揭示肌营养不良症的空间图谱:贝克尔型和杜氏型肌营养不良症的转录组学研究

Unraveling the spatial landscape of dystrophinopathies: a transcriptomic approach to Becker and Duchenne muscular dystrophies

作者信息Laura Gm Heezen, Qirong Mao, Stefan Nicolau, Claudio Novella Rausell, Julia van der Weerd, Jan Kueckelhaus, Rasya Gokul Nath, Jordi Diaz-Manera, Hermien E Kan, Erik H Niks, Maaike van Putten, Annemieke Aartsma-Rus, Kevin M Flanigan, Ahmed Mahfouz, Pietro Spitali
PMID42067897
期刊J Pathol
发布时间2026-07
DOI10.1002/path.70067

摘要

抗肌萎缩蛋白病是由DMD基因的致病性变异引起,导致抗肌萎缩蛋白部分(Becker型)或完全缺失(Duchenne型)。Becker型肌营养不良症(BMD)和Duchenne型肌营养不良症(DMD)的特征是进行性肌肉萎缩、脂肪替代、纤维化和功能丧失。为研究组织病理学变化,我们采用Visium空间转录组学技术对受抗肌萎缩蛋白病影响的患者(n = 8)和健康对照者(n = 4)的骨骼肌活检样本进行了分析。通过使用已发表的单核RNA测序数据,采用反卷积策略估计了样本中细胞类型的比例及其空间定位。我们发现了在活跃病理区域(如脂肪斑块)和细胞类型(如纤维脂肪生成祖细胞)中富集的基因。利用配体-受体对的表达数据,我们揭示了导致纤维化和脂肪生成病变的细胞间通讯。最后,通过对相邻肌肉和脂肪区域的基因表达梯度分析,鉴定了与即将转化为脂肪的肌肉区域相关的基因。© 2026 作者。本刊由John Wiley & Sons Ltd代表大不列颠及爱尔兰病理学会出版。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
CryoStar NX70冷冻切片机Thermo Fisher ScientificNX70
Visium空间基因表达载玻片10x Genomics2000233
ZEISS Axio Scan.Z1载玻片扫描仪Carl Zeiss LTDAxio Scan.Z1
Nikon Eclipse Ti2-E显微镜Nikon InstrumentsTi2-E
Nikon DS-Ri2彩色相机Nikon InstrumentsDS-Ri2
Epredia™ Superfrost™Plus粘附显微镜载玻片Thermo Fisher ScientificJ1820AMNZ
ImmEdge™疏水屏障笔Vector LabsH-4000
Illumina NovaSeq6000测序仪Illumina, Inc.NovaSeq6000
PCR仪----
干冰----
固相可逆固定化磁珠----
盖玻片----