检测MyoD在正常角膜和角膜细胞中的表达
确认MyoD在角膜中的基础表达情况。
通过RT-PCR、Western blot和免疫荧光检测人角膜上皮、基质和内皮细胞及组织切片中MyoD的表达。
Myogenic Differentiation (MyoD) Gene Expression in Cornea and Role in Corneal Myofibroblast Dedifferentiation
包含体内兔模型、人供体角膜样本、体外细胞培养及分子检测,并进行了功能验证(shRNA沉默)和机制探索。
新西兰白兔角膜纤维化模型 人供体角膜(非纤维化和纤维化) 人角膜基质成纤维细胞(CSFs)及角膜肌成纤维细胞(CMFs)体外模型
MyoD在非纤维化和纤维化人及兔角膜中的表达差异 MyoD shRNA沉默对CMFs形态和αSMA表达的影响 MyoD shRNA沉默对促纤维化基因(FN、Col-I、Col-IV)mRNA水平的影响 MyoD shRNA沉默对中间丝(波形蛋白、结蛋白)和增殖标志物(Ki67)的影响 MyoD shRNA递送对兔角膜瘢痕形成的影响(Fantes评分)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认MyoD在角膜中的基础表达情况。
通过RT-PCR、Western blot和免疫荧光检测人角膜上皮、基质和内皮细胞及组织切片中MyoD的表达。
探究MyoD是否在角膜纤维化中表达上调并共表达。
对碱烧伤诱导的兔纤维化角膜和患者纤维化角膜进行MyoD和αSMA的免疫荧光双标,并定量阳性细胞数。
在体外验证MyoD在TGFβ1诱导的肌成纤维细胞转分化过程中的表达。
用TGFβ1(5 ng/mL)处理CSFs 72小时,通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测αSMA和MyoD表达及时间变化。
验证MyoD沉默是否导致CMFs去分化为成纤维细胞表型。
将MyoD shRNA或scrambled shRNA通过Lipofectamine 3000递送至CMFs(TGFβ1处理),观察细胞形态变化,并检测αSMA、FN、ColI、ColIV、vimentin、desmin、Ki67、FSP1等表达。
评估MyoD shRNA递送是否减少兔角膜瘢痕形成。
碱烧伤后1天,通过PEI2-GNPs递送MyoD shRNA或scrambled shRNA至兔角膜,在1、2、3周通过裂隙灯检查评估角膜混浊(Fantes评分)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | L3000001 |
| RNA分离 | RNeasy微型试剂盒 | QIAGEN | 74126 |
| RNA纯度检测 | NanoDrop微量分光光度计 | -- | -- |
| 逆转录 | AMV逆转录酶 | Promega | -- |
| PCR反应 | GoTaq Flexi缓冲液 | Promega | -- |
| GoTaq热启动聚合酶 | Promega | -- | |
| MyCycler热循环仪 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 实时定量PCR | StepOnePlus实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| SYBR Green qPCR SuperMix | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫荧光 | MyoD抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-377460 |
| αSMA抗体 | Dako | M0851 | |
| Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | 9129T | |
| FSP1抗体 | Abcam | ab-41532 | |
| 波形蛋白多克隆抗体 | Invitrogen | PA1-16759 | |
| 结蛋白多克隆抗体 | Invitrogen | PA5-19063 | |
| 二抗 | Invitrogen | A-11042, | |
| 免疫荧光封片 | VECTASHIELD封片剂 | Vector Laboratories | H1200 |
| 免疫荧光成像 | Leica DM4000B荧光显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| SPOT RT KE数码相机 | SPOT Imaging | -- | |
| Western blot裂解 | RIPA裂解缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 89900 |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Santa Cruz Biotechnology | sc-506202 |
| NuPAGE LDS样品缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot凝胶电泳 | Invitrogen Bis-Tris微型蛋白凝胶 | Invitrogen | -- |
| Western blot转膜 | Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad Laboratories | 17041150 |
| Western blot抗体 | GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47724 |
| Western blot显影 | C-DiGit印迹扫描仪 | LI-COR Biosciences | -- |
| 图像分析 | ImageJ | National Institutes of Health | -- |
| 统计学分析 | Prism 9.2 | GraphPad | -- |
| 动物模型构建 | 丙美卡因 | -- | -- |
| 细胞因子处理 | 转化生长因子β1 | PeproTech | -- |
| 体内基因递送 | PEI2-金纳米颗粒 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞培养和CMF诱导 | CSFs培养代数、血清饥饿时间、TGFβ1浓度(5 ng/mL)和处理时间(72小时) 阅读提示:Methods: Primary Human Corneal Cell Cultures and In Vitro Corneal Fibrosis Model |
| shRNA基因沉默 | shRNA质粒序列、转染试剂(Lipofectamine 3000)用量(2 μg质粒+10 μL试剂)、细胞密度(70%)、孵育条件(20分钟RT,37°C 72小时) 阅读提示:Methods: shRNA Gene Silencing in Human CMFs In Vitro and Rabbit Cornea In Vivo |
| 兔角膜纤维化模型和MyoD shRNA递送 | 碱烧伤条件(0.5-N NaOH,8mm滤纸,30秒)、PEI2-GNPs与DNA比例(N/P=180)、递送时间(碱烧伤后1天) 阅读提示:Methods: In Vivo Rabbit Studies and shRNA Gene Silencing in Rabbit Cornea In Vivo |
| 免疫荧光检测 | 抗体稀释倍数(1:500)、孵育条件(4°C过夜)、二抗稀释倍数(1:1000)和孵育时间(1小时RT) 阅读提示:Methods: Immunofluorescence |
| Western blot检测 | 细胞裂解液(RIPA)、蛋白上样量(60 μg)、凝胶类型(10% Bis-Tris)、转膜条件(25V)、一抗稀释(1:1000)和二抗稀释(1:5000) 阅读提示:Methods: Western Blot |
| 基因表达分析 | qRT-PCR引物序列、反应条件(95°C 10分钟初始变性,40个循环95°C 15秒,60°C 60秒)、内参基因(GAPDH) 阅读提示:Methods: Quantitative Real-Time PCR and Table |
| 体内纤维化评估 | 裂隙灯检查时间点(1、2、3周)、Fantes评分标准和观察者盲法 阅读提示:Methods: In Vivo Rabbit Studies and Results |