基因组融合断点用于儿童急性淋巴细胞白血病DNA可测量残留病监测

可测量残留病（MRD）是儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）的关键预后因素，但目前基于免疫球蛋白/T细胞受体（IG/TCR）重排的金标准方法较为复杂，且对部分患者无法提供信息。致癌融合基因断点（GFBs）作为稳定且具有生物学依据的标志物，可能克服这些局限并改善MRD评估。在一个包含403例已知或疑似融合基因患者的队列中，采用基于捕获的短读长二代测序策略结合开源分析流程，在97%的病例中成功鉴定出患者特异的GFBs。通过qPCR或ddPCR实现的GFB-MRD检测显示出极高的特异性，并能实现更低的检测阈值，从而较基于IG/TCR的检测提高了灵敏度。对104例涉及多种儿童ALL融合亚型患者的纵向监测显示，在非BCR::ABL ALL中两种方法整体一致性优异，同时也揭示了融合亚型相关的差异。GFB-MRD在ETV6::RUNX1重排和MEF2D重排ALL中尤其具有信息价值，因为这两类白血病中IG/TCR追踪常因持续重排或缺乏VDJ重组而效果欠佳或不可靠。总之，这项大规模研究确立了GFBs作为稳健、可临床实施的MRD标志物，并支持将其整合到临床策略中，前提是在选择标志物和解读结果时需充分考虑亚型特异性生物学特征。