临床样本中β-HB水平检测
探究乳腺癌患者中β-HB水平与疾病状态的关系。
检测乳腺癌组织及配对癌旁组织中β-HB水平,并检测健康个体及非转移、转移乳腺癌患者血清β-HB水平。
PAK5-Mediated Suppression of β-Hydroxybutyrate Production Promotes Breast Cancer Metastasis and Can Be Overcome with Ketogenic Diet
包含体外细胞功能实验、体内小鼠模型(4T1移植瘤、MMTV-PyVT转基因小鼠)、临床样本分析及机制验证(蛋白互作、磷酸化、泛素化)等多个独立证据层级。
人乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、HS578T、BT474) 小鼠乳腺癌细胞系4T1 4T1细胞足垫及原位移植瘤BALB/c小鼠模型 MMTV-PyVT转基因小鼠模型 乳腺癌患者肿瘤及血清样本
PAK5与HMGCS2的蛋白互作及共定位(GST pull-down、免疫共沉淀、免疫荧光) PAK5对HMGCS2的磷酸化位点(Ser138和Ser311)验证 BMI1介导的HMGCS2 K137泛素化及其对HMGCS2蛋白稳定性的影响 HMGCS2 Ser311磷酸化对SIRT3介导去乙酰化及酶活性的影响 体内实验中β-HB给药剂量(300 mg/kg)及生酮饮食干预对PAK5促肿瘤效应的逆转
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究乳腺癌患者中β-HB水平与疾病状态的关系。
检测乳腺癌组织及配对癌旁组织中β-HB水平,并检测健康个体及非转移、转移乳腺癌患者血清β-HB水平。
验证β-HB补充对乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的直接影响。
在乳腺癌细胞系(如MDA-MB-231、HS578T)中加入10 mmol/L β-HB钠盐,进行CCK-8增殖、集落形成、划痕愈合和Transwell迁移/侵袭实验。
验证PAK5是否与HMGCS2相互作用并调控β-HB合成。
通过GST pull-down和免疫共沉淀验证PAK5与HMGCS2的直接结合,免疫荧光显示线粒体共定位;检测PAK5过表达/敲低细胞内β-HB水平;在Pak5-/-/MMTV-PyVT小鼠中检测肿瘤及血清β-HB水平。
确定PAK5磷酸化HMGCS2的具体位点,以及该磷酸化如何影响HMGCS2蛋白稳定性和降解。
通过质谱鉴定PAK5磷酸化HMGCS2的位点(Ser138和Ser311);用CHX和MG132处理检测HMGCS2蛋白半衰期和稳定性;体外泛素化实验验证BMI1为HMGCS2的E3连接酶,并确定泛素化位点K137;验证Ser138磷酸化促进BMI1结合和泛素化降解。
探究PAK5磷酸化HMGCS2 Ser311是否通过影响SIRT3介导的去乙酰化来调控其酶活性。
检测PAK5对HMGCS2乙酰化水平的影响,使用SIRT3抑制剂3-TYP处理;比较HMGCS2 WT、S311A和S311D突变体的乙酰化水平、与SIRT3的相互作用及细胞内β-HB水平。
在体内模型中验证PAK5通过抑制HMGCS2促进乳腺癌生长和转移,以及生酮饮食或β-HB的逆转作用。
将稳定表达Flag-PAK5和/或Flag-HMGCS2(WT, S138A, S311A)的4T1细胞植入BALB/c小鼠乳腺脂肪垫,监测肿瘤体积和重量,评估肺转移;同时给予生酮饮食或β-HB(300 mg/kg)处理。
验证PAK5和HMGCS2表达及其相关性与乳腺癌患者临床病理特征和预后的关联。
通过IHC和Western blot检测乳腺癌组织及配对癌旁正常组织中PAK5和HMGCS2蛋白水平,分析其与淋巴结转移、生存率的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| Leibovitz L-15培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | HiGene转染试剂 | Applygen | -- |
| 病毒包装与感染 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| 蛋白互作 | 谷胱甘肽琼脂糖微珠 | Amersham Biosciences | -- |
| TNT T7快速偶联转录/翻译系统 | Promega Biotech Co., Ltd. | -- | |
| Western blot | HMGCS2抗体 | Abcam | ab137043 |
| PAK5抗体 | R&D Systems | MAB4696 | |
| Myc抗体 | Santa Cruz Biotechnology | 9E10 | |
| His抗体 | GenScript | SD1223 | |
| BMI1抗体 | Proteintech | 10832-1-AP | |
| SIRT3抗体 | Proteintech | 10099-1-AP | |
| Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| GFP抗体 | Proteintech | 66002-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 磷酸化丝氨酸R-X-Y/F-X-pS基序抗体 | Cell Signaling Technology | 9614 | |
| 抗p-HMGCS2 Ser311抗体 | Bioss | -- | |
| 药物处理 | β-羟基丁酸钠 | Sigma-Aldrich | 298360 |
| 代谢物检测 | β-HB比色检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK041 |
| 蛋白磷酸化检测 | PAK5激酶 | Life Technologies | PV4441 |
| 体内泛素化 | 泛素化试剂盒 | Enzo Life Sciences | -- |
| 线粒体提取 | 培养细胞线粒体分离试剂盒 | Applygen | -- |
| 药物处理 | PAK5小分子抑制剂(C55) | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型、血清和胰岛素添加浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell lines and cell culture |
| PAK5与HMGCS2相互作用 | GST pull-down和Co-IP的实验条件(如结合缓冲液、孵育时间) 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting, immunoprecipitation, and GST pull-down assay; Figure 2C and D legend |
| β-HB检测 | 细胞处理(无血清培养时间)、组织质量、血清体积 阅读提示:Materials and Methods: β-HB detection assay |
| 蛋白质稳定性检测 | CHX和MG132的处理浓度和时间 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting; Figure 4D and E legend; Supplementary Figure S5A and S5B |
| 体内动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、细胞接种数量和部位、β-HB给药剂量方式和时间、生酮饮食喂养方案 阅读提示:Materials and Methods: Animal models; Figure 3A-F and Figure 8A-F legends |
| 临床样本分析 | 样本数量、来源、处理方式(石蜡切片、新鲜组织、血清) 阅读提示:Materials and Methods: Patient tissues and specimens |