临床样本分析
检测RA患者中PU.1和IL-9的表达水平及其与临床指标的相关性。
收集RA患者和健康对照的外周血及滑膜组织,通过ELISA、Western blot、免疫组化和免疫荧光检测IL-9和PU.1的表达及共定位。
Positive feedback loop PU.1-IL9 in Th9 promotes rheumatoid arthritis development
包含体外Th9分化、细胞功能实验(增殖、迁移、极化)、双荧光素酶报告基因、ChIP-qPCR、多个基因敲除小鼠模型(PU.1、IL-9、IL-9R)及CAIA/CIA体内模型,并进行功能验证和机制验证。
胶原抗体诱导关节炎(CAIA)小鼠模型 胶原诱导关节炎(CIA)小鼠模型 SPI1flox/flox, Lck-Cre T细胞条件性敲除小鼠 IL-9敲除小鼠 IL-9R敲除小鼠 患者外周血和滑膜组织 体外培养的人CD4+ T细胞分化的Th9细胞 原代小鼠腹腔巨噬细胞 原代RA-FLS
PU.1和IL-9在RA患者中的表达水平与临床指标的相关性 PU.1 T细胞条件性敲除对CAIA模型中关节炎评分、Th9/Th17/Treg比例及巨噬细胞极化的影响 IL-9重组蛋白对UREΔ小鼠CAIA模型关节炎症和Th9/Th17/Treg比例的影响 IL-9中和抗体对CIA模型关节炎症和骨损伤的影响 IL-9R敲除对CAIA模型中JAK1/STAT3磷酸化的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测RA患者中PU.1和IL-9的表达水平及其与临床指标的相关性。
收集RA患者和健康对照的外周血及滑膜组织,通过ELISA、Western blot、免疫组化和免疫荧光检测IL-9和PU.1的表达及共定位。
在体内验证PU.1和IL-9在关节炎发病中的作用。
使用DBA/1J小鼠构建CAIA和CIA模型,分别给予PU.1抑制剂(DB2313)和IL-9中和抗体治疗,评估关节炎严重程度和组织病理变化。
明确PU.1在T细胞中及IL-9/IL-9R在关节炎发病中的必要性。
使用SPI1flox/flox, Lck-Cre小鼠、IL-9 KO小鼠和IL-9R KO小鼠构建CAIA模型,评估关节炎表型和免疫细胞亚群变化。
研究PU.1对Th9分化和IL-9产生的作用。
从RA患者外周血分选CD4+ T细胞,在Th9极化条件下分化,并通过siRNA敲低PU.1,检测IL-9表达。
验证PU.1直接结合IL-9启动子以及STAT3直接结合PU.1启动子。
通过双荧光素酶报告基因和ChIP-qPCR检测PU.1与IL-9启动子、STAT3与PU.1启动子的结合。
验证IL-9通过JAK1/STAT3通路诱导PU.1表达。
用重组IL-9处理Jurkat、EL4和RA-Th9细胞,并给予JAK抑制剂Tofacitinib和STAT3抑制剂Stattic,检测PU.1表达和通路磷酸化。
验证IL-9对RA-FLS和巨噬细胞功能的影响。
用重组IL-9处理RA-FLS和巨噬细胞,或使用Th9细胞条件培养基,检测RA-FLS的增殖、迁移和MMP表达,以及巨噬细胞极化和炎症因子表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA | IL-9 ELISA试剂盒 | Signalway Antibody | EK1226 |
| Western blotting | 抗人IL-9抗体 | Abcam | ab181397 |
| 抗鼠IL-9抗体 | LS Bio | LS-C487693 | |
| 抗PU.1/Spi1抗体 | Abcam | ab230336 | |
| 抗JAK1抗体 | Cell Signaling | 3344S | |
| 抗磷酸化JAK1抗体 | Cell Signaling | 3344S | |
| 抗STAT3抗体 | Abcam | ab119352 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling | 9145S | |
| β-肌动蛋白抗体 | Affinity | T0022 | |
| 快速封闭液 | NCS Biotech | P30500 | |
| 显影液 | Biosharp | BL520B | |
| 免疫组化 | 抗人IL-9抗体 | Abcam | ab181397 |
| 抗人PU.1抗体 | Abcam | ab88082 | |
| 抗人CD4抗体 | Proteintech | 67786-1-Ig | |
| 多重荧光免疫组化试剂盒 | Panovue | 10002100050 | |
| 双染检测试剂盒 | ZSGB-Bio | DS-0003 | |
| 免疫荧光 | 抗人IL-9抗体 | Abcam | ab181397 |
| 抗人PU.1抗体 | Abcam | ab88082 | |
| 抗人CD4抗体 | Proteintech | 67786-1-Ig | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD4抗体 | Biolegend | 100438 |
| 抗小鼠CD25抗体 | Biolegend | 102011 | |
| 抗小鼠CD11b抗体 | Biolegend | 101236 | |
| 抗小鼠F4/80抗体 | Biolegend | 123108 | |
| 抗小鼠CD86抗体 | Miltenyi Biotec | 130-102-604 | |
| 抗人CD4抗体 | Biolegend | 302604 | |
| 抗人CD86抗体 | Biolegend | 374208 | |
| 抗小鼠IL-17A抗体 | eBioscience | 2317033 | |
| 抗小鼠Foxp3抗体 | eBioscience | 2403335 | |
| 抗小鼠IL-9抗体 | Biolegend | 514106 | |
| 抗小鼠CD206抗体 | Biolegend | 141708 | |
| 抗人IL-9抗体 | Biolegend | 507605 | |
| 抗人CD68抗体 | eBioscience | 1984137 | |
| 抗人CD206抗体 | Biolegend | 321125 | |
| 流式细胞仪 | Beckman Coulter | A00-1-1102 | |
| 磁珠分选 | 抗人CD4磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-101 |
| 抗小鼠CD4磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-117-043 | |
| Th9分化 | 抗人CD3抗体 | eBioscience | 16-0037-81 |
| 抗人CD28抗体 | eBioscience | 16-0289-81 | |
| 重组人TGF-β1 | R&D Systems | 240-B-002 | |
| 重组人IL-4 | R&D Systems | 204-IL-010 | |
| 抗人IFN-γ抗体 | eBioscience | 16-7318-81 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778-150 |
| OPTI-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | P3000试剂 | Invitrogen | 100022058 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | 100022052 | |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | E2920 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| 逆转录试剂盒 | Vazyme | R222-01 | |
| PCR扩增试剂盒 | Vazyme | Q111-02 | |
| CCK-8 | CCK-8溶液 | -- | -- |
| 酶标仪 | Tecan | Infinite | |
| 凋亡实验 | 重组人IL-9 | Abcam | AB50119 |
| 托法替尼 | MCE | HY-40354 | |
| Stattic | MCE | HY-13818 | |
| TNF-α | Peprotech | 300-01A | |
| 凋亡检测试剂盒 | BestBio | BB-41033 | |
| CAIA模型 | 胶原抗体 | Chondrex | 53010 |
| 脂多糖 | -- | -- | |
| CIA模型 | 鸡II型胶原 | Chondrex | 20011 |
| 完全Fuchs佐剂 | Chondrex | 7023 | |
| DB2313 | MCE | HY-124629 | |
| IL-9中和抗体 | Biolegend | MM9C1 | |
| 动物实验 | D-荧光素 | -- | -- |
| 活体成像系统 | Spectral Instruments | Amix | |
| microCT系统 | NEMO | NMC-100 | |
| 高分辨率小动物超声系统 | VisualSonics | 1800568S | |
| 病理学 | TRAP染色试剂盒 | BestBio | BB-44212-3 |
| 免疫荧光 | 荧光显微镜 | Leica | SP8 |
| 免疫组化 | 光学显微镜 | 3DHISTECH | Pannoramic |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | RA患者和健康对照的样本量、ELISA检测步骤、滑膜组织处理 阅读提示:患者和正常志愿者部分,图1图注 |
| 动物模型建立 | 小鼠品系(DBA/1J)、周龄、性别、剂量:胶原抗体4mg/只、LPS 40μg/只、CII 10mg/5mL、CFA 5mg/mL、DB2313剂量0.3mg/只、IL-9抗体200μg/只、给药频率和时间 阅读提示:Materials and methods中Collagen antibody-induced arthritis model、Collagen-induced arthritis model部分 |
| 基因敲除小鼠 | SPI1flox/flox, Lck-Cre小鼠、IL-9 KO、IL-9R KO的来源、构建CAIA模型的方法是否与普通小鼠一致 阅读提示:Materials and methods中Animal部分,图2、图5、图6图注 |
| 体外Th9分化 | CD4+ T细胞分选方法、分化因子浓度(TGF-β1 3ng/mL、IL-4 10ng/mL、anti-IFN-γ 10ng/mL)、分化时间4天 阅读提示:Materials and methods中Human Th9 cell differentiation部分 |
| 分子机制研究 | ChIP-qPCR使用的抗体(PU.1抗体CST 2266S、STAT3抗体CST 12640S)、IP用量5-10μg染色质、双荧光素酶报告基因使用HEK293T细胞 阅读提示:Materials and methods中CHIP-qPCR、Dual-luciferase reporter assay部分 |
| JAK1/STAT3通路验证 | 重组IL-9浓度(100ng/mL)、Tofacitinib浓度(10μM)、Stattic浓度(2.5μM)、处理时间48小时 阅读提示:Materials and methods中Apoptosis部分,图7图注 |
| 体外功能实验 | RA-FLS迁移实验Transwell孔径8μm、细胞密度5×10^3/孔、迁移时间24小时;CCK-8细胞密度5×10^5/mL、处理3小时;巨噬细胞极化检测的抗体 阅读提示:Materials and methods中Transwell assay、CCK-8 assay、Flow cytometry部分,图3图注 |