模型建立与培养
建立2D共培养和3D类器官模型,用于模拟SCAP-MQ直接细胞相互作用。
将SCAP和巨噬细胞(THP-1分化)按1:10比例共培养;3D类器官由SCAP和MQ在胶原混合物中形成,使用聚二甲基硅氧烷哑铃形模具。
Investigating Adhesion Molecules in Stem Cell - Immune Cell Interactions Using Organoids
包含2D与3D共培养模型,采用qRT-PCR和免疫荧光检测黏附分子表达,并进行LPS和IL-4刺激,但缺乏功能验证和动物体内实验。
SCAP-MQ共培养类器官(三维胶原模型) SCAP-MQ二维共培养
SCAP细胞系来源(人第三磨牙,传代3-5) THP-1单核细胞分化为巨噬细胞(100 nM PMA处理24小时) 共培养比例(SCAP:MQ = 1:10) 刺激条件(LPS 1 μg/mL,IL-4 20 ng/mL) 培养时间(最多7天,每3天更换培养基)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立2D共培养和3D类器官模型,用于模拟SCAP-MQ直接细胞相互作用。
将SCAP和巨噬细胞(THP-1分化)按1:10比例共培养;3D类器官由SCAP和MQ在胶原混合物中形成,使用聚二甲基硅氧烷哑铃形模具。
模拟促炎和抗炎微环境,观察黏附分子表达变化。
分别用LPS(1 μg/mL)和IL-4(20 ng/mL)处理培养物,持续最多7天,每3天更换培养基。
定量检测黏附分子mRNA表达水平。
从2D和3D培养物中提取RNA,进行qRT-PCR分析CD200、CD200R、ICAM-1、ITG-αL和N-钙黏蛋白的表达。
评估黏附分子在蛋白水平的表达和空间分布。
对第7天的2D和3D样本进行免疫荧光染色,使用共聚焦显微镜(3D)和玻片扫描仪(2D)成像。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | THP-1单核细胞 | ATCC | TIB-202 |
| α-MEM培养基 | -- | -- | |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 佛波醇-12-肉豆蔻酸酯-13-乙酸酯 | -- | 16561-29-8 | |
| 牛I型胶原蛋白 | Gibco | -- | |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 白细胞介素-4 | -- | -- | |
| 基因表达分析 | 胶原酶/分散酶 | Roche | -- |
| QiaShredder柱 | Qiagen Inc | -- | |
| RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen Inc | -- | |
| Synergy H4混合多模式微孔板读取器 | BioTek | -- | |
| SensiFast cDNA合成试剂盒 | Bioline | -- | |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| CFX实时PCR检测系统 | BioRad | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | 9002-93-1 |
| 中性缓冲福尔马林 | -- | -- | |
| 鱼血清封闭缓冲液 | Thermo Fisher | 37527 | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Life Technologies | R37606 | |
| CD90抗体 | R&D Systems | AF2067 | |
| CD200R1抗体 | R&D Systems | MAB34141 | |
| CD200抗体 | Bioss Antibodies | Bs-6030R | |
| ICAM-1抗体 | Invitrogen | 1A29 | |
| CD68抗体 | Invitrogen | PA5-109344 | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Invitrogen | 3B9 | |
| LFA-1 α抗体 | Invitrogen | MA532189 | |
| Alexa Fluor 488二抗 | Abcam | ab150073 | |
| Alexa Fluor 568二抗 | Abcam | ab175472 | |
| Alexa Fluor 647二抗 | Invitrogen | A21448 | |
| Leica SP8/光片共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| Zeiss Axio Scan Z1玻片扫描仪 | Zeiss | -- | |
| Imaris 9.9软件 | Oxford Instruments | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | SCAP细胞系来源(人第三磨牙,传代3-5);THP-1单核细胞分化为巨噬细胞的条件(PMA浓度100 nM,处理24小时);共培养比例(SCAP:MQ=1:10) 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture |
| 类器官形成 | 3D模具材料(聚二甲基硅氧烷哑铃形);胶原浓度(5 μg/mL);细胞数(SCAP 1×10^4,MQ 1×10^5);pH调节至7.4 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture |
| 刺激条件 | LPS浓度(1 μg/mL);IL-4浓度(20 ng/mL);培养时间(最多7天);培养基更换频率(每3天) 阅读提示:Materials and Methods, Cell Culture |
| 基因表达分析 | RNA提取方法;qRT-PCR引物序列;内参基因(RPL13a);数据分析方法(2−ΔΔCT) 阅读提示:Materials and Methods, Quantitative Real-time Polymerase Chain Reaction; Supplemental Table S1 |
| 免疫荧光分析 | 固定和透化条件;封闭缓冲液;一抗和二抗的稀释比例;成像设备;荧光强度量化方法 阅读提示:Materials and Methods, Immunofluorescence Analysis; Supplemental Table S2 |