使用超灵敏ctDNA检测追踪早期乳腺癌结构变异预测新辅助治疗后复发：多中心ALIENOR试验

背景：识别新辅助化疗（NAC）后高复发风险的乳腺癌患者是临床上一个高度未满足的需求。多中心ALIENOR研究旨在通过超敏ctDNA检测，在NAC后的随访期间识别分子残留病（MRD）患者。患者与方法：将NAC后肿瘤未达到病理学完全缓解的患者纳入为期5年的液体活检监测计划。主要目标是评估辅助随访期间检测到或未检测到循环肿瘤DNA（ctDNA）患者的无复发生存期（RFI）。对原发肿瘤样本进行全基因组测序，并使用个性化多重数字PCR检测追踪ctDNA样本中的结构变异（SVs）。结果：83例患者成功完成SV个性化指纹设计（473份血浆样本）。自手术日期的中位随访时间为60.6个月（范围7.2-66.3个月），观察到27例临床复发（32.5%）。34例患者检测到ctDNA，其中44.1%（34例中的15例）在最早阳性样本中的ctDNA处于超敏范围（<100 ppm）。ctDNA检测阳性患者的RFI更短[风险比（HR）29.2，95%置信区间（CI）6.9-124.0，P < 0.0001]。多变量分析中，ctDNA是临床复发最重要的预后因素（HR 69.7，95% CI 13.3-365.1，P < 0.0001）。从ctDNA检测到临床复发的中位提前期：整体队列为13.9个月（范围0.3-60.6），雌激素受体阳性/人表皮生长因子受体2（HER2）阴性亚型为20.9个月（范围5.5-60.6），HER2阳性亚型为14.2个月（范围3.4-34.4），三阴性亚型为4.3个月（范围0.3-19.0）。27例出现局部或远处复发的患者中，25例检测到ctDNA（敏感性92.6%）。34例ctDNA阳性患者中，9例在末次随访时未复发：6例仅在辅助治疗前初始时间点阳性，1例多次样本阳性但末次随访时未复发，2例在末次访视时阳性。术后血浆样本阴性患者的5年RFI为72.6%（95% CI 60.1%至81.6%）。结论：本研究支持超敏ctDNA检测在高危早期乳腺癌纵向监测中的临床有效性。超敏范围内的ctDNA检测凸显了高灵敏度检测对MRD监测的重要性。