MFAP4 表达与临床相关性分析
评估 MFAP4 在肝纤维化组织和活化 HSC 中的表达水平及其与纤维化阶段的关系。
利用 GEO 数据集 GSE14323 和 GSE84044 进行差异表达和相关分析;对人正常和肝硬化肝组织进行免疫组化染色;对小鼠 CCl4 和 TAA 模型肝组织进行 qPCR、Western blot 和 IHC 检测;对 LX-2 细胞进行 TGF-β1 刺激后检测 MFAP4 表达。
MFAP4 Deficiency Attenuates Liver Fibrosis by Regulating Hepatic Stellate Cell Fate Through Inhibition of the FAK/PI3K/NFκB Signaling Pathway
包括人类肝组织免疫组化、两种小鼠纤维化模型、LX-2 细胞体外功能实验、共培养、机制抑制剂和体内敲除验证,证据层级完整。
LX-2 人肝星状细胞系 THLE-2 人肝细胞系 C57BL/6J 小鼠 CCl4 诱导肝纤维化模型 C57BL/6J 小鼠 TAA 诱导肝纤维化模型
MFAP4 敲除小鼠的构建背景及基因型验证 CCl4 和 TAA 诱导肝纤维化的给药剂量、途径和时间 TGF-β1 活化 LX-2 细胞的浓度和时间 整合素 αvβ3 抑制剂 cilengitide 和 Cyclo(-RGDfK) 的使用浓度 FAK 抑制剂 defactinib hydrochloride 的使用浓度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估 MFAP4 在肝纤维化组织和活化 HSC 中的表达水平及其与纤维化阶段的关系。
利用 GEO 数据集 GSE14323 和 GSE84044 进行差异表达和相关分析;对人正常和肝硬化肝组织进行免疫组化染色;对小鼠 CCl4 和 TAA 模型肝组织进行 qPCR、Western blot 和 IHC 检测;对 LX-2 细胞进行 TGF-β1 刺激后检测 MFAP4 表达。
验证 MFAP4 缺乏是否减轻 CCl4 和 TAA 诱导的肝纤维化。
使用 Mfap4-/- 小鼠和 WT 小鼠,分别用 CCl4 和 TAA 诱导肝纤维化,检测血清 ALT/AST、肝组织 HE、天狼星红染色、IHC 检测 Col1 和 α-SMA,以及 qPCR 和 Western blot 检测纤维化标志物。
评估 MFAP4 对 HSC 活化、增殖、迁移和凋亡的影响。
在 LX-2 细胞中,通过 MFAP4 过表达或敲低、重组人 MFAP4(rMFAP4)处理,检测纤维化标志物、细胞增殖(CCK-8)、迁移(Transwell)、凋亡(Western blot 和流式细胞术)。
确定 MFAP4 的促纤维化作用是否主要依赖 HSC 而非肝细胞。
通过双免疫荧光检测 MFAP4 与 α-SMA(HSC 标记)和 ALB(肝细胞标记)的共定位,并在 Transwell 共培养系统中分别敲低 HSC 或肝细胞中 MFAP4,检测纤维化标志物变化。
验证 MFAP4 是否与 HSC 膜上的整合素 αvβ3 结合。
通过免疫共沉淀(Co-IP)和免疫荧光检测 MFAP4 与整合素 αv/β3 的相互作用,并在体内外模型中验证。
阐明 MFAP4 调节 HSC 活化和凋亡的下游信号通路。
使用整合素抑制剂、FAK 抑制剂处理 LX-2 细胞,检测 FAK、PI3K、p65 的磷酸化水平,并检测 p-P65 的核转位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| 药物处理 | 转化生长因子-β | PeproTech | -- |
| 盐酸地法替尼 | MCE | HY-12289A | |
| 重组人 MFAP4 蛋白 | MCE | HY-P77993 | |
| Western blot | RIPA 裂解液 | -- | -- |
| 蛋白 A/G 琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Cytiva | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Bosterbio | -- | |
| 化学发光底物 | Invitrogen | -- | |
| qPCR | TRIZOL 试剂 | TransGen Biotech | -- |
| cDNA 合成试剂盒 | TransGen Biotech | -- | |
| SYBR Green 预混液 | Yeasen Biotechnology | -- | |
| ELISA | MFAP4 酶联免疫吸附测定试剂盒 | MLBio | -- |
| 细胞增殖 | CCK-8 溶液 | Beyotime | -- |
| 细胞迁移 | Transwell 小室 | Corning | -- |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | 膜联蛋白 V-Alexa Fluor 647 | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 动物实验 | 硫代乙酰胺 | -- | -- |
| 组织学 | 天狼星红 | -- | -- |
| 免疫组化 | 抗 α-SMA 抗体 | Abcam | ab5694 |
| 抗 Col1a1 抗体 | CST | 91144S | |
| 抗 MFAP4 抗体 | Proteintech | 17661-1-1-AP | |
| 免疫荧光 | 抗 α-SMA 抗体 | Abcam | ab5694 |
| 抗 α-SMA 抗体 | Proteintech | 67735-1-Ig | |
| 抗 ALB 抗体 | Proteintech | 66051-1-Ig | |
| 抗 MFAP4 抗体 | Abcam | ab174845 | |
| 抗 MFAP4 抗体 | Proteintech | 17661-1-AP | |
| 抗磷酸化 P65 抗体 | CST | 3033T | |
| 抗整合素 αv 抗体 | Santa Cruz | sc9969 | |
| 抗整合素 β3 抗体 | Santa Cruz | sc9969 | |
| 抗裂解 Caspase 3 抗体 | Proteintech | 25128-1-AP | |
| 山羊抗兔荧光二抗 | Thermo Fisher | A-11008 | |
| 山羊抗小鼠荧光二抗 | Thermo Fisher | A-11005 | |
| DAPI | -- | -- | |
| Western blot | 抗 GAPDH 抗体 | CST | 5174S |
| 抗 Col1 抗体 | Abcam | ab270993 | |
| 抗 α-SMA 抗体 | Abcam | ab5694 | |
| 抗 TIMP1 抗体 | Bioss | bsm-10895M | |
| 抗 MFAP4 抗体 | Abcam | ab174845 | |
| 抗磷酸化 FAK 抗体 | CST | 3284T | |
| 抗 FAK 抗体 | Santa Cruz | sc271126 | |
| 抗磷酸化 PI3K 抗体 | CST | 4228T | |
| 抗 PI3K 抗体 | CST | 4257T | |
| 抗磷酸化 P65 抗体 | CST | 3033T | |
| 抗 P65 抗体 | CST | 8242T | |
| 抗整合素 αv 抗体 | Santa Cruz | sc9969 | |
| 抗整合素 β3 抗体 | Santa Cruz | sc9969 | |
| 抗 Bax 抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| 抗 Bcl2 抗体 | Proteintech | 12789-1-AP | |
| 抗裂解 Caspase 3 抗体 | Proteintech | 25128-1-AP | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| qPCR | NanoDrop 2000 分光光度计 | Thermo Scientific | -- |
| 细胞增殖 | 酶标仪 | -- | -- |
| 细胞迁移 | 显微镜 | Olympus | -- |
| 免疫荧光 | 正置荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | Agilent | -- |
| TUNEL | TUNEL 检测试剂盒 | Servicebio | -- |
| 图像分析 | ImageJ 软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系、性别、周龄、CCl4 剂量、注射频率、持续时间、TAA 浓度、饮用时间 阅读提示:Materials and Methods: "Liver Fibrosis Mice Models" |
| 细胞培养与处理 | LX-2 细胞来源、培养基、TGF-β1 浓度、处理时间、rMFAP4 浓度、转染试剂、siRNA 浓度、MOI 阅读提示:Materials and Methods: "Cell Culture, Transfection, and Infection" and 图 3、6、7 图注 |
| 信号通路抑制剂 | cilengitide 浓度、Cyclo(-RGDfK) 浓度、defactinib 浓度、处理时间 阅读提示:Materials and Methods: "Reagents" 及图 10 图注 |
| 蛋白检测 | 抗体来源、稀释比例、细胞裂解方法、IP 抗体用量 阅读提示:Materials and Methods: "Coimmunoprecipitation and Western Blot Analysis" |
| 组织学检测 | 组织固定、切片厚度、抗原修复条件、抗体稀释比例 阅读提示:Materials and Methods: "Histologic and Immunohistochemistry" |