验证PHGDH表达与恩杂鲁胺耐药的相关性
分析PHGDH在临床样本和耐药细胞中的表达水平,确定其与耐药性的关联。
利用TCGA、GEO等数据库分析PHGDH表达;构建恩杂鲁胺耐药细胞系并检测PHGDH mRNA和蛋白水平。
Inhibition of phosphoglycerate dehydrogenase induces ferroptosis and overcomes enzalutamide resistance in castration-resistant prostate cancer cells
包含体外细胞实验、体内裸鼠移植瘤模型,并结合转录组和蛋白质组学分析,进行功能验证(敲低/过表达)和机制验证(p53/SLC7A11通路)。
C4-2和LNCaP细胞系及其恩杂鲁胺耐药亚系C4-2-EnzaR和LNCaP-EnzaR C4-2-EnzaR异种移植裸鼠模型
细胞系:C4-2、LNCaP及其耐药株C4-2-EnzaR、LNCaP-EnzaR 药物处理条件:NCT-503浓度10-40μM、恩杂鲁胺浓度20μM,处理时间24-48小时 体内模型:C4-2-EnzaR细胞皮下接种裸鼠,肿瘤体积至50-60mm³后给药 联合用药:NCT-503(40mg/kg,i.p.)与恩杂鲁胺(30mg/kg,i.p.)联合治疗 检测指标:细胞活力(CCK8)、细胞死亡(PI染色)、脂质过氧化(LipROS)、GSH/GSSG比值、肿瘤体积和重量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析PHGDH在临床样本和耐药细胞中的表达水平,确定其与耐药性的关联。
利用TCGA、GEO等数据库分析PHGDH表达;构建恩杂鲁胺耐药细胞系并检测PHGDH mRNA和蛋白水平。
评估耐药细胞中ROS、LipROS水平及抗氧化系统(如GSH)变化。
使用流式细胞术检测ROS(DCFH-DA、MitoSOX)和LipROS(BODIPY 581/591 C11);检测NADPH/NADP+和GSH/GSSG水平。
验证PHGDH在细胞生长和恩杂鲁胺耐药中的功能。
使用慢病毒载体敲低PHGDH,检测细胞活力(CCK8)、细胞死亡(PI染色)以及体内肿瘤生长。
进一步确认PHGDH在耐药性中的作用。
在C4-2和LNCaP细胞中过表达PHGDH(WT和C18S突变体),检测细胞活力和死亡。
评估PHGDH抑制剂NCT-503的疗效和铁死亡诱导机制。
用不同浓度NCT-503处理耐药细胞,检测细胞活力(CCK8)、细胞死亡(LDH释放、PI染色)、LipROS和GSH/GSSG水平,并使用多种细胞死亡抑制剂验证铁死亡。
阐明NCT-503诱导铁死亡的分子机制。
利用蛋白质组学、RNA-seq分析NCT-503处理后的表达变化;验证p53和SLC7A11的蛋白和mRNA水平,及过表达SLC7A11对细胞增殖的影响。
评估联合治疗对耐药细胞和体内肿瘤生长的效果。
在体外用NCT-503或铁死亡诱导剂(erastin、RSL3)与恩杂鲁胺联合处理,计算联合指数;在体内裸鼠模型中评估联合治疗的抗肿瘤效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | ExCell Bio | -- |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | -- | |
| 药物处理 | NCT-503 | Selleck Chemicals | -- |
| 恩杂鲁胺 | Selleck Chemicals | -- | |
| RSL3 | Selleck Chemicals | -- | |
| Erastin | Selleck Chemicals | -- | |
| Ferrostatin-1 | Selleck Chemicals | -- | |
| Necrostatin-1 | Selleck Chemicals | -- | |
| SAR405 | Selleck Chemicals | -- | |
| Z-VAD-FMK | Selleck Chemicals | -- | |
| Belnacasan | Selleck Chemicals | -- | |
| ROS检测 | MitoSOX Red | Invitrogen | M36008 |
| CM-H2DCFDA | Invitrogen | C6827 | |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11 | Invitrogen | D3861 |
| 细胞活力检测 | CCK8 | -- | CK04 |
| LDH释放检测 | LDH检测试剂盒 | Beyotime | C0017 |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131M |
| NADPH/NADP+和GSH/GSSG检测 | NADP/NADPH检测试剂盒 | DoJindo | N510 |
| 细胞死亡检测 | 碘化丙啶 | Beyotime | ST512 |
| PI | Neobioscience | FAK011.100 | |
| 免疫印迹 | PHGDH抗体 | Sigma | HPA021241 |
| SLC7A11抗体 | CST | #12691S | |
| p53兔单抗 | ABclonal | A19585 | |
| α-微管蛋白抗体 | RayAntibody | RM2007 | |
| β-肌动蛋白抗体 | RayAntibody | RM2001 | |
| 免疫组织化学 | Ki67抗体 | CST | #9449S |
| 蛋白质组学分析 | Pierce定量比色肽测定 | -- | -- |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| HiScript II Q RT SuperMix | Vazyme | -- | |
| ChamQ SYBR qPCR Master Mix | Vazyme | -- | |
| 转染与病毒包装 | DNAfect | Polysciences | #239661 |
| 稳定细胞系筛选 | 嘌呤霉素 | Solarbio | P8230 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源;培养基和血清;耐药细胞系的建立方式(恩杂鲁胺浓度和时间) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 药物处理 | 药物浓度(NCT-503 10-40μM;恩杂鲁胺20μM;erastin 10μM;RSL3 1μM);处理时间(24-48小时) 阅读提示:Materials and methods: Materials; Result sections |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度(5×10^3);CCK8处理时间;检测波长(OD450) 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assay |
| 体内实验 | 小鼠品系(Balb/c nude);细胞接种数量(1×10^6);给药剂量(恩杂鲁胺30mg/kg;NCT-503 40mg/kg);给药途径(i.p.);治疗时长(20天) 阅读提示:Materials and methods: Xenograft model nude mice |
| 铁死亡检测 | 探针浓度(BODIPY 581/591 C11 2μM);抑制剂预处理浓度(Fer-1 10μM);检测时间 阅读提示:Materials and methods: Lipid peroxides (LipROS) assay |
| 统计设计 | 重复次数(至少三次);统计方法(Student's t-test或ANOVA);显著性水平(P<0.05) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |