ISG15表达分析
评估ISG15在正常和纤维化肝脏中的表达变化。
利用scRNA-seq数据分析小鼠肝脏中ISG15表达,并在小鼠和人类纤维化肝脏样本中通过qPCR、Western blot、免疫荧光和免疫组化验证ISG15表达。
ISG15 deficiency in hepatic stellate cells promotes TGFβ2-induced liver fibrosis by counteracting CREB1 ISGylation
包含体外细胞模型(LX-2、原代人HSC)、体内动物模型(CCl4、BDL、CDAHFD、自发衰老模型)以及人肝样本,并进行了功能验证和机制研究。
LX-2人肝星状细胞系 原代人肝星状细胞 HSC特异性ISG15敲除小鼠 CCl4/BDL诱导肝纤维化小鼠模型 人肝硬化肝组织
ISG15cKO小鼠为Lrat-Cre介导的HSC特异性敲除 CCl4模型为8周CCl4注射,BDL模型为3周胆管结扎,CDAHFD模型为6周饮食;666-15给药剂量为10 mg/kg,腹腔注射,每周两次;AAV尾静脉注射 体外实验中LX-2和原代HSC用siRNA或shRNA敲低ISG15/UBE2L6/USP18,或用CRISPR/Cas9敲除ISG15 关键检测包括羟脯氨酸含量、ALT/AST、Western blot、qPCR、组织染色(H&E、天狼星红、Masson)、免疫染色(αSMA、F4/80、Ly6G)、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告实验、免疫沉淀、SPR 统计学显著阈值* p<0.05,** p<0.01
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ISG15在正常和纤维化肝脏中的表达变化。
利用scRNA-seq数据分析小鼠肝脏中ISG15表达,并在小鼠和人类纤维化肝脏样本中通过qPCR、Western blot、免疫荧光和免疫组化验证ISG15表达。
探究ISG15在HSC中表达下调的机制。
检测干扰素通路分子表达,验证IFN-β对IRF9和ISG15表达的诱导作用,并通过IRF9敲低和荧光素酶报告实验证明IRF9调控ISG15转录。
验证HSC中ISG15缺失对肝纤维化的影响。
构建HSC特异性ISG15敲除小鼠,在不同年龄及CCl4、BDL、CDAHFD模型中评估肝纤维化程度。
确定ISG15对HSC活化、增殖和ECM产生的作用。
在LX-2细胞和原代HSC中使用CRISPR/Cas9敲除ISG15、shRNA敲低UBE2L6或USP18、siRNA敲低ISG15、UBE2L6、USP18,检测活化标志物(αSMA)、ECM蛋白(Col1α1、纤连蛋白、波形蛋白)和增殖。
探索ISG15调节TGFβ2表达的分子机制。
通过蛋白质组学、qPCR、Western blot、ELISA确认TGFβ2上调,并通过荧光素酶报告实验、ChIP、突变分析和蛋白-蛋白相互作用实验确定ISG15通过ISG化修饰CREB1调控其转录活性。
验证ISG15过表达或CREB1抑制剂对肝纤维化的保护作用。
通过AAV尾静脉注射在HSC中过表达ISG15,或用CREB1抑制剂666-15处理CCl4诱导的纤维化小鼠,评估肝纤维化程度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | CREB1抑制剂666-15 | -- | -- |
| 基因过表达 | AAV-GFAP-ISG15 | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 抗体 | 抗αSMA抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | CCl4给药剂量、频率、周期;BDL手术时间;CDAHFD饮食时间;ISG15cKO小鼠的构建方法;AAV尾静脉注射的滴度和体积 阅读提示:Methods, Figure legends |
| 药物处理 | 666-15给药剂量(10 mg/kg)、频率(每周两次)、途径(腹腔注射);给药开始时间 阅读提示:Figure 8B |
| 细胞培养与处理 | LX-2细胞培养条件;siRNA/shRNA转染剂量和时间;IFN-β处理浓度和时间;外源ISG15处理浓度(100 ng/mL) 阅读提示:Methods, Online supplemental materials |
| 分子检测 | ChIP实验所用抗体、细胞数量、固定条件;荧光素酶报告实验所用报告基因载体和共转染质粒;IP/质谱实验所用标签和细胞系 阅读提示:Methods, Figure legends |