细胞系模型验证
确认细胞系中GR和PR的表达情况,为后续实验选择合适的细胞模型。
通过Western blot检测OVCAR5、T47D、T47D A1-2和Ishikawa PR-B细胞中GR、PR和ER的表达,确认OVCAR5、Ishikawa PR-B和T47D A1-2表达GR,T47D表达PR和ER但不表达GR。
Characterization of Isoorientin and Paeoniflorin as Botanical Glucocorticoid Receptor Modulators from White Peony and Chasteberry
包含细胞系(OVCAR5、Ishikawa PR-B、T47D、T47D A1-2、3T3-L1)上的报告基因、qPCR、Western blot、放射性配体结合及计算模拟等多层级验证。
OVCAR5细胞(人卵巢癌细胞系) Ishikawa PR-B细胞(人子宫内膜癌细胞系,稳定表达PR-B) T47D A1-2细胞(人乳腺癌细胞系,工程化表达GR) 3T3-L1小鼠前脂肪细胞
细胞类型:OVCAR5、Ishikawa PR-B、T47D、T47D A1-2、3T3-L1 处理:地塞米松(Dex)、孕酮(P4)、芍药苷(PFL)、异荭草苷(ISO) 剂量:地塞米松30 nM(报告基因)、30 nM(qPCR)、1 µM(分化);孕酮50 nM(Ishikawa)、10 nM(T47D);芍药苷20 µM(报告基因)、20 µM(qPCR)、10-100 µM(脂肪生成);异荭草苷20 µM(报告基因)、20 µM(qPCR)、10-100 µM(脂肪生成) 处理时间:报告基因24小时;qPCR预处理30分钟加Dex处理6小时;分化处理10天 细胞培养条件:无酚红、葡聚糖包被活性炭处理胎牛血清(DCC-FBS)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认细胞系中GR和PR的表达情况,为后续实验选择合适的细胞模型。
通过Western blot检测OVCAR5、T47D、T47D A1-2和Ishikawa PR-B细胞中GR、PR和ER的表达,确认OVCAR5、Ishikawa PR-B和T47D A1-2表达GR,T47D表达PR和ER但不表达GR。
检测芍药苷和异荭草苷对GR介导转录活性的影响。
在OVCAR5和Ishikawa PR-B细胞中转染HRE-Luc和RSV-β-gal,然后用Dex、芍药苷、异荭草苷单独或联合处理24小时,检测荧光素酶活性。
探究在GR存在时,化合物是否影响孕酮(P4)诱导的PR转录活性。
在Ishikawa PR-B和T47D A1-2细胞中,用P4单独或与芍药苷/异荭草苷联合处理,进行HRE-Luc报告基因实验。
排除ER在T47D细胞中参与化合物抑制P4信号的可能性。
在T47D亲本细胞中进行HRE-Luc和ERE-Luc报告基因实验,检测P4或E2单独及与化合物联合的作用。
验证化合物是否影响内源性GR靶基因的表达。
在OVCAR5细胞中,用芍药苷或异荭草苷预处理后加Dex培养6小时,提取RNA,通过RT-qPCR检测GILZ和DUSP1/MKP1的表达。
评估化合物对脂肪细胞分化及脂质积累的影响。
3T3-L1细胞在D0用分化培养基(含IBMX、Dex和胰岛素)诱导3天,然后用维持培养基(含胰岛素)2天,再恢复普通培养基至D10。在分化全程添加芍药苷、异荭草苷或RU486。油红O染色定量脂质积累,Western blot检测FABP4蛋白。
检测化合物是否直接与GR结合。
在竞争性放射性配体结合实验中,用[3H]Dex作为标记配体,评估芍药苷和异荭草苷的竞争性。
分析异荭草苷与GR的结合模式。
使用Autodock进行分子对接,然后进行经典MD模拟(100 ns重复三次),计算MMGBSA结合能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小分子和试剂 | 地塞米松 | Cayman Chemical | 11015 |
| 米非司酮 | Cayman Chemical | 10006317 | |
| 异荭草苷 | Cayman Chemical | 26862 | |
| 异丁基甲基黄嘌呤 | Cayman Chemical | 13347 | |
| 孕酮 | Sigma Aldrich | P0130 | |
| 芍药苷 | Sigma Aldrich | P0038 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma Aldrich | D8418 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| 青霉素/链霉素 | ThermoFisher | 15070063 | |
| DMEM/F12培养基 | Invitrogen | 11039-021 | |
| G418 | Sigma Aldrich | A1720 | |
| 潮霉素B | Sigma Aldrich | H3274 | |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Scientific | 25030081 | |
| 转染 | TransIT LT1转染试剂 | Mirus Bio | -- |
| qPCR | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708891 | |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 1725271 | |
| Western blot | SuperSignal West Femto超敏底物 | ThermoFisher | PI34096 |
| Western blot成像 | Azure 300化学发光Western印迹成像系统 | Azure Biosystems Inc. | -- |
| 脂肪生成实验 | 胰岛素 | -- | -- |
| 油红O | -- | -- | |
| 显微镜 | 尼康Eclipse TE200显微镜 | Nikon | -- |
| AmScope显微镜数码相机 | AmScope | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞名称及来源、培养基类型、血清处理(无酚红、葡聚糖包被活性炭处理胎牛血清DCC-FBS)、抗生素浓度 阅读提示:Materials and Methods 2.2章节 |
| 细胞培养 | 细胞处理前24小时更换无酚红和DCC-FBS的培养基 阅读提示:Materials and Methods 2.2章节 |
| 荧光素酶报告基因实验 | 质粒转染比例(HRE-Luc:RSV-β-gal=2:1)、转染试剂(TransIT LT1)、转染时间(过夜)、处理时间(24小时)、检测方法 阅读提示:Materials and Methods 2.3章节 |
| 荧光素酶报告基因实验 | 地塞米松(Dex)、孕酮(P4)、芍药苷(PFL)、异荭草苷(ISO)的具体浓度 阅读提示:Materials and Methods 2.3章节和Results 3.1、3.2、3.3 |
| qPCR | 细胞数、培养时间、处理条件(PFL/ISO预处理30分钟,Dex 6小时)、RNA提取方法、引物序列 阅读提示:Materials and Methods 2.4章节和Supplementary Table S1 |
| Western blot | 细胞处理(24小时)、裂解缓冲液、蛋白量(30 µg)、一抗浓度和来源 阅读提示:Materials and Methods 2.5章节和Supplementary Table S2 |
| 3T3-L1分化 | 分化培养基配方(IBMX、Dex、胰岛素)、处理时间、油红O染色步骤、图像采集 阅读提示:Materials and Methods 2.6和2.7章节、Results 3.5 |
| 放射性配体结合实验 | 受试物浓度(最高1.0×10^-4 M)、[3H]Dex初始浓度(1.5 nM)、非特异性结合定义(10 µM triamcinolone) 阅读提示:Materials and Methods 2.8章节 |
| 计算机模拟 | 晶体结构(PDB 3H52)、分子对接参数(遗传算法运行30次,种群大小150,能量评估2500万次) 阅读提示:Materials and Methods 2.9章节 |