临床表型鉴定与遗传分析
鉴定两个家族中E型短指畸形的临床特征及遗传原因。
收集家族1和家族2受累个体的临床资料、影像学检查和血液生化指标;对家族1进行全基因组测序和Sanger测序验证,对家族2进行目标基因panel测序。
A novel brachydactyly type E syndrome caused by variants in helix 8 of the PTH1R
包含两个家族临床表型与基因型共分离分析、细胞表面表达及cAMP信号检测、人源化小鼠体内模型及微CT骨参数分析,涉及体外与体内多个证据层级并包含功能验证。
HEK293来源的Gs22a细胞(稳定表达GloSensor cAMP报告基因) HEK293来源的GBR-24细胞(稳定表达β-arrestin2YFP) 人源化PTH1R小鼠(E469K敲入)
家族1中PTH1R c.1405G>A(p.E469K)与E型短指畸形共分离 家族2中PTH1R c.1393G>A(p.E465K)为新发变异 细胞表面表达检测使用HRP标记抗HA抗体,结果标准化为WT-PTH1R cAMP信号检测使用PTH(1-34)和PTHrP(1-36)刺激,记录AUC并计算EC50和Emax 小鼠实验中E469K变异通过i-GONAD引入人源化PTH1R小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定两个家族中E型短指畸形的临床特征及遗传原因。
收集家族1和家族2受累个体的临床资料、影像学检查和血液生化指标;对家族1进行全基因组测序和Sanger测序验证,对家族2进行目标基因panel测序。
评估E469K和E465K变异对PTH1R细胞表面表达的影响。
在HEK293来源的Gs22a细胞中瞬时转染WT或突变PTH1R(带HA标签),使用HRP标记抗HA抗体检测表面表达,通过化学发光信号定量。
评估变异对基础及配体诱导的cAMP信号的影响。
在Gs22a细胞中瞬时表达WT或突变PTH1R,使用GloSensor系统检测基础cAMP水平,并添加不同浓度的PTH(1-34)或PTHrP(1-36)检测配体刺激的cAMP反应,同时进行washout实验评估信号持久性。
评估H8变异是否影响配体诱导的β-arrestin2招募和受体内化。
在GBR-24细胞(稳定表达β-arrestin2YFP)中瞬时转染WT或突变PTH1R,用TMR标记的PTH(1-34)处理,通过荧光显微镜观察配体受体复合物与β-arrestin2的共定位。
在体内评估E469K变异对骨骼发育的影响。
使用i-GONAD技术将E469K变异引入人源化PTH1R小鼠,通过骨骼染色和微CT分析评估骨矿化和骨微结构参数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | ThermoFisher | -- |
| 细胞表面表达检测 | HRP偶联抗HA抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7392 |
| SuperSignal Pico化学发光底物 | ThermoFisher | 37070 | |
| cAMP信号检测 | 无CO2培养基 | ThermoFisher | 18045088 |
| D-荧光素 | Biotium | 10101 | |
| PTH(1-34)肽 | -- | -- | |
| PTHrP(1-36)肽 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | A8412 | |
| 荧光显微镜分析 | TMR标记的PTH(1-34) | -- | -- |
| 含DAPI的Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | H1500 | |
| 动物实验(基因编辑) | Cas9蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| 快绿染料 | IDT | -- | |
| crRNA | IDT | -- | |
| tracrRNA | IDT | -- | |
| 单链DNA修复模板 | IDT | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 遗传分析 | 突变位点:PTH1R c.1405G>A(p.E469K)和c.1393G>A(p.E465K);测序方法:全基因组、Sanger和panel;参考基因组版本:hg19或hg38 阅读提示:遗传分析部分,图2A |
| 细胞表面表达检测 | 细胞系:Gs22a;质粒DNA量:100 ng/孔;转染试剂:Lipofectamine 2000;抗体:HRP-抗HA,1 μg/mL;检测时间:转染后48小时;标准化:WT-PTH1R为100% 阅读提示:Materials and methods: Cell surface receptor expression in HEK293-derived Gs22a cells |
| cAMP信号检测 | 细胞系:Gs22a;配体:PTH(1-34)和PTHrP(1-36);浓度范围:未明确说明;GloSensor底物:d-luciferin 0.5 mM;检测时间:基础14分钟,刺激后30-90分钟;washout实验时间:90分钟 阅读提示:Materials and methods: GloSensor assays of cAMP signaling |
| β-arrestin招募实验 | 细胞系:GBR-24;配体:PTH(1-34)TMR 10 nM;处理时间:30分钟;成像:荧光显微镜 阅读提示:Materials and methods: Fluorescence microscopy analysis of PTH TMR analog binding and β-arrestin2YFP recruitment |
| 动物实验 | 小鼠品系:人源化PTH1R(C57BL6/CD1混合);基因编辑技术:i-GONAD,CRISPR-Cas9;分析:骨骼染色和微CT;股骨长度等参数 阅读提示:Materials and methods: Generation of E469K-PTH1R mice |