验证胞葬作用诱导巨噬细胞增殖
确定凋亡细胞摄入是否能促进巨噬细胞增殖
将BMDMs与DiD标记的凋亡Jurkat细胞共孵育,去除未吞噬的ACs后继续培养,通过Ki67、EdU和CFSE检测增殖。
Efferocytosis induces macrophage proliferation to help resolve tissue injury
包含体外细胞模型、小鼠体内模型(腹膜炎症、胸腺凋亡、动脉粥样硬化消退)及患者来源巨噬细胞,并进行了功能验证和机制验证。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 人单核细胞来源巨噬细胞(HMDMs) 小鼠酵母聚糖诱导的腹膜炎模型 小鼠地塞米松诱导的胸腺细胞凋亡模型 小鼠动脉粥样硬化消退模型
巨噬细胞增殖标记物(Ki67、EdU、CFSE)的检测 凋亡细胞摄入与吞噬溶酶体降解(Rubicon、bafilomycin、Dnase2a) DNA-PKcs(Prkdc)和mTORC2(Rictor)信号通路的抑制 Myc及下游Bhlhe40和c-Maf的表达变化 体内模型中巨噬细胞增殖和组织消退的关联性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定凋亡细胞摄入是否能促进巨噬细胞增殖
将BMDMs与DiD标记的凋亡Jurkat细胞共孵育,去除未吞噬的ACs后继续培养,通过Ki67、EdU和CFSE检测增殖。
探究凋亡细胞DNA降解是否驱动增殖
使用siRNA敲低Rubicon或Dnase2a,或用bafilomycin处理,以阻断吞噬溶酶体降解,检测EdU掺入和细胞数变化。
确定凋亡细胞衍生的核苷酸激活DNA-PKcs和mTORC2是否介导增殖
敲低Prkdc或Rictor,检测EdU掺入、DNA-PKcs磷酸化、Akt磷酸化,并评估MK-2206的作用。
确定Myc和Bhlhe40/c-Maf在增殖中的作用
敲低Myc或Bhlhe40,过表达c-Maf,检测EdU掺入、细胞数和相关蛋白表达。
评估EIMP巨噬细胞的胞葬能力和细胞因子产生
比较EIMP巨噬细胞和对照巨噬细胞对单次和连续凋亡细胞摄入的能力,以及TGFβ和IL-10的产生。
在动物模型中验证EIMP的存在及其对组织消退的作用
在酵母聚糖诱导的腹膜炎、地塞米松诱导的胸腺凋亡和动脉粥样硬化消退模型中,检测胞葬巨噬细胞的增殖,并通过基因敲除验证其功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | 10-013-CV |
| 胎牛血清 | GIBCO | 10438-026 | |
| 青霉素/链霉素 | Corning | 30-002-CI | |
| 细胞凋亡诱导 | Vybrant DiD细胞标记试剂 | Invitrogen | -- |
| 膜联蛋白V | BD Biosciences | 560931 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Life Technologies | 13778-150 |
| 增殖检测 | EdU增殖检测试剂盒 | Abcam | ab219801 |
| 流式细胞术 | FACS Canto II流式细胞仪 | BD | -- |
| 细胞计数 | Countess II自动细胞计数器 | Invitrogen | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | 1620115 |
| RNA提取 | PureLink RNA小量提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 12183025 |
| qPCR | SYBR Green主混合物 | Applied Biosystems | 4367659 |
| 巨噬细胞极化 | 白细胞介素4 | Sigma-Aldrich | SRP3211 |
| 干扰素γ | Peprotech | 315-05 | |
| 抑制剂处理 | 巴佛洛霉素A1 | Sigma-Aldrich | B1793 |
| MEK抑制 | U0126 | Tocris Bio-Techne | 1144 |
| Akt抑制 | MK-2206 | -- | -- |
| 凋亡细胞标记 | pHrodo Green荧光染料 | Thermo Scientific | P35373 |
| pHrodo Red荧光染料 | Thermo Scientific | P35372 | |
| 细胞标记 | PKH67细胞荧光标记染料 | Sigma-Aldrich | PKH67GL-1KT |
| PKH26细胞荧光标记染料 | Sigma-Aldrich | PKH26GL-1KT | |
| 凋亡诱导 | 地塞米松 | Calbiochem | 265005 |
| 腹膜炎诱导 | 酵母聚糖A | Sigma-Aldrich | Z4250 |
| 纳米颗粒合成 | 聚乳酸-羟基乙酸共聚物 | LACTEL Absorbable Polymers | B6013-2 |
| 马来酰亚胺修饰的DSPE-PEG | Nanocs Inc. | PG2-DSML-3k | |
| S2P肽 | GLS Biochem Systems Inc | 652358 | |
| 基因编辑 | TAT-Cre重组酶 | Millipore | -- |
| 组织染色 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Roche | 12156792910 |
| 蛋白检测 | Ki67抗体 | Abcam | ab16667 |
| Myc抗体 | Proteintech | 10828-1-AP | |
| Rictor抗体 | Cell Signaling Technology | 2114S | |
| Mac2抗体 | Cedarlane | CL8942AP | |
| DNA-PKcs抗体 | Invitrogen | MA5-32192 | |
| Bhlhe40抗体 | Invitrogen | PA1-16546 | |
| c-Maf抗体 | Invitrogen | PA5-23179 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞培养 | BMDMs培养条件:骨髓细胞培养于含10% HI-FBS和20% L-929条件培养基的DMEM中7-10天 阅读提示:STAR Methods, Primary Cell Culture |
| 巨噬细胞极化 | IL-4浓度10 ng/mL处理24小时;LPS浓度50 ng/mL和IFN-γ浓度25 ng/mL处理24小时 阅读提示:STAR Methods, Primary Cell Culture |
| 胞葬作用诱导增殖实验 | AC:巨噬细胞比例为5:1,共孵育45分钟,去除未吞噬的ACs后继续培养24小时 阅读提示:STAR Methods, Efferocytosis-Induced Macrophage Proliferation Assay and Flow Cytometry |
| 基因沉默 | siRNA浓度50 nM,Lipofectamine RNAiMAX转染18小时,再培养30小时 阅读提示:STAR Methods, siRNA-mediated Gene Silencing |
| 体内腹膜炎模型 | 腹腔注射1 mg zymosan A诱导腹膜炎,EdU预注射剂量200 μg/小鼠 阅读提示:STAR Methods, Zymosan-Induced Peritonitis and Peritoneal Uptake of Labeled ACs |
| 体内胸腺凋亡模型 | 腹腔注射250 μg地塞米松,18小时后分析胸腺 阅读提示:STAR Methods, Thymus Assays |
| 动脉粥样硬化消退模型 | Ldlr-/-小鼠喂西方饮食16周,然后注射HDAd-LDLR并转换饮食5周 阅读提示:STAR Methods, Tissue Collection and Lesion Analysis |
| 纳米颗粒给药 | S2P-NPs(siRictor或siDnase2a)每周两次静脉注射,持续5周 阅读提示:STAR Methods, siRictor and siDnase2a S2P-Nanoparticles |