脑脊液中肿瘤来源游离DNA的检测实现了儿童脑肿瘤的微创分析

Tumor-derived cell-free DNA detected in cerebrospinal fluid enables minimally invasive profiling of pediatric brain tumors

作者信息Liana Nobre, Yoshiko Nakano, Ian Burns, Robert Siddaway, Michal Zápotocky, Monique Johnson, Mansuba Rana, Cyril Li, Rodney K Lyn, Richard Yuditskiy, Michelle Ku, Javal Sheth, Adrian B Levine, Cody L Nesvick, Anirban Das, Chantel Cacciotti, Shayna Zelcer, Seth A Climans, Maria MacDonald, Logine Negm, Jiil Chung, Julie Bennett, Andrew Bondoc, Jim Loukides, Lucie Stengs, Melissa Edwards, Eric Bouffet, Vijay Ramaswamy, Anthony Py Liu, Annie Huang, Ute Bartels, Peter B Dirks, Uri Tabori, Cynthia Hawkins
PMID42294888
发布时间2026-06-15
DOI10.1172/JCI197391

摘要

背景液体活检已成为一种微创的肿瘤诊断、监测和治疗指导方法。对于中枢神经系统肿瘤,脑脊液提供了可靠且易于获取的肿瘤来源的循环游离DNA来源。方法本研究在真实世界前瞻性环境中评估了脑脊液液体活检的临床实用性。共收集了120名患者的148份脑脊液样本,采用微滴式数字PCR和/或二代测序进行分子分析,以检测突变、融合、拷贝数变异及错配修复缺陷特征。样本通过腰椎穿刺(82份;ctDNA阳性率45%)或在手术时或通过分流装置从脑室来源采集(66份;ctDNA阳性率65%)。结果总体而言,54%的样本检测到ctDNA,其中诊断时高级别胶质瘤的检出率(100%,1份样本不确定)高于低级别胶质瘤(50%)。在低级别胶质瘤中,播散性病例的ctDNA检出率更高(80%对比43%),且脑室来源样本的检出率高于腰椎穿刺样本(56%对比38%)。结论液体活检能够区分复发与第二原发恶性肿瘤,连续采样显示ctDNA水平具有追踪治疗反应和疾病进展的潜力。在错配修复缺陷肿瘤患者中,ctDNA的高错配修复缺陷评分支持活动性疾病的存在。这些发现表明,联合液体活检检测有助于诊断、监测和个性化治疗决策,为儿童中枢神经系统肿瘤提供了一种可行的侵入性手术活检替代方案。试验注册无。资助来源病童医院原理验证基金;加拿大卫生研究院;加拿大癌症协会;We Love You Connie基金会;病童医院Garron家庭癌症中心;病童医院临床医生培训计划;通过妇女儿童健康研究所的Ben Stelter基金会;Jeffrey Brock癌症遗传学研究奖学金;Garron家庭癌症中心研究奖学金/丰业银行临床科学家奖学金;Atrium/CMCC及Hold'em for Life肿瘤学奖学金;东京儿童癌症研究组金丝带网络奖学金。

实验方法

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