共培养筛选转移miRNA
鉴定从巨噬细胞转移至血管平滑肌细胞的候选miRNA。
建立巨噬细胞与VSMCs直接接触共培养体系,通过miRNA测序分析相互作用效应,筛选出miR-146a-5p。
miR-146a-5p mediates atherogenic signalling from immune to vascular cells
包含体外共培养、荧光示踪、基因沉默、功能获得、转录组测序、体内动物模型及人类样本验证,功能与机制验证明确。
小鼠原代骨髓来源巨噬细胞与主动脉来源血管平滑肌细胞共培养体系 ApoE敲除小鼠动脉粥样硬化模型 人颈动脉粥样硬化斑块样本
miR-146a-5p转移需要细胞直接接触和间隙连接蛋白Cx43 miR-146a-5p在VSMCs中靶向Klf4并增强SRF活性 VSMC特异性miR-146a-5p海绵(D146)减少ApoE-/-小鼠斑块形成 人斑块狭窄区域VSMCs中miR-146a-5p水平升高
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定从巨噬细胞转移至血管平滑肌细胞的候选miRNA。
建立巨噬细胞与VSMCs直接接触共培养体系,通过miRNA测序分析相互作用效应,筛选出miR-146a-5p。
确认miR-146a-5p从巨噬细胞向VSMCs的转移及其特异性。
使用RT-qPCR检测共培养后VSMCs中miR-146a-5p水平,并使用荧光标记的miRNA模拟物和传感器验证功能性转移。
确定miR-146a-5p转移是否依赖于直接接触和间隙连接。
进行间接共培养实验,并使用shRNA沉默Cx43,检测miR-146a-5p转移。
研究miR-146a-5p过表达对VSMCs增殖、迁移、收缩性和电生理特性的影响。
通过慢病毒过表达miR-146a-5p,进行生长曲线、划痕迁移、膜片钳、RT-qPCR和Western blot分析。
揭示miR-146a-5p对VSMCs转录组和代谢通路的影响。
进行bulk RNA-seq,差异表达分析,GSEA通路富集,并使用METAFlux算法预测代谢通路。
确认miR-146a-5p直接靶向Klf4并影响SRF活性。
使用TargetScan预测靶基因,Western blot检测KLF4蛋白水平,双荧光素酶报告基因验证直接靶向,SRF报告基因检测活性。
评估人动脉粥样硬化斑块中miR-146a-5p的表达和分布。
将人颈动脉斑块分为远端、中段和狭窄区域,进行免疫组化和原位杂交,分析VSMCs中miR-146a-5p表达。
在ApoE-/-小鼠中验证VSMC特异性抑制miR-146a-5p对动脉粥样硬化发展的影响。
使用VSMC特异性miR-146a-5p海绵(D146)慢病毒,Western diet喂养16周,评估斑块面积和免疫细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Iscove改良Dulbecco培养基 | -- | -- |
| 细胞荧光染色 | 钙黄绿素红橙色 | Life Technologies | C34851 |
| 蓝色钙黄绿素 | Life Technologies | C1429 | |
| miRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX试剂 | Life Technologies | 13778075 |
| miRNA转移检测 | 6-FAM标记的miR-146a-5p双链RNA探针 | Merck | VC30002N |
| 细胞核染色 | DAPI | Life Technologies | D1306 |
| 封片 | ProLong Diamond防淬灭封片剂 | Life Technologies | P36961 |
| 共聚焦显微镜 | Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 动物实验饮食 | Western饮食D12079B | Charles River | D12079B |
| miRNA测序 | SMARTer smRNA-seq试剂盒 | Illumina | -- |
| 测序平台 | NextSeq 500 | Illumina | -- |
| 胆固醇检测 | 菲律宾菌素III | -- | -- |
| 细胞培养插入物 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)膜插入物 | Merck | MCRP12H48 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞共培养 | 共培养时间36小时,细胞数量(Mφ 150,000,VSMC 25,000),培养基类型(Iscove's Modified Dulbecco's Medium) 阅读提示:参见Methods 2.3 Coculture experiments |
| miRNA转移验证 | 荧光miRNA模拟物浓度(200 nM),传感器载体序列,共培养时间(过夜) 阅读提示:参见Methods 2.3 Coculture experiments 和Figure 1 legend |
| 间隙连接机制 | Cx43基因敲低效率(约80%),共培养时间(36小时) 阅读提示:参见Results 3.3 和Figure 2 legend |
| 体内实验 | ApoE-/-小鼠,Western diet喂养16周,病毒粒子注射剂量(1×10^7颗粒,静脉注射3次,隔日一次) 阅读提示:参见Methods 2.1 Animals 和Figure 7 legend |
| 人斑块分析 | 人颈动脉斑块样本来源(动脉内膜切除),标本分割(狭窄、中段、远端),染色方法 阅读提示:参见Methods 2.2 Human samples 和Figure 6 legend |