临床样本中circMTO1和miR-30c-5p表达检测
验证circMTO1和miR-30c-5p在OSF组织中的差异表达及其相关性
收集OSF组织和正常黏膜组织,通过RT-qPCR检测circMTO1和miR-30c-5p水平,并进行Pearson相关性分析。
circMTO1/miR-30c-5p/SOCS3 axis alleviates oral submucous fibrosis through inhibiting fibroblast-myofibroblast transition
包含临床样本检测、细胞功能实验(迁移、侵袭)、分子机制验证(双荧光素酶、RIP、RNA pull-down、FISH)及抑制剂回复实验,但缺乏体内动物模型验证。
口腔黏膜下纤维化组织(n=20)和正常黏膜组织(n=20) 槟榔碱刺激的颊黏膜成纤维细胞(BMFs) 293T细胞(用于双荧光素酶报告实验)
临床样本:OSF组织和正常黏膜组织各20例,来源为湖南湘雅口腔医院,收集时间2019年6月至2021年3月 细胞处理:BMFs暴露于槟榔碱(20μg/mL)24小时 抑制剂处理:TAE226(1μM)或LY294002(20μM) circMTO1过表达或敲低,以及miR-30c-5p mimics或inhibitor的转染 双荧光素酶报告实验使用293T细胞,共转染WT或MUT-circMTO1/SOCS3质粒和miR-30c-5p mimics或inhibitor
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证circMTO1和miR-30c-5p在OSF组织中的差异表达及其相关性
收集OSF组织和正常黏膜组织,通过RT-qPCR检测circMTO1和miR-30c-5p水平,并进行Pearson相关性分析。
检测circMTO1在槟榔碱刺激的BMFs中的表达,并验证其环状稳定性
使用RT-qPCR检测槟榔碱刺激的BMFs中circMTO1和miR-30c-5p表达;用RNase R处理总RNA后检测circMTO1表达。
验证circMTO1过表达是否抑制槟榔碱诱导的BMFs中FMT
将pcDNA3.1-circMTO1或pcDNA3.1-NC转染至BMFs,然后用槟榔碱处理,通过伤口愈合、Transwell实验检测迁移和侵袭,通过RT-qPCR和Western blot检测Coll I、α-SMA和Vimentin表达。
证实circMTO1直接结合并海绵吸附miR-30c-5p
通过StarBase预测结合位点,采用双荧光素酶报告实验、RNA pull-down和FISH验证结合;检测circMTO1敲低或过表达后miR-30c-5p水平变化。
证明circMTO1抑制FMT是通过海绵吸附miR-30c-5p实现的
在BMFs中共转染miR-30c-5p mimics和pcDNA3.1-circMTO1(或对照),然后用槟榔碱处理,检测FMT相关指标。
确认SOCS3是miR-30c-5p的直接靶基因,并检测其在OSF中的表达及相关性
通过StarBase预测结合位点,双荧光素酶报告实验和RIP验证结合;RT-qPCR检测OSF组织中SOCS3表达,并分析与circMTO1和miR-30c-5p的相关性;检测miR-30c-5p或circMTO1改变后SOCS3表达。
验证miR-30c-5p抑制剂是否通过上调SOCS3抑制槟榔碱诱导的FMT
在BMFs中共转染sh-SOCS3和miR-30c-5p inhibitor,然后用槟榔碱处理,检测FMT指标及信号通路蛋白磷酸化。
验证SOCS3沉默通过激活FAK/PI3K/AKT通路促进FMT
用FAK抑制剂TAE226或PI3K抑制剂LY294002处理SOCS3沉默的BMFs,检测蛋白磷酸化、迁移、侵袭及FMT标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Solarbio | -- |
| 胎牛血清 | BI | -- | |
| 药物处理 | 槟榔碱 | Sigma-Aldrich | -- |
| 信号通路抑制 | TAE226 | MCE | -- |
| LY294002 | MCE | -- | |
| RNA提取 | TRizol RNA提取试剂盒 | Engreen | -- |
| 逆转录 | PrimescriptTM逆转录试剂 | TaKaRa | -- |
| Mir-X™ miRNA第一链合成试剂盒 | Clontech | -- | |
| RT-qPCR | SYBR Green实时PCR预混液 | SinoBio | -- |
| RNA稳定性检测 | RNase R | Epicentre | -- |
| Western blotting | 组织或细胞总蛋白提取试剂盒 | Sangon Biotech | -- |
| Coll I抗体 | Bioss | bs-7158R | |
| α-SMA抗体 | Bioss | bs-0189R | |
| SOCS3抗体 | Boster | PB0452 | |
| FAK抗体 | Bioss | bs-20735R | |
| p-FAK抗体 | Bioss | bs-3159R | |
| PI3K抗体 | Bioss | bsm-52216R | |
| p-PI3K抗体 | Bioss | bs-3332R | |
| AKT抗体 | Boster | A00024 | |
| p-AKT抗体 | Boster | BM4762 | |
| Vimentin抗体 | Bioss | bs-23063R | |
| β-actin抗体 | Boster | BA2305 | |
| 鼠抗兔IgG/HRP | Bioss | bs-0295M-HRP | |
| ECL Western blot底物试剂盒 | Abcam | -- | |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 基质胶 | BD | -- | |
| 结晶紫 | Solarbio | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | pGL3载体 | Promega | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| RNA pull-down | 链霉亲和素磁珠 | Thermo Fisher | -- |
| RIP | RIPA裂解液 | Bioss | -- |
| FISH | DAPI | Beyotime | -- |
| 显微镜观察 | 显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | OSF组织(n=20)和正常黏膜组织(n=20)的收集时间、医院和伦理审批号 阅读提示:Methods 2.1 Clinical sample collection |
| 细胞培养和处理 | BMFs的分离方法、培养条件(DMEM、10% FBS)、代次(3-5代)、槟榔碱浓度(20μg/mL)和时间(24小时) 阅读提示:Methods 2.2 Cell culture and treatment |
| 细胞转染或感染 | 慢病毒载体(pcDNA3.1-circMTO1、sh-circMTO1、sh-SOCS3等)的生产公司(RiboBio)、感染方法 阅读提示:Methods 2.3 Lentivirus infection |
| 信号通路抑制 | TAE226(1μM)和LY294002(20μM)的处理时间 阅读提示:Methods 2.2 Cell culture and treatment、Results 3.7 |
| 关键分子检测 | 引物序列(Table S2)、内参基因(GAPDH、U6)、抗体稀释比例和货号 阅读提示:Methods 2.4 RT-qPCR、2.6 Western blotting、Supporting Information Table S2 |