牙周炎患者牙龈组织和细胞模型的Drp1激活检测
验证在牙周炎条件下Drp1是否过度激活
通过Western blot检测牙周炎患者牙龈组织和Pg LPS/Pg处理巨噬细胞中p-Drp1 (Ser616)、Drp1四聚体形成和线粒体转位。免疫荧光观察牙龈组织中p-Drp1 (Ser616)在F4/80+巨噬细胞中的定位。
Dynamin-Related Protein 1 Orchestrates Inflammatory Responses in Periodontal Macrophages via Interaction With Hexokinase 1
包含患者牙龈组织样本、细胞模型、Western blot、免疫荧光、免疫沉淀等方法,但缺乏体内动物模型验证。
RAW264.7细胞 THP-1巨噬细胞 牙周炎患者牙龈组织 健康志愿者牙龈组织
Pg LPS处理RAW264.7细胞的浓度1 μg/mL和处理时间0-48小时 Pg刺激THP-1巨噬细胞的MOI为100和处理时间0-48小时 Drp1 shRNA敲低效率在RAW264.7细胞约80%,在THP-1巨噬细胞约77% Mdivi-1抑制Drp1四聚体形成的浓度5 μM及处理时间2小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证在牙周炎条件下Drp1是否过度激活
通过Western blot检测牙周炎患者牙龈组织和Pg LPS/Pg处理巨噬细胞中p-Drp1 (Ser616)、Drp1四聚体形成和线粒体转位。免疫荧光观察牙龈组织中p-Drp1 (Ser616)在F4/80+巨噬细胞中的定位。
检测Pg LPS或Pg暴露后巨噬细胞线粒体是否受损
使用免疫荧光染色检测线粒体碎片化、ROS产生和膜电位变化。
验证急性炎症反应中NLRP3炎症小体是否被激活
通过Western blot检测NLRP3、cleaved caspase-1、GSDMD-CL、pro-IL-1β表达水平,ELISA检测细胞上清中IL-1β释放。
验证抑制Drp1能否减轻线粒体损伤和炎症反应
使用Mdivi-1或Drp1 shRNA敲低Drp1,检测线粒体碎片化、NLRP3炎症小体蛋白表达和IL-1β释放。
探究Drp1与HK1的结合是否调节mPTP开放
通过免疫沉淀检测Drp1与HK1的相互作用,免疫荧光检测mPTP开放程度,并使用分子建模预测关键残基。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell Life Science & Technology | -- |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 细胞分化 | 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | MedChemExpress | -- |
| 细菌培养 | 脑心浸液琼脂 | Aobo Bio-tech | -- |
| 氯化血红素 | -- | -- | |
| 维生素K | -- | -- | |
| 细胞转染 | TransIT-2020转染试剂 | Mirus Bio | -- |
| 基因敲低 | Drp1短发夹RNA | Sigma-Aldrich | TRCN0000318425 |
| 对照shRNA | Addgene | 8453 | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | Mdivi-1 | Sigma-Aldrich | M0199 |
| 免疫印迹 | 抗Drp1抗体 | Cell Signalling | 5391 |
| 抗p-Drp1 (Ser616)抗体 | Cell Signalling | 3455 | |
| 抗p-Drp1 (Ser637)抗体 | Cell Signalling | 4867 | |
| 抗OPA1抗体 | BD Biosciences | 612607 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcepta | AM1021B | |
| 抗ATPB抗体 | Abcam | ab14730 | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab263899 | |
| 抗GSDMD抗体 | Abcam | ab209845 | |
| 抗烯醇化酶抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271384 | |
| 正常小鼠IgG | Santa Cruz Biotechnology | sc-2343 | |
| 抗Mff抗体 | Proteintech | 17090-1-AP | |
| 抗Fis1抗体 | Proteintech | 10956-1-AP | |
| 抗MIEF抗体 | Proteintech | 20164-1-AP | |
| 抗HK1抗体 | Proteintech | 19662-1-AP | |
| 抗Tom20抗体 | Proteintech | 11802-1-AP | |
| 抗Mfn1抗体 | Abnova | J1281-3C9 | |
| 抗Mfn2抗体 | Abnova | J5091-6A8 | |
| 抗caspase-1抗体 | AdipoGen | AG-20B-0042-C100 | |
| 抗IL-1β抗体 | Bioss | bs-0812R | |
| 免疫荧光 | 抗F4/80抗体 | Invitrogen | CI:A3-1 |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
| 细胞刺激 | 牙龈卟啉单胞菌脂多糖 | Invivogen | tlrl-ppglps |
| 线粒体检测 | 四甲基罗丹明甲酯 | Invivogen | T668 |
| MitoSOX红色线粒体超氧化物指示剂 | Beyotime Biotechnology | M36008 | |
| mPTP检测 | mPTP检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C2009 |
| 线粒体检测 | MitoTracker Red CMXRos | Beyotime Biotechnology | C1049B |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白定量试剂盒 | Vazame | -- |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY401 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY008 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和刺激 | RAW264.7细胞用1 μg/mL Pg LPS处理,THP-1巨噬细胞用MOI=100的Pg处理,处理时间0-48小时 阅读提示:Methods 2.3 Cell Culture |
| Drp1敲低 | 使用Drp1 shRNA (TRCN0000318425)或对照shRNA(Addgene #8453)转染,嘌呤霉素筛选浓度3 μg/mL,处理48小时 阅读提示:Methods 2.4 Transfection |
| Drp1抑制 | Mdivi-1浓度5 μM,预处理2小时 阅读提示:Figure 4 legend |
| mPTP开放检测 | 使用calcein (2 μM)和MitoTracker (100 nM)孵育25分钟,CoCl2 (2 mM)处理15分钟 阅读提示:Methods 2.9 mPTP Opening Detection |
| 统计分析 | 除Figure 1外所有实验重复3次,使用t检验和单因素方差分析,p<0.05 阅读提示:Methods 2.13 Quantification and Statistical Analysis |