重组酶制备与活性验证
制备并验证重组人前组织蛋白酶B和L的纯度与酶活性。
在HEK293-EBNA细胞中表达重组proCTSB和proCTSL,经纯化后通过SDS-PAGE和荧光底物活性实验确认纯度及pH 4.5条件下的活性。
Recombinant cathepsins B and L promote α-synuclein clearance and restore lysosomal function in human and murine models with α-synuclein pathology
包含体外酶活性、细胞模型、iPSC神经元、离体脑片、原代神经元及Ctsd敲除小鼠体内实验,并进行功能与机制验证。
H4神经胶质瘤细胞系 PD患者iPSC来源多巴胺能神经元(SNCA A53T突变) Thy1-SNCA转基因小鼠原代皮层神经元及器官型脑片 Ctsd敲除小鼠
H4细胞中rHsCTSB/rHsCTSL处理浓度20 µg/mL,处理24-72小时 DA-iPSn中rHsCTSB/rHsCTSL处理浓度10 µg/mL,处理21-25天 Ctsd敲除小鼠颅内注射100 µg重组酶(P1和P19),P23处死 Bafilomycin处理抑制溶酶体酸化,验证SNCA降解依赖溶酶体功能 Ctsd敲除小鼠颅内注射100 µg重组酶(P1和P19),P23处死
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备并验证重组人前组织蛋白酶B和L的纯度与酶活性。
在HEK293-EBNA细胞中表达重组proCTSB和proCTSL,经纯化后通过SDS-PAGE和荧光底物活性实验确认纯度及pH 4.5条件下的活性。
验证重组酶能否被细胞摄取、成熟并定位于溶酶体。
在CTSB或CTSL敲除的H4细胞中,用rHsCTSB/rHsCTSL处理不同时间,通过Western blot检测酶原、单链和重链形式,并通过免疫荧光观察与LAMP2共定位,同时测溶酶体活性。
验证重组酶对单体及纤维状SNCA的直接降解能力。
将重组SNCA单体或纤维与rHsCTSB/rHsCTSL单独或联合在pH 4.5缓冲液中孵育,通过SDS-PAGE和CBB染色观察降解情况。
检测重组酶在SNCA过表达细胞中是否能减少不溶性SNCA。
使用四环素调控的H4神经胶质瘤细胞(SNCA过表达),用rHsCTSB/rHsCTSL处理不同时间,通过顺序提取分离Triton可溶和不可溶组分,Western blot分析SNCA水平。
在PD患者来源的多巴胺能神经元中验证重组酶对SNCA病理构象的清除作用。
将SNCA A53T突变及同源校正的iPSC分化为多巴胺能神经元,用rHsCTSB/rHsCTSL处理21-25天,通过免疫荧光、Western blot及ELISA检测不同SNCA构象和聚集水平。
在PD小鼠模型中验证重组酶对SNCA病理及神经毒性的影响。
制备Thy1-SNCA转基因小鼠的器官型脑片和原代皮层神经元,用rHsCTSB/rHsCTSL处理,通过免疫荧光、ELISA、LDH及SIM分析检测SNCA病理、细胞毒性和突触蛋白分布。
在Ctsd敲除小鼠中验证颅内注射重组酶的SNCA清除效果。
对Ctsd KO小鼠在P1和P19进行颅内注射rHsCTSB或rHsCTSL,P23处死,通过Western blot和免疫荧光分析脑内SNCA水平和聚集体变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Life Technologies | 41965 |
| OptiMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 31985070 | |
| mTeSR1培养基 | Stemcell | 85850 | |
| mTeSR Plus培养基 | Stemcell | 100-0276 | |
| Neurobasal培养基 | Thermo Fisher Scientific | 21103049 | |
| NeuroCult SM1神经元添加剂 | Stemcell | 05711 | |
| 基质胶 | Corning | 354234 | |
| 多聚-D-赖氨酸 | Merck | P1149 | |
| 层粘连蛋白 | Merck | 11243217001 | |
| 遗传霉素 | Thermo Fisher Scientific | 10121035 | |
| 潮霉素 | Thermo Fisher Scientific | 10687010 | |
| 青霉素/链霉素 | Sigma | P0781 | |
| 胎牛血清 | PAN-Biotech | P30-3602 | |
| Neurobasal A培养基 | Gibco | 12349-015 | |
| B27添加剂 | Gibco | 17504-044 | |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | 35050-061 | |
| HEPES | Gibco | 15630-080 | |
| D-葡萄糖 | Sigma | G8769 | |
| 木瓜蛋白酶 | Worthington | LK003176 | |
| 分散酶II | Roche | 04942078001 | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Worthington | LS0002139 | |
| Hank's平衡盐溶液 | ThermoFisher | 14175095 | |
| 药物处理 | 巴佛洛霉素A1 | -- | -- |
| 亮肽素 | -- | -- | |
| 重组人前组织蛋白酶B | -- | -- | |
| 重组人前组织蛋白酶L | -- | -- | |
| 活性检测 | CTSB底物 | Biorad | #ICT938 |
| CTSL底物 | BioRad | #ICT942 | |
| PFB-FDGluc葡萄糖脑苷脂酶底物 | Thermo Fisher Scientific | P11947 | |
| 4-甲基伞形酮-β-D-吡喃葡萄糖苷 | Merck Millipore | #M3633 | |
| 细胞毒性检测 | Pierce LDH细胞毒性检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88953 |
| 蛋白提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche Diagnostics GmbH | 4906837001 |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche Diagnostics GmbH | 4906837001 | |
| 蛋白检测 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPFL00010 |
| 考马斯亮蓝染色 | -- | -- | |
| ELISA | SNCA聚集体ELISA试剂盒 | BioLegend | 449407 |
| 总人SNCA ELISA试剂盒 | BioLegend | 448607 | |
| 免疫荧光 | DAPI封片剂 | SouthernBiotech | 0100-20 |
| DAPI | Sigma | D8417 | |
| ProLong™ Gold抗淬灭剂 | -- | -- | |
| 成像 | Odyssey成像系统 | Li-Cor Biosciences | -- |
| Amersham Typhoon生物分子成像仪 | GE Lifesciences | -- | |
| CLARIOstar酶标仪 | BMG Labtech | -- | |
| SpectraMax Gemini酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| 蔡司Elyra 7超分辨显微镜 | Carl Zeiss Microscopy GmbH | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus / Carl Zeiss | -- | |
| 徕卡VT1000S振动切片机 | Leica | -- | |
| 徕卡SM 2000 R滑动切片机 | Leica Microsystems | -- | |
| ImageStudioLite 5.2软件 | Li-Cor Biosciences | -- | |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| FIJI软件 | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8软件 | GraphPad Software, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 重组酶制备 | HEK293-EBNA细胞培养条件、转染试剂(PEI)浓度、筛选抗生素浓度(G-418和嘌呤霉素)、纯化柱和缓冲液 阅读提示:Methods: Cathepsin B and L cloning, Recombinant CTSB and CTSL production and purification |
| H4细胞处理 | H4细胞系(SNCA过表达tet-off),处理浓度20 µg/mL,处理时间24-72小时,Bafilomycin浓度200 nM 阅读提示:Methods: H4 cell culture; Results: Figure 2 legend |
| iPSC分化与处理 | iPSC来源DA神经元分化方案、处理浓度10 µg/mL、处理时间21-25天、培养基及添加剂 阅读提示:Methods: iPSC culture and neuronal differentiation; Results: Figure 3 legend |
| Thy1-SNCA离体脑片与原代神经元 | 小鼠品系、年龄(P10或P0/P1)、切片厚度、处理浓度20 µg/mL、处理时间(脑片14天,神经元5天) 阅读提示:Methods: Generation of organotypic brain slices, Primary neuronal culture; Results: Figure 5 legend |
| Ctsd KO小鼠体内实验 | 基因型、注射时间(P1和P19)、注射剂量100 µg/10 µL、注射部位(右半球P1,左半球P19)、处死时间P23 阅读提示:Methods: Ctsd knockout animals; Results: Figure 6 legend |