erastin对营养剥夺条件下髓核细胞存活的影响
验证不同浓度erastin对营养剥夺诱导的髓核细胞死亡的保护作用。
在无FBS和葡萄糖培养基中培养髓核细胞,用不同浓度erastin处理,CCK-8检测细胞活力,观察细胞形态,进行活/死染色。
Beyond a ferroptosis inducer: erastin can suppress nutrient deprivation induced cell death in the intervertebral disc
包含体外细胞实验和离体椎间盘培养,明确进行了功能验证(细胞存活、自噬)和机制验证(SLC7A11、mTORC1-TFEB),因缺乏体内模型,故定为中。
大鼠原代髓核细胞 大鼠离体椎间盘培养模型
erastin浓度:0.25-1μM显示保护作用,≥5μM诱导死亡 营养剥夺条件:无FBS和葡萄糖的培养基,处理24h SLC7A11 siRNA敲低序列:GAAGTAGACAACCCTGAAA TFEB-shRNA敲低序列:GCAGATGCCTAACACGCTA 离体椎间盘培养:取第5-8尾椎椎间盘,缺氧缺营养培养12/24/48h,n=6
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证不同浓度erastin对营养剥夺诱导的髓核细胞死亡的保护作用。
在无FBS和葡萄糖培养基中培养髓核细胞,用不同浓度erastin处理,CCK-8检测细胞活力,观察细胞形态,进行活/死染色。
确定erastin的保护作用是否依赖铁死亡。
使用铁死亡诱导剂RSL3和抑制剂Ferrostatin-1进行处理,检测细胞活力和铁死亡标志物Fe2+和MDA。
检测SLC7A11是否介导erastin的保护效应。
通过Western blot检测营养剥夺时SLC7A11的表达变化,并通过siRNA敲低SLC7A11观察细胞存活情况。
验证erastin是否通过激活自噬来保护细胞。
检测自噬相关蛋白LC3、p62、Lamp1、CTSD的表达,并使用自噬抑制剂Bafilomycin A1和CQ处理后观察细胞存活。
验证erastin是否通过抑制mTORC1并激活TFEB来促进自噬。
检测mTORC1下游靶点S6K和ULK1的磷酸化水平,以及TFEB的表达和核转位,并敲低TFEB观察对erastin保护作用的影响。
在离体椎间盘模型中验证erastin的保护作用。
将大鼠椎间盘置于营养剥夺培养基中,加入erastin,进行HE染色评估髓核细胞形态和数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Erastin | MCE | -- |
| Ferrostatin-1 | MCE | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | MCE | -- | |
| RSL3 | MCE | -- | |
| 氯喹(CQ) | MCE | -- | |
| 蛋白质印迹 | 抗SLC7A11抗体 | Abcam | ab175186 |
| 抗Lamp1抗体 | Abcam | ab24170 | |
| 抗组织蛋白酶D抗体 | Abcam | ab217310 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 抗LC3抗体 | Cell Signaling Technology | #12741 | |
| 抗S6K抗体 | Cell Signaling Technology | #9202 | |
| 抗ULK1抗体 | Cell Signaling Technology | #8054 | |
| 抗磷酸化S6K抗体 | Cell Signaling Technology | #9204 | |
| 抗磷酸化ULK1抗体 | Cell Signaling Technology | #37762 | |
| 抗TFEB抗体 | Proteintech | 13372-1-AP | |
| 抗Lamin B1抗体 | Proteintech | 66095-1-lg | |
| 细胞培养 | II型胶原酶 | Salorbi | -- |
| 青霉素-链霉素液体 | Salorbi | -- | |
| DMEM/F12培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| 活/死染色 | Calcein-AM/PI活/死细胞双染试剂盒 | Solarbio | -- |
| MDA检测 | 微量丙二醛检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| Fe2+检测 | 亚铁比色检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 蛋白质印迹 | ECL化学发光检测试剂盒 | EPIXYME | -- |
| siRNA转染 | SLC7A11 siRNA | GuangZhou RiboBio | -- |
| 慢病毒转染 | TFEB-shRNA慢病毒 | OBiO | -- |
| 细胞活力检测 | 光度计 | ThermoFisher | -- |
| 免疫荧光 | 荧光显微镜 | Olympus | -- |
| 活/死染色及离体培养成像 | Leica荧光显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 髓核细胞培养 | 大鼠品系和年龄(4周龄SD大鼠),分离方法(0.2%II型胶原酶消化4h),培养基(DMEM/F12含15%FBS和1%青霉素-链霉素),传代次数(第2代) 阅读提示:Materials and methods: Primary nucleus pulposus cells cultured |
| erastin处理 | erastin浓度(保护作用0.25-1μM,诱导死亡≥5μM),处理时间(24h) 阅读提示:Results: Erastin promotes cell survival under nutrient deprivation condition(Fig. 1B-C) |
| 铁死亡干预 | 铁死亡诱导剂RSL3浓度(<100nM无毒性),铁死亡抑制剂Ferrostatin-1浓度(未明确在文中给出具体浓度,但用于共处理) 阅读提示:Results: The effect of erastin is ferroptosis independent(Fig. 2A-D) |
| SLC7A11敲低 | siRNA序列(GAAGTAGACAACCCTGAAA),转染试剂和方法(按制造商建议) 阅读提示:Materials and methods: siRNA transfection; Results: Fig. 3C-D |
| 自噬抑制 | 自噬抑制剂Bafilomycin A1(100nM)、CQ(50μM) 阅读提示:Results: Fig. 4G-J |
| TFEB敲低 | shRNA序列(GCAGATGCCTAACACGCTA),转染方法(慢病毒转染,24孔板每孔30×10^4细胞,融合度30%-50%,转染后96h验证) 阅读提示:Materials and methods: Lentivirus transfection; Results: Fig. 5G-H |
| 离体椎间盘培养 | 动物品系和月龄(8周龄雄性SD大鼠,体重280±20g),取材部位(第5-8尾椎椎间盘),分组(正常培养、营养剥夺、营养剥夺+1μM erastin),培养时间(12/24/48h),样本量(n=6/组) 阅读提示:Materials and methods: Ex vivo culture of intervertebral disc; Results: Fig. 6 |