建立LPS诱导的牙髓炎细胞模型
模拟牙髓炎的体外炎症环境
用LPS(1 μg/mL)刺激hDPSCs 3小时,建立炎症模型,并通过qPCR和Seahorse验证炎症反应和代谢变化。
PFKFB3-Inhibitor 3PO-Mediated Glycolytic Reprogramming Promotes Inflammatory Dental Pulp Repair: An In Vitro and In Vivo Study
包含体外细胞实验、共培养体系、动物模型等多个独立证据层级,并有功能验证和机制验证(信号通路验证)。
人牙髓干细胞(hDPSCs) THP-1来源巨噬细胞与DPSCs共培养体系 SD大鼠牙髓炎模型
LPS刺激浓度(1 μg/mL)和持续时间(3小时) 3PO处理浓度(10 μM)和时间(6小时) siRNA靶向PFKFB3的序列和转染浓度(25 nM) 3PO@GelMA水凝胶中3PO浓度(10 μmol/L)和作用时间(20分钟) 大鼠分组及每组样本量(每组4只)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟牙髓炎的体外炎症环境
用LPS(1 μg/mL)刺激hDPSCs 3小时,建立炎症模型,并通过qPCR和Seahorse验证炎症反应和代谢变化。
验证PFKFB3在LPS诱导的牙髓炎中的上调
通过qPCR和Western blot检测LPS刺激后hDPSCs中PFKFB3的mRNA和蛋白表达水平。
确定3PO的非毒性浓度和siRNA的最佳敲低序列
用不同浓度的3PO处理DPSCs,通过CCK-8评估细胞活性;设计三条siRNA序列,筛选敲低效率最高的用于后续实验。
检测3PO和si-PFKFB3对细胞代谢的影响
使用Seahorse XF分析仪检测hDPSCs及共培养体系的氧化磷酸化和糖酵解速率。
评估3PO和si-PFKFB3的抗炎效果
通过qPCR和ELISA检测炎症因子(IL-6、IL-1β、TNF-α)的表达,使用DCFH-DA探针和流式细胞术检测ROS水平。
研究3PO对巨噬细胞和DPSCs相互作用的影响
建立DPSCs与THP-1来源巨噬细胞的共培养体系,LPS刺激,用3PO处理,检测代谢、炎症因子表达和巨噬细胞极化。
评估3PO和si-PFKFB3对成牙本质分化的影响
对DPSCs进行成骨诱导,通过qPCR检测分化相关基因表达,Western blot检测DSPP和DMP1蛋白水平,ALP和ARS染色评估矿化能力。
验证3PO对AMPK/SIRT1/PGC-1α/NF-κB和AMPK/mTOR/NF-κB信号通路的影响
通过Western blot检测相关蛋白表达和磷酸化水平,免疫荧光检测p65的核转位。
验证3PO@GelMA在大鼠牙髓炎模型中的疗效
建立SD大鼠牙髓炎模型,施加MTA、GelMA或3PO@GelMA盖髓剂,1个月后通过H&E和免疫组化评估炎症和修复性牙本质形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Gibco/BRL | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 佛波醇12-十四酸酯13-乙酸酯 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo | -- |
| 试剂 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green预混液 | Roche | -- |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Liankebio | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAi Max转染试剂 | Invitrogen | 13778-150 |
| 代谢分析 | 海马XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | -- |
| XF糖酵解速率分析试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| 抗霉素 | -- | -- | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | -- | -- | |
| 蛋白提取 | 蛋白裂解液 | Applygen Technologies Inc. | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | CWbio | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗DSPP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-73632 | |
| 抗p65抗体 | Cell Signalling Technology | 8242 | |
| 抗磷酸化p65抗体 | Cell Signalling Technology | 3033 | |
| 抗AMPK抗体 | Cell Signalling Technology | 5832 | |
| 抗磷酸化AMPK抗体 | Cell Signalling Technology | 2535 | |
| 抗mTOR抗体 | Cell Signalling Technology | 2983 | |
| 抗磷酸化mTOR抗体 | Cell Signalling Technology | 2971 | |
| 抗DMP1抗体 | BIOSS | BS1223 | |
| 抗PGC-1α抗体 | ProteinTech | 11217-1-AP | |
| 抗SIRT1抗体 | Cell Signalling Technology | 9472 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signalling Technology | 4970 | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Solibro | -- | |
| 成骨诱导 | L-抗坏血酸 | Sigma | -- |
| β-甘油磷酸钠 | Sigma | -- | |
| 地塞米松 | Sigma | -- | |
| ALP染色 | NBT/BCIP染色液 | Beyotime | -- |
| ALP活性定量 | ALP活性检测试剂盒 | Jiancheng | -- |
| 动物实验 | 三氧化矿物凝聚体 | -- | -- |
| 3PO | -- | -- | |
| 甲基丙烯酰化明胶水凝胶 | -- | -- | |
| 组织处理 | EDTA脱钙液 | Boster | -- |
| H&E染色 | H&E染色试剂盒 | Solarbio | -- |
| 免疫组化 | SABC-POD试剂盒 | -- | -- |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | CY3标记山羊抗兔IgG | -- | -- |
| FITC标记山羊抗小鼠IgG | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 抗CD86抗体 | Proteintech | 18704-1-AP | |
| 抗CD206抗体 | Proteintech | 60143-1-Ig | |
| 鬼笔环肽560 | Proteintech | 10060-1-AP | |
| ROS检测 | 2',7'-二氯荧光素二乙酸酯 | Sigma | -- |
| 流式细胞术 | FACS Calibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 显微成像 | 尼康显微镜成像系统 | Nikon Ltd. | -- |
| 共聚焦显微镜 | 激光共聚焦显微镜FV3000 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与刺激 | hDPSCs的分离来源和培养条件;LPS浓度(1 μg/mL)和刺激时间(3小时) 阅读提示:2.1 细胞分离与培养;3.1结果部分 |
| 药物处理和siRNA转染 | 3PO浓度(10 μM)和处理时间(6小时);siRNA序列和转染浓度(25 nM) 阅读提示:2.5 siRNA干扰;3.3结果部分 |
| 代谢分析 | Seahorse实验的具体步骤:细胞接种密度、校准时间、试剂浓度 阅读提示:2.6 代谢分析 |
| 共培养体系 | THP-1分化条件(PMA浓度和时间)、共培养比例(2:1) 阅读提示:2.1 细胞分离与培养 |
| 体内动物模型 | 大鼠品系、年龄、体重;分组(每组4只);LPS诱导时间;3PO@GelMA处理条件 阅读提示:2.9 大鼠牙髓炎模型的建立 |