参与者纳入与筛选
确定符合研究条件的ADNI和BioFINDER参与者,确保包括Aβ阴性的CU个体和生物标志物确认的AD患者。
从ADNI和BioFINDER队列中筛选年龄≥50岁、有认知状态评估、Aβ状态评估及至少一次Aβ PET、MMSE或ADAS-cog测量的参与者,并排除Aβ阴性但存在客观认知障碍的参与者。
Estimating the time course of biomarker changes in Alzheimer's disease
研究利用两个大型纵向队列(ADNI,n=1448;BioFINDER,n=2088)的临床和生物标志物数据,构建疾病进展模型,并与多种替代分期方法进行验证比较,包含多层级生物标志物轨迹分析。
ADNI队列(n=1448) BioFINDER队列(n=2088)
Aβ-PET阳性判定标准:ADNI采用18F-florbetapir SUVR>1.11、18F-florbetaben SUVR>1.08、11C-PiB SUVR>1.22;BioFINDER采用18F-flutemetamol SUVR>1.03 Aβ状态判定:CSF Aβ42/Aβ40比值,ADNI中Roche Elecsys切点为<0.0666,2D-UPLC-MS切点为<0.138;BioFINDER-1切点为<0.066,BioFINDER-2切点为<0.080 纳入标准:年龄≥50岁,具有认知状态评估、Aβ状态评估,以及至少一次Aβ PET、MMSE或ADAS-cog测量 疾病进展模型设定:采用半参数多元潜时间模型,包含Aβ PET、MMSE和ADAS-cog,疾病时间定义为预测的Aβ-PET阳性以来的年数 生物标志物轨迹模型:使用稳健分位数混合效应样条模型,自由度0-8,BIC选择最佳模型,归一化基于Aβ阴性CU个体的中位数和95%异常百分位数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定符合研究条件的ADNI和BioFINDER参与者,确保包括Aβ阴性的CU个体和生物标志物确认的AD患者。
从ADNI和BioFINDER队列中筛选年龄≥50岁、有认知状态评估、Aβ状态评估及至少一次Aβ PET、MMSE或ADAS-cog测量的参与者,并排除Aβ阴性但存在客观认知障碍的参与者。
建立连续时间疾病进展模型,预测每个受试者自Aβ-PET阳性以来的时间(疾病时间)。
采用半参数扩展的多元潜时间疾病进展模型,基于Aβ PET、MMSE和ADAS-cog的纵向数据,估计平均轨迹和受试者特定时间偏移。模型包含固定效应(基线状态、Aβ状态)和随机效应(个人时间偏移和截距),疾病时间0锚定为平均Aβ-PET阳性时间。
评估预测疾病时间的构念效度,与未见的生物标志物和认知测量相关,并与替代分期方法比较。
在ADNI和BioFINDER中,计算预测疾病时间与未见的认知量表(如CDR-SB、TMT-B)和生物标志物(如血浆Aβ42/40、CSF p-tau181、tau PET)的Spearman相关性,并与年龄、临床诊断、MMSE、ADAS-cog、Aβ PET、淀粉样蛋白时钟、tau时钟、GRACE和LTJMM等分期方法进行比较,使用二项符号检验。
沿预测的疾病时间估计各生物标志物的中位轨迹,确定异常时间。
使用稳健分位数混合效应样条模型(随机Laplace分布截距)估计每个生物标志物沿预测疾病时间的中位轨迹。自由度从0到8,基于BIC选择最佳模型。轨迹归一化至Aβ阴性CU个体的中位数和95%异常百分位,使用经验案例引导(1000次重采样)计算95%置信区间。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Aβ状态评估 | 罗氏Elecsys免疫测定 | Roche | -- |
| 二维超高效液相色谱-串联质谱 | -- | -- | |
| Aβ-PET成像 | 18F-氟贝他吡 | -- | -- |
| 18F-氟贝他苯 | -- | -- | |
| 11C-匹兹堡化合物B | -- | -- | |
| 18F-氟美他莫 | -- | -- | |
| 血浆生物标志物测量 | cobas e 601系统 | Roche Diagnostics | -- |
| 液相色谱-串联质谱(PrecivityAD2) | -- | -- | |
| Simoa检测 | -- | -- | |
| CSF生物标志物测量 | cobas e 601系统 | Roche Diagnostics | -- |
| UmanDiagnostic AB的ELISA | UmanDiagnostic AB | -- | |
| Meso Scale Discovery平台 | MSD | -- | |
| MicroVue YKL-40 ELISA | -- | -- | |
| CSF p-tau217检测 | Eli Lilly | -- | |
| CSF p-tau231检测 | ADx NeuroSciences | -- | |
| 影像生物标志物 | FreeSurfer | -- | -- |
| tau-PET示踪剂18F-flortaucipir | -- | -- | |
| tau-PET示踪剂18F-RO948 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 参与者纳入 | 纳入标准:年龄≥50岁;认知状态评估;Aβ状态评估;至少一次Aβ PET、MMSE或ADAS-cog测量;排除Aβ阴性但有客观认知障碍者 阅读提示:Methods: Inclusion criteria; Table 1 |
| Aβ状态判定 | CSF Aβ42/Aβ40切点:ADNI Elecsys <0.0666,ADNI 2D-UPLC-MS <0.138,BioFINDER-1 <0.066,BioFINDER-2 <0.080;Aβ-PET切点:ADNI florbetapir 1.11 SUVR, florbetaben 1.08, PiB 1.22;BioFINDER flutemetamol 1.03;矛盾处理规则 阅读提示:Methods: Aβ status |
| 疾病进展模型 | 模型变量:Aβ PET, MMSE, ADAS-cog;样条自由度;结位置;固定效应和随机效应设置;锚定时间;估计方法 阅读提示:Methods: Statistical analysis, Disease progression modelling; Figure 1 |
| 模型验证 | 验证变量:TMT-B, CDR-SB, 逻辑记忆延迟回忆, 生物标志物分组;相关计算方式;比较方法(二项符号检验);共同子集条件 阅读提示:Methods: Model validation; Tables 2 and 3 |
| 生物标志物轨迹 | 生物标志物归一化参照:Aβ阴性CU;异常阈值:95%百分位数;模型:分位数混合效应样条,自由度选择;置信区间:经验引导1000次 阅读提示:Methods: Estimating biomarker trajectories; Figures 3 and 4 |