临床样本及动物模型中EGR2表达检测
探究EGR2在肾纤维化中的表达变化及其定位。
收集CKD患者肾活检组织和癌旁肾组织,通过Masson染色评估纤维化,免疫组化检测EGR2表达和定位;建立UUO和UIRI小鼠模型,通过Western blot、RT-qPCR和免疫组化检测EGR2表达和定位。
Early growth response protein 2 promotes partial epithelial-mesenchymal transition by phosphorylating Smad3 during renal fibrosis
包含患者样本、UUO小鼠模型和HK2细胞等多层级实验,并通过基因敲低/过表达、Western blot、免疫组化、免疫荧光、RT-qPCR等方法进行功能验证和机制验证。
慢性肾脏病患者肾活检标本 单侧输尿管梗阻(UUO)小鼠模型 肾单侧缺血再灌注(UIRI)小鼠模型 人肾2(HK2)细胞株
EGR2在CKD患者和UUO小鼠肾组织中的表达和定位 体内shEGR2 AAV基因敲低和EGR2 AAV过表达对纤维化指标的影响 体外siEGR2敲低和EGR2过表达对TGF-β1诱导的HK2细胞部分EMT的影响 EGR2对Smad3磷酸化(p-Smad3)的调控 STAT3抑制剂stattic对EGR2表达和p-Smad3的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究EGR2在肾纤维化中的表达变化及其定位。
收集CKD患者肾活检组织和癌旁肾组织,通过Masson染色评估纤维化,免疫组化检测EGR2表达和定位;建立UUO和UIRI小鼠模型,通过Western blot、RT-qPCR和免疫组化检测EGR2表达和定位。
验证EGR2在肾纤维化中的功能作用。
在UUO小鼠中,通过肾内注射shEGR2 AAV进行敲低,或EGR2 AAV进行过表达,评估纤维化指标(Collagen I, Fibronectin)、部分EMT标志物(Vimentin, α-SMA)、MMPs和TIMPs的变化。
在细胞水平验证EGR2对部分EMT和ECM沉积的影响。
用TGF-β1处理HK2细胞,通过siRNA敲低EGR2或质粒过表达EGR2,检测纤维化标志物、部分EMT标志物、MMPs和TIMPs的表达。
探究EGR2促进肾纤维化的分子机制是否涉及Smad3磷酸化。
在UUO小鼠和HK2细胞中,通过Western blot和免疫组化检测p-Smad3水平,在EGR2敲低或过表达后观察p-Smad3的变化。
探究EGR2的上游调控机制,验证p-STAT3是否参与调控EGR2表达。
使用STAT3磷酸化抑制剂stattic处理HK2细胞,检测p-STAT3、EGR2、p-Smad3以及纤维化标志物的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | Beijing Vital River Laboratory Animal Technology | -- |
| shEGR2腺相关病毒 | Shandong Vigene Biosciences | -- | |
| scra腺相关病毒 | Shandong Vigene Biosciences | -- | |
| EGR2腺相关病毒 | Shandong Vigene Biosciences | -- | |
| GFP腺相关病毒 | Shandong Vigene Biosciences | -- | |
| 组织学染色 | 二甲苯 | -- | -- |
| 乙醇 | -- | -- | |
| Triton | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 丽春红酸性品红溶液 | -- | -- | |
| 磷钼酸水溶液 | -- | -- | |
| 苯胺蓝溶液 | -- | -- | |
| 天狼星红染色溶液 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F12完全培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 转化生长因子β1 | R&D systems | PRD240 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine™ 2000 | -- | -- |
| EGR2小干扰RNA | -- | -- | |
| 阴性对照siRNA | -- | -- | |
| EGR2过表达质粒 | -- | -- | |
| pcDNA3.1质粒 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Merck Millipore | -- | |
| 脱脂奶粉 | -- | -- | |
| ECL化学发光液 | -- | -- | |
| BioSpectrum成像系统 | UVP | -- | |
| Image J软件 | NIH | -- | |
| RT-qPCR | RNA提取试剂 | Servicebio | G3013 |
| K5800C微量分光光度计 | KAIAO Technology | -- | |
| HiScript III逆转录预混液 | Vazyme | R323-01 | |
| SYBR Green预混液 | Vazyme | Q221-01 | |
| ROX参比染料1 | -- | -- | |
| 免疫组化/免疫荧光 | 抗EGR2抗体 | Novus | NB110-59723SS |
| 抗纤连蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | SAB5700724 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5741T | |
| 抗α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Abcam | ab125884 | |
| 抗TIMP1抗体 | Bioss | BSM-10895 | |
| 抗磷酸化Smad3抗体 | Cell Signaling Technology | 9520T | |
| Western blot | 抗EGR2抗体 | Abcam | ab245228 |
| 抗I型胶原抗体 | Abcam | ab260043 | |
| 抗α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| 抗MMP9抗体 | ABclonal | A11147 | |
| 抗MMP2抗体 | ABclonal | A6247 | |
| 抗TIMP1抗体 | ABclonal | A1389 | |
| 抗TIMP3抗体 | ABclonal | A11986 | |
| 抗Smad3抗体 | ABclonal | A7536 | |
| 抗STAT3抗体 | Bioworld | AP0365 | |
| 抗磷酸化STAT3(Y705)抗体 | Cell Signaling Technology | 9145T | |
| 抗磷酸化STAT3(S727)抗体 | Bioworld | AP0248 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor® 594标记二抗 | Jackson | 711-585-152 |
| Alexa Fluor® 488标记二抗 | Jackson | 711-545-152 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 免疫组化/免疫荧光 | 辣根过氧化物酶标记二抗 | Servicebio | -- |
| 显微镜观察 | DS-Ri2显微镜 | Nikon | -- |
| DMi8荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 细胞处理 | stattic | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型(UUO) | 小鼠品系、年龄、性别;手术结扎方式;分组;AAV注射剂量、时间、途径;术后观察天数;样本采集时间。 阅读提示:见“Unilateral ureteral obstruction mice model and treatment” |
| 动物模型(UIRI) | 小鼠品系、年龄、性别;缺血时间;分组;术后观察天数。 阅读提示:见“Renal unilateral ischemia-reperfusion injury mice model” |
| 细胞培养与处理 | HK2细胞来源;培养基成分;TGF-β1浓度和处理时长;siRNA转染试剂和浓度;质粒转染试剂和浓度;stattic浓度和处理时长。 阅读提示:见“Cell culture and treatment” |
| 蛋白检测 | 抗体品牌、货号、稀释比例;蛋白上样量;封闭液和封闭时间;二抗孵育时间;显色方法。 阅读提示:见“Western blot analysis” |
| 基因表达检测 | RNA提取试剂和方法;逆转录试剂盒和条件;RT-qPCR反应体系和程序;引物序列;内参基因。 阅读提示:见“Real-time quantitative polymerase chain reaction” |
| 组织学染色 | 石蜡切片脱蜡和脱水步骤;染色溶液的浓度和孵育时间;成像条件。 阅读提示:见“Masson's trichrome staining”和“Sirius red staining” |