H3K27M突变、组蛋白H3K27甲基化状态和EZH2表达在弥漫性脊髓胶质瘤中的预后作用

Prognostic role of H3K27M mutation, histone H3K27 methylation status, and EZH2 expression in diffuse spinal cord gliomas

作者信息Yukitomo Ishi, Soichiro Takamiya, Toshitaka Seki, Kazuyoshi Yamazaki, Kazutoshi Hida, Kanako C Hatanaka, Yusuke Ishida, Yoshitaka Oda, Shinya Tanaka, Shigeru Yamaguchi
PMID32529280
发布时间2020-07
DOI10.1007/s10014-020-00369-9

实验完整度

中

包含遗传分析(Sanger测序)、免疫组化(H3K27me3、EZH2)和生存分析(对数秩检验),但样本量小,缺乏独立验证。

主要模型

脊髓胶质瘤患者肿瘤组织样本 H3K27M突变型脊髓胶质瘤 H3K27M野生型脊髓胶质瘤

重点核对

WHO分级:2级12例,3级9例,4级5例 H3K27M突变检测:Sanger测序检测H3F3A和HIST1H3B密码子27 H3K27me3状态:免疫组化,阳性细胞>70%为保留 EZH2表达:免疫组化,阳性细胞0为阴性 生存分析:对数秩检验,p<0.05为显著

摘要

本研究旨在阐明H3F3A K27M突变(H3K27M)的临床意义,并分析H3K27M、H3K27me3状态和EZH2表达与脊髓胶质瘤预后的相关性。对患有脊髓弥漫性胶质瘤的患者(无论WHO分级如何)进行了H3F3A、HIST1H3B、TERT启动子、IDH1/2和BRAF的遗传学分析。通过免疫组织化学分析H3K27me3状态和EZH2表达。随后,使用对数秩检验回顾性分析H3K27M、H3K27me3状态和EZH2表达与预后的关联。共分析26例,其中WHO 4级5例,3级9例,2级12例。尽管WHO 2级病例倾向于更好的总生存期,但差异无统计学意义。H3K27M在4例4级病例(80%)和3例3级病例(33%)中检出,但在3级和4级病例中与预后无关。在WHO 2-4级病例中,H3K27me3保留和EZH2阴性表达的组合与较好的总生存期相关(p = 0.03)。H3K27me3状态和EZH2表达的组合被认为是WHO 2-4级弥漫性脊髓胶质瘤的潜在预后标志物。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
H3K27M突变、H3K27me3状态和EZH2表达在弥漫性脊髓胶质瘤中的预后意义。
核心机制
文中未明确说明
主要证据
26例脊髓胶质瘤患者样本,通过Sanger测序和免疫组化分析,发现H3K27me3保留和EZH2阴性组合与较好总生存期相关(p=0.03)。
研究意义
H3K27me3状态和EZH2表达的组合可能作为弥漫性脊髓胶质瘤(包括WHO 2-4级)的新型预后标志物,且免疫组化所需组织样本少,适合脊髓胶质瘤。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

患者入组与临床资料收集

收集脊髓弥漫性胶质瘤患者并进行回顾性分析。

纳入26例脊髓弥漫性胶质瘤患者,收集年龄、性别、肿瘤位置、手术方式、术后治疗和临床病程等资料。

2

遗传学分析

检测H3F3A、HIST1H3B、TERT、IDH1/2和BRAF基因突变。

从冷冻肿瘤组织或FFPE块提取DNA,通过PCR和Sanger测序检测基因突变热点。

3

免疫组化分析

评估H3K27me3和EZH2表达状态。

对FFPE切片进行免疫组化染色,检测H3K27me3和EZH2表达,由两位病理学家独立评估阳性率。

4

生存分析

分析H3K27M、H3K27me3状态和EZH2表达与总生存期的关联。

使用Kaplan-Meier曲线和对数秩检验比较不同组间的总生存期。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
AllPrep DNA/RNA微型试剂盒QIAGEN--
ReliaPrep FFPE gDNA小提系统Promega--
Amplitaq Gold快速Taq HS染料混合物TOYOBO--
BigDye Terminator v3.1循环测序试剂盒Applied Biosystems--
3130 Avant遗传分析仪Applied Biosystems--
H3K27me3抗体Abcamab6002
EZH2抗体Cell Signaling Technology5246S
MGMT抗体Biossbsm-51234M
Can Get Signal免疫组化溶液ATOYOBO--
EnVision+双联系统-HRPDako--
液体DAB+底物-色原系统Dako--
EZR----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
患者入组
病例数、WHO分级分布、治疗情况
阅读提示:Methods-Patient population及Results-Table 1
遗传学分析
检测的基因位点、PCR引物、测序方法
阅读提示:Methods-Genetic analysis及Supplementary Table
免疫组化
抗体稀释度、抗原修复条件、阳性判读标准
阅读提示:Methods-Immunohistochemical staining及Figure 3图注
生存分析
总生存期定义、统计分析软件及阈值
阅读提示:Methods-Statistical analysis及Results-Prognostic role of H3K27me3 status and EZH2 expression