参与者招募与标本收集
收集急性呼吸道感染门诊患者的呼吸道标本并记录症状
哨点医生收集出现急性呼吸道疾病(新发或加重咳嗽)且在发病7天内的患者标本,并记录疫苗接种信息
Interim 2025/26 LP.8.1 vaccine effectiveness estimates against COVID-19 from the Canadian Sentinel Practitioner Surveillance Network (SPSN): insights into possible impact of influenza and other respiratory virus co-circulation
包含人群队列、临床样本检测、病毒全基因组测序和多层敏感性分析,进行了功能验证和机制探索,评估疫苗有效性与交叉保护。
门诊急性呼吸道感染患者队列(≥12岁) SARS-CoV-2阳性病例与阴性对照(检测阴性设计) 测序病毒谱系(XFG、NB.1.8.1等)
参与者年龄≥12岁,来自不列颠哥伦比亚省、安大略省和魁北克省,标本采集于2025年10月26日至2026年3月7日(第44-09周) 疫苗接种状态基于省级免疫登记记录,定义为2025/26年度LP.8.1疫苗接种≥2周 主要分析排除流感病毒感染的对照,敏感性分析保留流感、RSV和其他病毒 WGS测序成功与失败的定义,以及基于Cq值的病毒载量半定量 调整年龄组、省份和日历时间(双周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集急性呼吸道感染门诊患者的呼吸道标本并记录症状
哨点医生收集出现急性呼吸道疾病(新发或加重咳嗽)且在发病7天内的患者标本,并记录疫苗接种信息
检测SARS-CoV-2和其他呼吸道病毒,以确定病例和对照
省级实验室使用分子检测进行多重呼吸道病毒检测,包括SARS-CoV-2、流感、RSV、季节性冠状病毒等
准确获取2025/26年度LP.8.1疫苗接种信息
从省级免疫登记处提取COVID-19疫苗接种详细信息
计算LP.8.1疫苗对门诊COVID-19的有效性
采用检测阴性设计,计算调整后的比值比,得出VE
评估其他呼吸道病毒感染对VE估计的影响
修改纳入/排除流感、RSV和其他病毒感染的标准,观察VE变化
确定病毒谱系并评估疫苗对变异株的有效性
对SARS-CoV-2病例病毒进行WGS,并分析谱系分布
评估SARS-CoV-2与其他病毒合并感染对VE估计的影响
比较合并感染病例与非合并感染病例的病毒载量(Cq值)和VE
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒检测 | 多重检测 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 参与者纳入 | 年龄≥12岁,来自BC省、安大略省和魁北克省,就诊前7天内发病,标本采集于第44-09周 阅读提示:Methods: Enrolment, specimen collection and testing |
| 疫苗接种状态 | 2025/26年度LP.8.1疫苗接种≥2周,基于PIR记录 阅读提示:Methods: Vaccine status ascertainment |
| 对照定义 | SARS-CoV-2阴性;主要分析排除流感病毒阳性对照 阅读提示:Methods: Vaccine effectiveness estimation |
| 统计调整 | 调整年龄组(12-49, 50-64, ≥65),省份,日历时间(双周) 阅读提示:Methods: Vaccine effectiveness estimation |
| WGS测序 | 测序策略:BC和魁北克对所有病例,安大略限于Cq<30 阅读提示:Methods: Enrolment, specimen collection and testing |