检测WTAP在糖尿病胰岛中的表达
评估WTAP在2型糖尿病胰岛β细胞中的表达变化及其潜在调控因素。
分析公开的胰岛单细胞RNA-seq数据(GSE153855)中Wtap的表达;分离C57BL/6小鼠原代胰岛和培养INS-1 832/13细胞,用PA或细胞因子处理,通过qRT-PCR和免疫印迹检测Wtap mRNA和WTAP蛋白水平。
Deficiency of WTAP in islet beta cells results in beta cell failure and diabetes in mice
包含细胞实验、基因敲除小鼠模型、RNA-seq和MeRIP-seq等多层级证据,并进行功能验证和机制验证。
INS-1 832/13细胞 Wtap-betaKO小鼠(β细胞特异性Wtap敲除) Wtap-betaKO/Mettl3-betaOE小鼠(β细胞特异性Mettl3过表达)
Wtap-betaKO小鼠的基因型为Wtapflox/floxRIP-Cre+/−,对照为Wtapflox/flox小鼠 Wtap-betaKO小鼠从4周龄开始血糖升高,8周龄后持续高于20 mmol/l(360 mg/dl) 体外GSIS测定使用基础葡萄糖浓度2.8 mmol/l和高糖浓度16.7 mmol/l 细胞因子处理使用TNF-α 20 ng/ml、IL-1β 20 ng/ml和IFN-γ 200 ng/ml RNA-seq和MeRIP-seq数据已存储于GEO(GSE215156和GSE215360)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估WTAP在2型糖尿病胰岛β细胞中的表达变化及其潜在调控因素。
分析公开的胰岛单细胞RNA-seq数据(GSE153855)中Wtap的表达;分离C57BL/6小鼠原代胰岛和培养INS-1 832/13细胞,用PA或细胞因子处理,通过qRT-PCR和免疫印迹检测Wtap mRNA和WTAP蛋白水平。
确定β细胞特异性Wtap缺失是否导致β细胞衰竭和糖尿病。
通过Wtapflox/flox小鼠与RIP-Cre小鼠杂交构建Wtap-betaKO小鼠,监测血糖、葡萄糖耐量、血清胰岛素、胰岛素含量、β细胞凋亡和胰高血糖素水平。
揭示Wtap缺失对胰岛基因表达和m6A修饰的影响。
对Wtap-betaKO和对照小鼠分离的胰岛进行RNA-seq和MeRIP-seq,分析差异表达基因、KEGG通路、GO富集以及m6A峰变化。
确认WTAP是否与METTL3结合并影响其蛋白稳定性。
在INS-1 832/13细胞中过表达FLAG-METTL3或FLAG-WTAP,通过免疫共沉淀和免疫印迹检测相互作用;在Wtap-betaKO胰岛中检测METTL3蛋白和mRNA水平。
检验METTL3过表达能否挽救Wtap缺失引起的β细胞衰竭和糖尿病。
将Wtap-betaKO小鼠与Mettl3-betaOE小鼠杂交,构建Wtap-betaKO/Mettl3-betaOE小鼠,评估血糖、体重、葡萄糖耐量、胰岛素敏感性、血清胰岛素、胰岛素含量和胰岛素阳性面积等指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因敲除小鼠构建 | CRISPR-Cas9 | -- | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| β-巯基乙醇 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 肿瘤坏死因子-α | -- | -- |
| 白细胞介素-1β | -- | -- | |
| 干扰素-γ | -- | -- | |
| 棕榈酸 | -- | -- | |
| 胰岛分离 | 胶原酶P | Roche Diagnostics | -- |
| 免疫沉淀 | 抗FLAG抗体 | Sigma | F1804 |
| 免疫印迹 | 抗METTL3抗体 | CST | 96391 |
| 抗FLAG抗体 | Proteintech | 20543-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 60008-1-lg | |
| 抗WTAP抗体 | Proteintech | 10200-1-lg | |
| 山羊抗小鼠IgG(H+L)HRP二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2305 | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)HRP二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2301 | |
| 免疫组化 | 抗胰岛素抗体 | Dako | A0564 |
| 抗胰高血糖素抗体 | Sigma | G2654 | |
| 山羊抗豚鼠IgG(H+L)AF488二抗 | Bioss | bs-0358G-AF488 | |
| cy3山羊抗小鼠IgG(H+L)二抗 | APExBIO | K1207 | |
| TUNEL检测 | 细胞死亡检测试剂盒 | Roche Diagnostics | -- |
| ELISA | 胰高血糖素ELISA试剂盒 | R&D Systems | DGCG0 |
| 胰岛素ELISA试剂盒 | EZassay | MS100 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad Software | version 6.02 |
| SPSS | SPSS | 21.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 基因型:Wtap-betaKO为Wtapflox/floxRIP-Cre+/−;对照为Wtapflox/flox。品系背景:C57BL/6J。 阅读提示:Methods: Animal experiments |
| 细胞培养与处理 | INS-1 832/13细胞培养条件:37°C,5% CO2,RPMI-1640+10% FBS+50 mmol/l β-巯基乙醇。处理:PA 0.5 mmol/l或细胞因子(TNF-α 20 ng/ml, IL-1β 20 ng/ml, IFN-γ 200 ng/ml)过夜。 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 胰岛分离 | 使用HBSS(pH 7.4)含5 mmol/l葡萄糖和1 mg/ml胶原酶P,37°C孵育10分钟。 阅读提示:Methods: Pancreatic islet isolation |
| GSIS测定 | 体外GSIS检测基础葡萄糖浓度2.8 mmol/l,高糖浓度16.7 mmol/l。体内GSIS方法见ESM。 阅读提示:Methods: Pancreatic islet isolation; Figure 2 legend; ESM Methods |
| 组织学分析 | 胰腺固定:4% PFA 3小时,30%蔗糖过夜;切片厚度10 μm,间距>200 μm;每个小鼠取5张切片。 阅读提示:Methods: Immunostaining and TUNEL assays |