检测PGN在血清和脑中的存在及水平
验证共生菌来源的PGN能否在正常生理条件下进入循环系统和大脑。
通过SLP检测法检测SPF和GF小鼠血清、小脑、前额叶皮层、纹状体的PGN水平。
The bacterial peptidoglycan-sensing molecule Pglyrp2 modulates brain development and behavior
包含GF小鼠和抗生素处理模型、PGN检测、基因和蛋白表达分析、免疫组化定位、Pglyrp2敲除小鼠行为学及基因表达验证,具有多层级证据。
C57BL/6小鼠 无菌(GF)小鼠 围产期抗生素处理小鼠 Pglyrp2基因敲除小鼠
GF小鼠与SPF小鼠的PGN水平差异(血清和 cerebellum,P25) 出生后不同时间点(P1-P60)脑区PGN感应分子和转运体的表达谱 围产期抗生素处理(氨苄青霉素0.6 mg/ml饮水,孕前5天至产后3天)对纹状体PGN感应分子表达的影响 Pglyrp2敲除对3日龄前额叶皮层和纹状体c-Met、Bdnf、Syp表达的影响(n=5-6/组) 青少年(P22-24)Pglyrp2敲除小鼠三箱社交行为测试(n=8/组)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证共生菌来源的PGN能否在正常生理条件下进入循环系统和大脑。
通过SLP检测法检测SPF和GF小鼠血清、小脑、前额叶皮层、纹状体的PGN水平。
确定PGN感应分子和转运体在发育大脑中的表达是否具有时间、区域和性别特异性。
用RT-qPCR检测纹状体、前额叶皮层和小脑中Pglyrp1-4、Nod1、Nod2、Tlr2和PepT1的mRNA表达,并用Western blot检测Pglyrp2和Pglyrp3蛋白水平。
确定Pglyrp2和Nod1在发育大脑中的细胞定位(神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞)。
使用免疫荧光双重染色标记NeuN(神经元)、Calbindin(浦肯野细胞)、GFAP(星形胶质细胞)和Iba1(小胶质细胞),观察Pglyrp2和Nod1的分布。
检验无菌条件和抗生素处理是否改变发育大脑中PGN感应分子的表达。
比较GF小鼠和围产期抗生素处理小鼠与对照组在3日龄时纹状体中PGN感应分子和转运体的mRNA表达水平。
探究Pglyrp2缺失是否影响突触相关基因表达和社会行为。
使用Pglyrp2 KO小鼠,检测3日龄前额叶皮层、纹状体中c-Met、Bdnf、Syp的表达,并在P22-24进行行为学测试(旷场、明暗箱、高架十字迷宫、三箱社交)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饲养 | C57BL/6N小鼠 | Charles River Laboratories | -- |
| Makrolon III型笼具 | Tecniplast | -- | |
| PGN检测 | 家蚕幼虫血浆检测试剂盒 | Wako Pure Chemical Industries | -- |
| 藤黄微球菌肽聚糖 | Wako Pure Chemical Industries | -- | |
| xMark酶标仪 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 基因表达分析 | SYBR Green实时PCR检测系统 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白表达分析 | Pglyrp2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-50471 |
| Pglyrp3抗体 | MyBioSource | MBS852923 | |
| Hsp90抗体 | Cell Signaling Technology | 4874 | |
| 免疫组织化学 | Pgrp2多克隆兔抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-50471 |
| Nod1多克隆兔抗体 | Bioss Antibodies | bs-7085R | |
| 抗NeuN小鼠单克隆抗体 | Merck Millipore | MAB377 | |
| 抗钙结合蛋白小鼠单克隆抗体 | Abcam | AB82812 | |
| 抗GFAP山羊多克隆抗体 | Abcam | AB53554 | |
| 抗Iba1山羊多克隆抗体 | Abcam | AB5076 | |
| 驴抗兔Cy2抗血清 | -- | -- | |
| 驴抗小鼠Cy5抗血清 | Jackson ImmunoResearch Europe | -- | |
| 驴抗山羊Cy5抗血清 | Jackson ImmunoResearch Europe | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| Triton-X | -- | -- | |
| 甘油 | -- | -- | |
| 脑切片载玻片 | VWR | -- | |
| 杆菌肽 | Sigma | -- | |
| 奥林巴斯XM10数码相机 | Olympus Sverige | -- | |
| 行为学测试 | 旷场箱 | TSE | -- |
| 明暗箱 | TSE | -- | |
| 高架十字迷宫装置 | Kinder Scientific | -- | |
| 三箱社交箱 | -- | -- | |
| 摄像机 | -- | -- | |
| EthoVision XT 7版 | Noldus | -- | |
| 数据分析 | STATVIEW 5.1版 | SAS Institute | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PGN检测 | 样本类型(血清或脑组织)、小鼠品系和日龄、SPF/GF状态、SLP检测试剂盒及参考PGN来源 阅读提示:Materials and methods 的 PGN detection assay 部分 |
| 基因表达分析 | 脑区、小鼠日龄、性别、样本量、引物序列、内参基因(Hsp90ab1) 阅读提示:Materials and methods 的 Quantitative real-time polymerase chain reaction 部分及 Figure 1 图注 |
| 蛋白表达分析 | 抗体稀释度、抗体货号、内参抗体(Hsp90) 阅读提示:Materials and methods 的 Western immunoblotting 部分 |
| 肠道菌群操作 | 抗生素种类(氨苄青霉素)和剂量(0.6 mg/ml)、给药时间(孕前5天至产后3天)、对照组处理 阅读提示:Materials and methods 的 Perturbations of gut microbiota 部分 |
| 行为学测试 | 测试小鼠的日龄(P22-24)、性别、行为学范式(三箱社交)的具体参数(如测试时间10分钟) 阅读提示:Materials and methods 的 Behavioural studies 部分及 Figure 4 图注 |