Aβ摄取与内体运输
验证外源性Aβ是否被脑内皮细胞摄取,以及其在细胞内的运输途径。
用Aβ聚集体处理HBMVECs,在不同时间点(0-72小时)用早期内体(Rab5)、晚期内体(Rab7)、溶酶体(Lamp1)标记物共染色,观察Aβ的胞内定位。
Amyloid-β aggregates induce vasculopathy via ferroptosis in brain endothelial cells
包含体外细胞实验、体内动物实验、人脑样本分析、RNA-seq和磷酸化蛋白组学等多层级验证,并进行了功能抑制和机制研究。
人脑微血管内皮细胞(HBMVECs) 5xFAD转基因小鼠 AD患者脑组织样本
Aβ寡聚体制备:Aβ1-42溶于DMSO后稀释至100 mM,37°C孵育24小时 HBMVECs细胞培养条件:传代6-9次,完全经典培养基,37°C、5% CO2 抑制剂处理浓度:Triacsin-C 5 μM,PF-04620110 10 μM,PF-06424439 10 μM,TVB-3664 10 nM,10,12-TDYA 3 μM,UAMC-3203 2 μM,RSL3 200 nM 体内给药方案:6月龄5xFAD小鼠,UAMC-3203 12.5 mg/kg,每日一次,共7天 统计方法:未配对双尾Student's t检验或单因素方差分析(Tukey事后检验),p<0.05显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证外源性Aβ是否被脑内皮细胞摄取,以及其在细胞内的运输途径。
用Aβ聚集体处理HBMVECs,在不同时间点(0-72小时)用早期内体(Rab5)、晚期内体(Rab7)、溶酶体(Lamp1)标记物共染色,观察Aβ的胞内定位。
验证Aβ聚集体是否诱导脑内皮细胞脂滴形成及其是否发生脂质过氧化。
用Aβ处理HBMVECs,用BODIPY染色脂滴,用BODIPY-C11标记脂质过氧化,并检测4-HNE和铁蛋白/GPX4表达。
验证脂肪酸合成相关酶是否参与Aβ诱导的脂滴形成。
用ACSL抑制剂(Triacsin-C)、DGAT1/2抑制剂(PF-04620110、PF-06424439)、FASN抑制剂(TVB-3664)、ACOX抑制剂(10,12-TDYA)处理Aβ刺激的HBMVECs,检测脂滴和Aβ积累的变化。
鉴定Aβ处理下脑内皮细胞中脂质代谢物亚种的变化。
使用LC-MS对Aβ处理后的HBMVECs进行代谢组学分析,比较205种脂质代谢物的变化。
揭示Aβ处理下脑内皮细胞中基因表达和蛋白磷酸化的整体变化。
用Aβ处理HBMVECs,在多个时间点进行RNA-seq和磷酸化蛋白阵列分析。
验证铁死亡是否介导Aβ诱导的脂质过氧化和脂滴形成。
用铁死亡抑制剂UAMC-3203或铁死亡诱导剂RSL3处理Aβ刺激的HBMVECs,检测脂滴形成和溶酶体活性。
验证抑制铁死亡能否减少5xFAD小鼠脑内脂滴和Aβ积累并改善BBB功能。
对6月龄5xFAD小鼠每日注射UAMC-3203(12.5 mg/kg)或PBS,持续7天,然后分析脑内脂滴、Aβ、星形胶质细胞激活、BBB通透性等。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | Triacsin-C | MedChemExpress | HY-N6707 |
| PF-04620110 | Sigma | PZ0207 | |
| PF-06424439 | Sigma | PZ0233 | |
| TVB-3664 | MedChemExpress | HY-120062 | |
| 10,12-二十三碳二炔酸 | MedChemExpress | HY-135425 | |
| 铁死亡抑制 | UAMC-3203 | Selleckchem | S8792 |
| 铁死亡诱导 | RSL3 | MedChemExpress | HY-100218A |
| 细胞培养 | 人脑微血管内皮细胞 | Cell Systems | ACBRI 376 |
| 完全经典培养基 | Cell Systems | 4Z0-500 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 附着因子 | Cell Systems | 4Z0-500 | |
| Aβ制备 | Aβ1-42 | Enzo Life Sciences | ALX-151-002 |
| 溶媒 | 二甲基亚砜 | Sigma | 34869 |
| 细胞处理 | 溶酶体深红染料 | Invitrogen | L12492 |
| 免疫染色 | Rab5抗体 | Cell Signaling | 3547S |
| Rab7抗体 | Cell Signaling | 9367S | |
| Lamp1抗体 | Santa Cruz | sc-20011 | |
| β-淀粉样蛋白抗体 | Abcam; Thermo Fisher Scientific | ab11132; 700254 | |
| 4-HNE抗体 | Abcam | ab46545 | |
| 铁蛋白抗体 | Abcam | ab75973 | |
| GPX4抗体 | Cell Signaling | 59735S | |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab16039 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling | 2118S | |
| 围脂滴蛋白1抗体 | Cell Signaling | 9349S | |
| 围脂滴蛋白2抗体 | Bioss | BS-10780R | |
| 围脂滴蛋白3抗体 | Abcam | ab224344 | |
| GFAP抗体 | Cell Signaling | 12389S | |
| PDGFR-β抗体 | Cell Signaling | 3169S | |
| CD31抗体 | Santa Cruz | sc-376764 | |
| AQP4抗体 | Cell Signaling | 59678S | |
| 脂滴荧光染料488 | Biotium | 70065 | |
| BODIPY 581/591-C11 | Invitrogen | D3861 | |
| 兔IgG-488 | Invitrogen | A32731 | |
| 兔IgG-568 | Invitrogen | A11011 | |
| 兔IgG-647 | Invitrogen | A32733 | |
| 小鼠IgG-488 | Invitrogen | A11001 | |
| 小鼠IgG-568 | Invitrogen | A11004 | |
| 小鼠IgG-647 | Invitrogen | A21235 | |
| 大鼠IgG-647 | Invitrogen | A21247 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Rockland | MB-030-0050 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo | 18611281 | |
| EDTA溶液 | Thermo | 1861274 | |
| Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo | 23225 | |
| 硝酸纤维素膜 | Pall Corporation | 66485 | |
| SuperSignal West Pico PLUS 化学发光底物 | Thermo | 1863096 | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| TapeStation RNA ScreenTape | Agilent Technologies | 5067-5576 | |
| TruSeq链特异性总RNA文库制备试剂盒 | Illumina | 20020599 | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 磷酸化蛋白阵列 | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | 78440 |
| 活体成像 | 甲氧基-X04 | Tocris | 4920 |
| SF44 | SPARK | BP00202 | |
| CD31-647 | IVIM | IVITM-991-2004 | |
| 动物实验 | 卡洛芬 | Sigma | PHR1452 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与Aβ处理 | HBMVECs细胞系、培养条件(培养基、添加物、传代代数)、Aβ寡聚体制备方法(浓度、孵育时间) 阅读提示:Methods 5.2 Cell culture, 5.4 Aβ oligomerization |
| 体外抑制剂处理 | 各抑制剂名称、浓度、处理时间(Triacsin-C、PF-04620110、PF-06424439、TVB-3664、10,12-TDYA、UAMC-3203、RSL3),溶剂和稀释方法 阅读提示:Methods 5.3 Inhibitors treatment assay, Results 2.4, 2.6 |
| 脂滴与脂质过氧化检测 | BODIPY染色浓度、孵育时间,BODIPY-C11使用方法,4-HNE免疫染色条件 阅读提示:Methods 5.6-5.7, Figure legends 1-3 |
| 代谢组学分析 | 细胞处理时间点,LC-MS平台,数据处理软件 阅读提示:Methods 5.5 LC-MS analysis |
| RNA-seq与磷酸化分析 | 处理时间点(1h,4h,12h for RNA-seq; 1h,6h,24h for phospho-array),测序平台,DEG阈值, 磷酸化分析服务商 阅读提示:Methods 5.11-5.13 |
| 动物实验 | 5xFAD小鼠品系、年龄、性别(雄性),UAMC-3203给药剂量(12.5 mg/kg)、给药途径(眼眶后注射)、频率(每日一次)、持续时间(7天),对照组(PBS),样本量 阅读提示:Methods 5.9 Animal experiments, Results 2.7 |
| 免疫组织化学 | 固定方法(4% PFA),切片厚度,通透化条件(Triton X-100浓度和时间),封闭液(5% NGS),一抗和二抗孵育时间及温度 阅读提示:Methods 5.6 Immunohistochemistry |
| 统计方法 | 使用未配对双尾Student's t检验或单因素方差分析(Tukey事后检验),显著性水平p<0.05,数据表示mean±SD 阅读提示:Methods 5.15 Statistics |