模型构建与基因型确认
通过CRISPR/Cas9技术引入c.1278insTATC变异,构建部分人源化Hexa基因和Neu3缺失的小鼠模型。
将gRNA、Cas9和DNA模板电穿孔至C57BL/6N受精卵,建立携带Hexa c.1278insTATC的小鼠,并与Neu3缺失小鼠杂交,获得InsTATC Neu3-/-模型。通过PCR和Sanger测序确认基因型。
A novel humanized mouse model exhibits neurobehavioral impairments and recapitulates key neuropathological features of infantile Tay-Sachs disease
包含基因编辑模型构建、酶活性检测、组织学/免疫荧光、行为学、视网膜成像、转录组测序及GSEA等多个独立证据层级,并包含功能与机制验证。
InsTATC Neu3-/-小鼠 VK-IS Neu3-/-对照小鼠 WT(C57BL/6N)小鼠
HexA酶活性:通过MUGS荧光底物法检测,TSD模型皮质和小脑中降低超过10倍,肝脏和肾脏中几乎检测不到。 GM2蓄积:通过免疫荧光染色,在TSD模型大脑皮层、海马和小脑中广泛存在,而对照组无。 生存期:Kaplan-Meier分析显示InsTATC Neu3-/-小鼠中位生存期为167天,比对照显著缩短。 行为学检测:11周龄时转棒试验和旷场试验表现出运动协调和探索行为缺陷,以及焦虑相关行为。 视网膜结构:10周龄时OCT显示内视网膜厚度显著增加(约80 μm vs 58-62 μm),眼底可见点状沉积。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过CRISPR/Cas9技术引入c.1278insTATC变异,构建部分人源化Hexa基因和Neu3缺失的小鼠模型。
将gRNA、Cas9和DNA模板电穿孔至C57BL/6N受精卵,建立携带Hexa c.1278insTATC的小鼠,并与Neu3缺失小鼠杂交,获得InsTATC Neu3-/-模型。通过PCR和Sanger测序确认基因型。
确认人源化变异不影响HexA功能,并验证TSD模型大脑中GM2的蓄积。
使用荧光底物MUGS检测皮质、小脑、肝脏和肾脏中HexA酶活性;通过免疫荧光染色检测大脑切片中GM2蓄积,并用HALO进行定量分析。
评估疾病对生存和运动功能、探索行为及焦虑的影响。
进行Kaplan-Meier生存分析;在11周龄进行转棒和旷场测试,评估运动协调、平衡、运动量、探索及焦虑指标;监测体重和脊柱弯曲,并观察后肢紧握。
评估GM2蓄积引起的星形胶质细胞增生。
通过免疫荧光染色和Western blot检测大脑切片和全小脑裂解液中GFAP表达,比较不同基因型小鼠。
评估浦肯野细胞的存活和形态异常。
使用Calbindin-D28和IP3R1免疫荧光染色检查浦肯野细胞,评估树突和轴突形态;使用Western blot和qPCR检测Calbindin-D28表达;使用神经丝抗体(NF-M,NF-L)检测轴突聚集。
探索视网膜中GM2沉积和结构变化。
在10周龄进行眼底成像和OCT,测量内视网膜厚度;在22周龄进行视网膜切片免疫荧光染色检测GFAP(Müller细胞活化标志)。
在症状前阶段识别早期转录变化。
对6周龄小鼠的小脑和皮质进行批量RNA-seq,并进行GSEA富集分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | C57BL/6N小鼠 | The Centre for Phenogenomics | -- |
| 基因分型 | Qiagen DNAeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | -- |
| DreamTaq聚合酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Qiagen PCR纯化试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 行为学测试 | VersaMax动物活动监测系统 | AccuScan Instruments | -- |
| Rota-Rod NG转棒仪(型号46750) | Ugo Basile | -- | |
| 组织灌注 | 磷酸盐缓冲液(Wisent 311−011 CL) | Wisent | -- |
| 组织固定 | 10%中性缓冲福尔马林 | Sigma-Aldrich | HT501128 |
| 组织包埋 | OCT包埋剂 | Tissue-Tek | -- |
| 组织切片 | 低温恒温器 | Thermo Scientific | -- |
| 视网膜处理 | 25号针头 | BD | -- |
| 蛋白提取 | Halt™蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| MagNA裂解仪 | Roche | -- | |
| 蛋白定量 | BCA测定法 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blot | iBlot 2转印仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| GFAP抗体 | Merck Millipore | MAB360 | |
| Calbindin D-28K抗体 | Proteintech | 14479-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Invitrogen | -- | |
| 商业剥离缓冲液 | Thermo Scientific | 62299 | |
| 荧光成像 | Pannoramic 250 Flash III玻片扫描仪 | 3DHistech | -- |
| Leica Stellaris 5共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 图像分析 | HALO图像分析平台 | Indica Labs | -- |
| Fiji(基于ImageJ) | -- | -- | |
| 免疫荧光 | PAP笔 | Diagnostic Biosystems | -- |
| 0.1% Triton-X 100 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抗GFAP抗体 | Merck Millipore | MAB360 | |
| Calbindin-D28抗体 | Proteintech | -- | |
| Calbindin-D28抗体 | Invitrogen | -- | |
| IP3R1抗体 | Invitrogen | -- | |
| GM2抗体 | Tokyo Chemical Industry | -- | |
| NF-M抗体 | Invitrogen | -- | |
| NF-L抗体 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 488荧光染料 | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 555荧光染料 | Invitrogen | -- | |
| DAPI染色液 | Thermo Fisher | -- | |
| 封片 | ProLong Gold抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher | -- |
| 酶活性测定 | MUGS底物(4-甲基伞形酮基-6-硫代-2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖苷) | Toronto Research Chemicals | -- |
| 2-氨基-2-甲基丙醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Synergy Neo2微孔板读板机 | BioTek | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA质量评估 | Agilent Bioanalyzer 2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| RNA定量 | Qubit RNA HS测定 | Thermo Scientific | -- |
| RNA测序 | Illumina Novaseq S4流动槽 | Illumina | -- |
| 视网膜成像 | Phoenix Micron-5眼底成像系统 | Phoenix | -- |
| RNA测序 | 氧化锆珠管 | OPS Diagnostics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | 小鼠品系为C57BL/6N;基因编辑使用CRISPR/Cas9,需确认Hexa c.1278insTATC和Neu3缺失的基因型;动物饲养条件(12小时光照/黑暗循环)。 阅读提示:见Materials & methods: Animals |
| 酶活性检测 | 组织裂解液用量(5 μg);底物MUGS浓度(3.2 mM);孵育时间(1小时);温度(37°C);荧光激发/发射波长(360/450 nm)。 阅读提示:见Materials & methods: Fluorometric HexA assay |
| 行为学测试 | 年龄:11周龄;转棒加速度:5-40 RPM,时间300秒;旷场时长:20分钟;光照强度:200 lx;旷场大小:41.25×41.25×31.25 cm。 阅读提示:见Materials & methods: Functional tests; Results: 图2D-E |
| 脑组织免疫荧光 | 小鼠年龄:22周;灌注固定:冰PBS,10%福尔马林;切片厚度:20 μm(冷冻)和7 μm(石蜡);GM2抗体稀释度1:250;DAPI染色。 阅读提示:见Materials & methods: Brain histology, Immunofluorescence |
| 视网膜OCT/眼底成像 | 年龄:10周;麻醉:氯胺酮/赛拉嗪(0.01 mL/g);瞳孔扩张:1%托吡卡胺;OCT测量参数:内视网膜厚度(RNFL到IPL),每眼6次测量。 阅读提示:见Materials & methods: Optical coherence tomography and fundoscopy; Results: 图5A-B |
| 转录组分析 | 年龄:6周;组织:小脑和皮质;样本数:每个条件n=3;测序平台:Illumina NovaSeq;比对和差异表达分析软件版本。 阅读提示:见Materials & methods: RNA extraction and sequencing |