GSE31210数据集,分析CXCL8和DACH1表达与OS和RFS的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | -- | -- |
| 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| ELISA | QuantiCyto人CXCL8试剂盒 | -- | H161125-008a |
| 免疫组织化学 | 抗CXCL8抗体 | Ruiying Biology | RLT2343 |
| 抗DACH1抗体 | ProteinTech | 10914-1-AP | |
| 抗Ki-67抗体 | Abcam | ab15680 | |
| 抗cyclin D1抗体 | MAIXIN-Bio | RMA-0541 | |
| Western blot | 抗CXCL8抗体 | ProteinTech | 60141-2-lg |
| 抗DACH1抗体 | ProteinTech | 10914-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | ProteinTech | 60008-1-lg | |
| 实时PCR | Trizol试剂 | Takara | -- |
| Tip Green qPCR预混液 | TransStart | -- | |
| cDNA合成试剂盒 | TransStart | -- | |
| Transwell迁移实验 | Transwell滤膜插入物(8μm孔径) | Corning | -- |
| 基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 抗CXCL8抗体 | R&D systems | MAB208 | |
| 人CXCL8因子 | PeProTech | 200-08 | |
| 荧光素酶报告基因实验 | pGL3-basic载体 | -- | -- |
| Superfect转染试剂 | Qiagen | -- | |
| TransDetect荧光素酶报告基因检测试剂盒 | -- | FR101 | |
| 细胞敲低 | GIPZ慢病毒shRNA载体 | Open Biosystems | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养基(DMEM或1640)、FBS浓度、CO2浓度、温度、TPA浓度(100 ng/ml)和TNF-α浓度(10 ng/ml)处理时间(12小时) 阅读提示:Methods: Cell culture, establishment of cell lines stably expressing DACH1 and cell stimulation |
| ELISA检测血清CXCL8 | 血清样本数量(48例ADC,20例正常)、样本处理、试剂盒货号、检测波长(450 nm) 阅读提示:Methods: ELISA |
| 免疫组织化学染色 | 组织微阵列货号(HLug-Ade150Sur-02)、抗体信息、稀释比例、评分标准(Fromowitz标准) 阅读提示:Methods: Immunohistochemical staining and Analysis and quantification of staining |
| 稳转细胞系建立 | 慢病毒载体、感染方法、筛选方法(免疫荧光验证)、DACH1表达载体(包括ΔDS突变体)和shDACH1序列 阅读提示:Methods: Cell culture, establishment of cell lines stably expressing DACH1 and cell stimulation and GIPZ Lentivirus shRNA vector |
| Transwell迁移实验 | 细胞数量(2.5×10^4)、基质胶浓度、下室FBS浓度(2.5%)、抗CXCL8抗体浓度(10 μg/ml)、重组CXCL8浓度(50 μg/ml)、迁移时间(12小时) 阅读提示:Methods: Transwell migration assay |
| 异种移植模型 | 动物品系(4周龄雌性无胸腺裸鼠)、细胞数量(1×10^5)、注射部位(皮下)、肿瘤测量频率(每周)、实验终点(第42天) 阅读提示:Methods: Nude mice study |
| 荧光素酶报告基因实验 | 启动子片段(2000bp和163bp)、突变体、质粒用量、转染试剂(Superfect)、检测试剂盒(FR101) 阅读提示:Methods: Plasmid construction, transient transfection, and luciferase reporter gene assay |